[BACK]Return to imach.c CVS log [TXT] [DIR] Up to [Local Repository] / imach / src

Diff for /imach/src/imach.c between versions 1.41 and 1.42

version 1.41, 2002/05/07 15:53:01 version 1.42, 2002/05/21 18:44:41
Line 56 Line 56
 #include <unistd.h>  #include <unistd.h>
   
 #define MAXLINE 256  #define MAXLINE 256
 #define GNUPLOTPROGRAM "wgnuplot"  #define GNUPLOTPROGRAM "gnuplot"
 /*#define GNUPLOTPROGRAM "..\\gp37mgw\\wgnuplot"*/  /*#define GNUPLOTPROGRAM "..\\gp37mgw\\wgnuplot"*/
 #define FILENAMELENGTH 80  #define FILENAMELENGTH 80
 /*#define DEBUG*/  /*#define DEBUG*/
Line 1330  void prevalence(int agemin, float agemax Line 1330  void prevalence(int agemin, float agemax
   j=cptcoveff;    j=cptcoveff;
   if (cptcovn<1) {j=1;ncodemax[1]=1;}    if (cptcovn<1) {j=1;ncodemax[1]=1;}
     
  for(k1=1; k1<=j;k1++){    for(k1=1; k1<=j;k1++){
     for(i1=1; i1<=ncodemax[k1];i1++){      for(i1=1; i1<=ncodemax[k1];i1++){
       j1++;        j1++;
         
       for (i=-1; i<=nlstate+ndeath; i++)          for (i=-1; i<=nlstate+ndeath; i++)  
         for (jk=-1; jk<=nlstate+ndeath; jk++)            for (jk=-1; jk<=nlstate+ndeath; jk++)  
           for(m=agemin; m <= agemax+3; m++)            for(m=agemin; m <= agemax+3; m++)
Line 1352  void prevalence(int agemin, float agemax Line 1352  void prevalence(int agemin, float agemax
             if ((k2>=dateprev1) && (k2<=dateprev2)) {              if ((k2>=dateprev1) && (k2<=dateprev2)) {
               if(agev[m][i]==0) agev[m][i]=agemax+1;                if(agev[m][i]==0) agev[m][i]=agemax+1;
               if(agev[m][i]==1) agev[m][i]=agemax+2;                if(agev[m][i]==1) agev[m][i]=agemax+2;
               if (m<lastpass)                if (m<lastpass) {
                 if (calagedate>0) freq[s[m][i]][s[m+1][i]][(int)(agev[m][i]+1-((int)calagedate %12)/12.)] += weight[i];                  if (calagedate>0)
               else                    freq[s[m][i]][s[m+1][i]][(int)(agev[m][i]+1-((int)calagedate %12)/12.)] += weight[i];
                freq[s[m][i]][s[m+1][i]][(int)agev[m][i]] += weight[i];                  else
                freq[s[m][i]][s[m+1][i]][(int)(agemax+3)] += weight[i];                    freq[s[m][i]][s[m+1][i]][(int)agev[m][i]] += weight[i];
                   freq[s[m][i]][s[m+1][i]][(int)(agemax+3)] += weight[i];
                 }
             }              }
           }            }
         }          }
       }        }
         for(i=(int)agemin; i <= (int)agemax+3; i++){        for(i=(int)agemin; i <= (int)agemax+3; i++){
           for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){          for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){
             for(m=-1, pp[jk]=0; m <=nlstate+ndeath ; m++)            for(m=-1, pp[jk]=0; m <=nlstate+ndeath ; m++)
               pp[jk] += freq[jk][m][i];              pp[jk] += freq[jk][m][i];
           }          }
           for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){          for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){
             for(m=-1, pos=0; m <=0 ; m++)            for(m=-1, pos=0; m <=0 ; m++)
             pos += freq[jk][m][i];              pos += freq[jk][m][i];
         }          }
                 
          for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){          for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){
            for(m=0, pp[jk]=0; m <=nlstate+ndeath; m++)            for(m=0, pp[jk]=0; m <=nlstate+ndeath; m++)
              pp[jk] += freq[jk][m][i];              pp[jk] += freq[jk][m][i];
          }          }
                   
          for(jk=1,pos=0; jk <=nlstate ; jk++) pos += pp[jk];          for(jk=1,pos=0; jk <=nlstate ; jk++) pos += pp[jk];
          
          for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){                    for(jk=1; jk <=nlstate ; jk++){    
            if( i <= (int) agemax){            if( i <= (int) agemax){
              if(pos>=1.e-5){              if(pos>=1.e-5){
                probs[i][jk][j1]= pp[jk]/pos;                probs[i][jk][j1]= pp[jk]/pos;
              }              }
            }            }
          }  
            
         }          }
          
         }
     }      }
   }    }
   
Line 1663  void evsij(char fileres[], double ***eij Line 1665  void evsij(char fileres[], double ***eij
       for(j=1;j<=nlstate*2;j++)        for(j=1;j<=nlstate*2;j++)
         varhe[i][j][(int)age] =0.;          varhe[i][j][(int)age] =0.;
   
        printf("%d||",(int)age);fflush(stdout);
     for(h=0;h<=nhstepm-1;h++){      for(h=0;h<=nhstepm-1;h++){
       for(k=0;k<=nhstepm-1;k++){        for(k=0;k<=nhstepm-1;k++){
         matprod2(dnewm,trgradg[h],1,nlstate*2,1,npar,1,npar,matcov);          matprod2(dnewm,trgradg[h],1,nlstate*2,1,npar,1,npar,matcov);
Line 2114  fprintf(fichtm," <li>Graphs</li><p>"); Line 2117  fprintf(fichtm," <li>Graphs</li><p>");
            fprintf(fichtm," V%d=%d ",Tvaraff[cpt],nbcode[Tvaraff[cpt]][codtab[jj1][cpt]]);             fprintf(fichtm," V%d=%d ",Tvaraff[cpt],nbcode[Tvaraff[cpt]][codtab[jj1][cpt]]);
          fprintf(fichtm," ************\n<hr size=\"2\" color=\"#EC5E5E\">");           fprintf(fichtm," ************\n<hr size=\"2\" color=\"#EC5E5E\">");
        }         }
        fprintf(fichtm,"<br>- Probabilities: pe%s%d.gif<br>         fprintf(fichtm,"<br>- Probabilities: pe%s%d.png<br>
 <img src=\"pe%s%d.gif\">",strtok(optionfile, "."),jj1,strtok(optionfile, "."),jj1);      <img src=\"pe%s%d.png\">",strtok(optionfile, "."),jj1,strtok(optionfile, "."),jj1);    
        for(cpt=1; cpt<nlstate;cpt++){         for(cpt=1; cpt<nlstate;cpt++){
          fprintf(fichtm,"<br>- Prevalence of disability : p%s%d%d.gif<br>           fprintf(fichtm,"<br>- Prevalence of disability : p%s%d%d.png<br>
 <img src=\"p%s%d%d.gif\">",strtok(optionfile, "."),cpt,jj1,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1);  <img src=\"p%s%d%d.png\">",strtok(optionfile, "."),cpt,jj1,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1);
        }         }
     for(cpt=1; cpt<=nlstate;cpt++) {      for(cpt=1; cpt<=nlstate;cpt++) {
        fprintf(fichtm,"<br>- Observed and stationary prevalence (with confident         fprintf(fichtm,"<br>- Observed and stationary prevalence (with confident
 interval) in state (%d): v%s%d%d.gif <br>  interval) in state (%d): v%s%d%d.png <br>
 <img src=\"v%s%d%d.gif\">",cpt,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1);    <img src=\"v%s%d%d.png\">",cpt,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1);  
      }       }
      for(cpt=1; cpt<=nlstate;cpt++) {       for(cpt=1; cpt<=nlstate;cpt++) {
         fprintf(fichtm,"\n<br>- Health life expectancies by age and initial health state (%d): exp%s%d%d.gif <br>          fprintf(fichtm,"\n<br>- Health life expectancies by age and initial health state (%d): exp%s%d%d.png <br>
 <img src=\"exp%s%d%d.gif\">",cpt,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1);  <img src=\"exp%s%d%d.png\">",cpt,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1,strtok(optionfile, "."),cpt,jj1);
      }       }
      fprintf(fichtm,"\n<br>- Total life expectancy by age and       fprintf(fichtm,"\n<br>- Total life expectancy by age and
 health expectancies in states (1) and (2): e%s%d.gif<br>  health expectancies in states (1) and (2): e%s%d.png<br>
 <img src=\"e%s%d.gif\">",strtok(optionfile, "."),jj1,strtok(optionfile, "."),jj1);  <img src=\"e%s%d.png\">",strtok(optionfile, "."),jj1,strtok(optionfile, "."),jj1);
 fprintf(fichtm,"\n</body>");  fprintf(fichtm,"\n</body>");
    }     }
    }     }
Line 2159  m=pow(2,cptcoveff); Line 2162  m=pow(2,cptcoveff);
    for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {     for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {
   
 #ifdef windows  #ifdef windows
     fprintf(ficgp,"set xlabel \"Age\" \nset ylabel \"Probability\" \nset ter gif small size 400,300\nplot [%.f:%.f] \"vpl%s\" every :::%d::%d u 1:2 \"\%%lf",ageminpar,fage,fileres,k1-1,k1-1);       fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.png\" \n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);
        fprintf(ficgp,"set xlabel \"Age\" \nset ylabel \"Probability\" \nset ter png small\nset size 0.65,0.65\nplot [%.f:%.f] \"vpl%s\" every :::%d::%d u 1:2 \"\%%lf",ageminpar,fage,fileres,k1-1,k1-1);
 #endif  #endif
 #ifdef unix  #ifdef unix
   fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.png\" \n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);
 fprintf(ficgp,"set xlabel \"Age\" \nset ylabel \"Probability\" \nplot [%.f:%.f] \"vpl%s\" u 1:2 \"\%%lf",ageminpar,fage,fileres);  fprintf(ficgp,"set xlabel \"Age\" \nset ylabel \"Probability\" \nplot [%.f:%.f] \"vpl%s\" u 1:2 \"\%%lf",ageminpar,fage,fileres);
 #endif  #endif
   
Line 2181  for (i=1; i<= nlstate ; i ++) { Line 2186  for (i=1; i<= nlstate ; i ++) {
 }    }  
      fprintf(ficgp,"\" t\"\" w l 1,\"p%s\" every :::%d::%d u 1:($%d) t\"Observed prevalence \" w l 2",fileres,k1-1,k1-1,2+4*(cpt-1));       fprintf(ficgp,"\" t\"\" w l 1,\"p%s\" every :::%d::%d u 1:($%d) t\"Observed prevalence \" w l 2",fileres,k1-1,k1-1,2+4*(cpt-1));
 #ifdef unix  #ifdef unix
 fprintf(ficgp,"\nset ter gif small size 400,300");  fprintf(ficgp,"\nset ter png small\nset size 0.65,0.65\n");
 #endif  #endif
 fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.gif\" \nreplot\n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);  
    }     }
   }    }
   /*2 eme*/    /*2 eme*/
   
   for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {    for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {
     fprintf(ficgp,"set ylabel \"Years\" \nset ter gif small size 400,300\nplot [%.f:%.f] ",ageminpar,fage);      fprintf(ficgp,"\nset out \"e%s%d.png\" \n\n",strtok(optionfile, "."),k1);
       fprintf(ficgp,"set ylabel \"Years\" \nset ter png small\nset size 0.65,0.65\nplot [%.f:%.f] ",ageminpar,fage);
         
     for (i=1; i<= nlstate+1 ; i ++) {      for (i=1; i<= nlstate+1 ; i ++) {
       k=2*i;        k=2*i;
Line 2214  fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.gif\" Line 2219  fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.gif\"
       if (i== (nlstate+1)) fprintf(ficgp,"\" t\"\" w l 0");        if (i== (nlstate+1)) fprintf(ficgp,"\" t\"\" w l 0");
       else fprintf(ficgp,"\" t\"\" w l 0,");        else fprintf(ficgp,"\" t\"\" w l 0,");
     }      }
     fprintf(ficgp,"\nset out \"e%s%d.gif\" \nreplot\n\n",strtok(optionfile, "."),k1);  
   }    }
     
   /*3eme*/    /*3eme*/
Line 2222  fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.gif\" Line 2226  fprintf(ficgp,"\nset out \"v%s%d%d.gif\"
   for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {    for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {
     for (cpt=1; cpt<= nlstate ; cpt ++) {      for (cpt=1; cpt<= nlstate ; cpt ++) {
       k=2+nlstate*(2*cpt-2);        k=2+nlstate*(2*cpt-2);
       fprintf(ficgp,"set ter gif small size 400,300\nplot [%.f:%.f] \"e%s\" every :::%d::%d u 1:%d t \"e%d1\" w l",ageminpar,fage,fileres,k1-1,k1-1,k,cpt);        fprintf(ficgp,"\nset out \"exp%s%d%d.png\" \n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);
         fprintf(ficgp,"set ter png small\nset size 0.65,0.65\nplot [%.f:%.f] \"e%s\" every :::%d::%d u 1:%d t \"e%d1\" w l",ageminpar,fage,fileres,k1-1,k1-1,k,cpt);
       /*fprintf(ficgp,",\"e%s\" every :::%d::%d u 1:($%d-2*$%d) \"\%%lf ",fileres,k1-1,k1-1,k,k+1);        /*fprintf(ficgp,",\"e%s\" every :::%d::%d u 1:($%d-2*$%d) \"\%%lf ",fileres,k1-1,k1-1,k,k+1);
  for (i=1; i<= nlstate*2 ; i ++) fprintf(ficgp,"\%%lf (\%%lf) ");   for (i=1; i<= nlstate*2 ; i ++) fprintf(ficgp,"\%%lf (\%%lf) ");
 fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt);  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt);
Line 2235  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt); Line 2240  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt);
         fprintf(ficgp," ,\"e%s\" every :::%d::%d u 1:%d t \"e%d%d\" w l",fileres,k1-1,k1-1,k+2*i,cpt,i+1);          fprintf(ficgp," ,\"e%s\" every :::%d::%d u 1:%d t \"e%d%d\" w l",fileres,k1-1,k1-1,k+2*i,cpt,i+1);
   
       }        }
       fprintf(ficgp,"\nset out \"exp%s%d%d.gif\" \nreplot\n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);  
     }  
     }      }
     }
     
   /* CV preval stat */    /* CV preval stat */
     for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {      for (k1=1; k1<= m ; k1 ++) {
     for (cpt=1; cpt<nlstate ; cpt ++) {      for (cpt=1; cpt<nlstate ; cpt ++) {
       k=3;        k=3;
       fprintf(ficgp,"set xlabel \"Age\" \nset ylabel \"Probability\" \nset ter gif small size 400,300\nplot [%.f:%.f] \"pij%s\" u ($1==%d ? ($3):1/0):($%d/($%d",ageminpar,agemaxpar,fileres,k1,k+cpt+1,k+1);        fprintf(ficgp,"set out \"p%s%d%d.png\" \n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);
         fprintf(ficgp,"set xlabel \"Age\" \nset ylabel \"Probability\" \nset ter png small\nset size 0.65,0.65\nplot [%.f:%.f] \"pij%s\" u ($1==%d ? ($3):1/0):($%d/($%d",ageminpar,agemaxpar,fileres,k1,k+cpt+1,k+1);
   
       for (i=1; i< nlstate ; i ++)        for (i=1; i< nlstate ; i ++)
         fprintf(ficgp,"+$%d",k+i+1);          fprintf(ficgp,"+$%d",k+i+1);
Line 2256  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt); Line 2261  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt);
         fprintf(ficgp,"+$%d",l+i+1);          fprintf(ficgp,"+$%d",l+i+1);
       }        }
       fprintf(ficgp,")) t\"prev(%d,%d)\" w l\n",cpt+1,cpt+1);          fprintf(ficgp,")) t\"prev(%d,%d)\" w l\n",cpt+1,cpt+1);  
       fprintf(ficgp,"set out \"p%s%d%d.gif\" \nreplot\n\n",strtok(optionfile, "."),cpt,k1);  
     }      }
   }      }  
     
Line 2272  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt); Line 2276  fprintf(ficgp,"\" t \"e%d1\" w l",cpt);
         }          }
       }        }
     }      }
     }     }
   
     for(jk=1; jk <=m; jk++) {     for(jk=1; jk <=m; jk++) {
   fprintf(ficgp,"\nset ter gif small size 400,300\nset log y\nplot  [%.f:%.f] ",ageminpar,agemaxpar);       fprintf(ficgp,"\nset out \"pe%s%d.png\" \n\n",strtok(optionfile, "."),jk);
    i=1;       fprintf(ficgp,"\nset ter png small\nset size 0.65,0.65\nset log y\nplot  [%.f:%.f] ",ageminpar,agemaxpar);
    for(k2=1; k2<=nlstate; k2++) {       i=1;
      k3=i;       for(k2=1; k2<=nlstate; k2++) {
      for(k=1; k<=(nlstate+ndeath); k++) {         k3=i;
        if (k != k2){         for(k=1; k<=(nlstate+ndeath); k++) {
         fprintf(ficgp," exp(p%d+p%d*x",i,i+1);           if (k != k2){
 ij=1;             fprintf(ficgp," exp(p%d+p%d*x",i,i+1);
         for(j=3; j <=ncovmodel; j++) {             ij=1;
           if(((j-2)==Tage[ij]) &&(ij <=cptcovage)) {             for(j=3; j <=ncovmodel; j++) {
             fprintf(ficgp,"+p%d*%d*x",i+j-1,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][Tvar[j-2]]]);               if(((j-2)==Tage[ij]) &&(ij <=cptcovage)) {
             ij++;                 fprintf(ficgp,"+p%d*%d*x",i+j-1,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][Tvar[j-2]]]);
           }                 ij++;
           else               }
           fprintf(ficgp,"+p%d*%d",i+j-1,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][j-2]]);               else
         }                 fprintf(ficgp,"+p%d*%d",i+j-1,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][j-2]]);
           fprintf(ficgp,")/(1");             }
                     fprintf(ficgp,")/(1");
         for(k1=1; k1 <=nlstate; k1++){               
           fprintf(ficgp,"+exp(p%d+p%d*x",k3+(k1-1)*ncovmodel,k3+(k1-1)*ncovmodel+1);             for(k1=1; k1 <=nlstate; k1++){  
 ij=1;               fprintf(ficgp,"+exp(p%d+p%d*x",k3+(k1-1)*ncovmodel,k3+(k1-1)*ncovmodel+1);
           for(j=3; j <=ncovmodel; j++){               ij=1;
           if(((j-2)==Tage[ij]) &&(ij <=cptcovage)) {               for(j=3; j <=ncovmodel; j++){
             fprintf(ficgp,"+p%d*%d*x",k3+(k1-1)*ncovmodel+1+j-2,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][Tvar[j-2]]]);                 if(((j-2)==Tage[ij]) &&(ij <=cptcovage)) {
             ij++;                   fprintf(ficgp,"+p%d*%d*x",k3+(k1-1)*ncovmodel+1+j-2,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][Tvar[j-2]]]);
           }                   ij++;
           else                 }
             fprintf(ficgp,"+p%d*%d",k3+(k1-1)*ncovmodel+1+j-2,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][j-2]]);                 else
           }                   fprintf(ficgp,"+p%d*%d",k3+(k1-1)*ncovmodel+1+j-2,nbcode[Tvar[j-2]][codtab[jk][j-2]]);
           fprintf(ficgp,")");               }
         }               fprintf(ficgp,")");
         fprintf(ficgp,") t \"p%d%d\" ", k2,k);             }
         if ((k+k2)!= (nlstate*2+ndeath)) fprintf(ficgp,",");             fprintf(ficgp,") t \"p%d%d\" ", k2,k);
         i=i+ncovmodel;             if ((k+k2)!= (nlstate*2+ndeath)) fprintf(ficgp,",");
              i=i+ncovmodel;
            }
        }         }
      }       }
    }     }
    fprintf(ficgp,"\nset out \"pe%s%d.gif\" \nreplot\n\n",strtok(optionfile, "."),jk);  
    }  
         
   fclose(ficgp);     fclose(ficgp);
 }  /* end gnuplot */  }  /* end gnuplot */
   
   
Line 2651  int main(int argc, char *argv[]) Line 2655  int main(int argc, char *argv[])
   double dateprev1, dateprev2,jproj1,mproj1,anproj1,jproj2,mproj2,anproj2;    double dateprev1, dateprev2,jproj1,mproj1,anproj1,jproj2,mproj2,anproj2;
     
   
   char version[80]="Imach version 0.8a, May 2002, INED-EUROREVES ";    char version[80]="Imach version 0.8d, May 2002, INED-EUROREVES ";
   char *alph[]={"a","a","b","c","d","e"}, str[4];    char *alph[]={"a","a","b","c","d","e"}, str[4];
   
   
Removed from v.1.41  
changed lines
  Added in v.1.42

FreeBSD-CVSweb <freebsd-cvsweb@FreeBSD.org>