]> henry.ined.fr Git - .git/commitdiff
Minor change: clarifying when agemin and agemax are not big master
authorNBrouard <brouard@ined.fr>
Sat, 23 Nov 2024 17:51:12 +0000 (18:51 +0100)
committerNBrouard <brouard@ined.fr>
Sat, 23 Nov 2024 17:51:12 +0000 (18:51 +0100)
When agemin and agemax are not englobing extreme ages of persons in
the sample, there was an error, but not fully documented. These
extreme ages are often errors in the data (which are now
revealed). But if not, you can enlarge the range agemin:agemax.

CMakeLists.txt
src/imach.c
src/version.h

index b30785dde3f9eaa3da5076ae93d1b726e83fb888..b12f763efe2c28cb5f8571e05a4a787899efea8d 100644 (file)
@@ -9,7 +9,7 @@
 CMAKE_MINIMUM_REQUIRED(VERSION 3.13..3.26.3)
 set(PACKAGE_NAME "imach")
 SET(IMACH_VERSION_MAJOR 0)
 CMAKE_MINIMUM_REQUIRED(VERSION 3.13..3.26.3)
 set(PACKAGE_NAME "imach")
 SET(IMACH_VERSION_MAJOR 0)
-SET(IMACH_VERSION_MINOR 99s12)
+SET(IMACH_VERSION_MINOR 99s13)
 SET(IMACH_VERSION_PATCH 0)
 SET(IMACH_VERSION_NOTE "")
 SET(IMACH_VERSION ${IMACH_VERSION_MAJOR}.${IMACH_VERSION_MINOR})
 SET(IMACH_VERSION_PATCH 0)
 SET(IMACH_VERSION_NOTE "")
 SET(IMACH_VERSION ${IMACH_VERSION_MAJOR}.${IMACH_VERSION_MINOR})
index 654bae10000d44fd6d4e5a1859d0af3355253037..ee5b88fc0c44803fd96ddd9b4e283c68bc016f59 100644 (file)
@@ -2770,7 +2770,6 @@ void linmin(double p[], double xi[], int n, double *fret,double (*func)(double [
 #include <float.h> /* for DBL_EPSILON */
 /* #include "machine.h" */
 
 #include <float.h> /* for DBL_EPSILON */
 /* #include "machine.h" */
 
-
 /* extern void minfit(int n, double eps, double tol, double **ab, double q[]); */
 /* extern void minfit(int n, double eps, double tol, double ab[N][N], double q[]); */
 /* control parameters */
 /* extern void minfit(int n, double eps, double tol, double **ab, double q[]); */
 /* extern void minfit(int n, double eps, double tol, double ab[N][N], double q[]); */
 /* control parameters */
@@ -3568,7 +3567,7 @@ TestFconvergence:
      if (l == k)
        goto Convergence;
      /* shift from bottom 2x2 minor */
      if (l == k)
        goto Convergence;
      /* shift from bottom 2x2 minor */
-     /* x = q[l]; y = q[k-l]; g = e[k-1]; h = e[k]; */ /* Error */
+     /* x = q[l]; y = q[k-l]; g = e[k-1]; h = e[k]; */ /* Gegenfurtner Error */
      x = q[l]; y = q[k-1]; g = e[k-1]; h = e[k];
      f = ((y-z)*(y+z) + (g-h)*(g+h)) / (2.0*h*y);
      g = sqrt(f*f+1.0);
      x = q[l]; y = q[k-1]; g = e[k-1]; h = e[k];
      f = ((y-z)*(y+z) + (g-h)*(g+h)) / (2.0*h*y);
      g = sqrt(f*f+1.0);
@@ -3666,7 +3665,7 @@ double praxis(double tol, double macheps, double h0, int _n, int _prin, double *
 
   
   int seed; /* added */
 
   
   int seed; /* added */
-  int biter=0;
+  int biter=0; /* added */
   double r;
   double randbrent( int (*));
   double s, sf;
   double r;
   double randbrent( int (*));
   double s, sf;
@@ -4098,6 +4097,7 @@ mloop:
       }
    }
    for (i=1; i<=n; i++)
       }
    }
    for (i=1; i<=n; i++)
+     /* Transposing v before golub */
      /* for (j=0; j<=i-1; j++) { */
      /* for (j=1; j<=i; j++) { */
      for (j=1; j<=i-1; j++) {
      /* for (j=0; j<=i-1; j++) { */
      /* for (j=1; j<=i; j++) { */
      for (j=1; j<=i-1; j++) {
@@ -4151,6 +4151,7 @@ mloop:
    }
    /* for (i=0; i<n; i++) { */
    double dni; /* added for compatibility with buckhardt but not brent */
    }
    /* for (i=0; i<n; i++) { */
    double dni; /* added for compatibility with buckhardt but not brent */
+   /* Q^TVR=Sigma, v is v^t and d is  sigma:  Computing Sigma^{-2} as Q^TAQ= Sigma^{-2} */
    for (i=1; i<=n; i++) {
      dni=dn*d[i]; /* added for compatibility with buckhardt but not brent */
        if ((dn * d[i]) > large)
    for (i=1; i<=n; i++) {
      dni=dn*d[i]; /* added for compatibility with buckhardt but not brent */
        if ((dn * d[i]) > large)
@@ -7848,7 +7849,7 @@ void prevalence(double ***probs, double agemin, double agemax, int **s, double *
     printf("Prevalence combination of varying and fixed dummies %d\n",j1);
     /* fprintf(ficlog," V%d=%d ",Tvaraff[j1],nbcode[Tvaraff[j1]][codtabm(k,j1)]); */
     fprintf(ficlog,"Prevalence combination of varying and fixed dummies %d\n",j1);
     printf("Prevalence combination of varying and fixed dummies %d\n",j1);
     /* fprintf(ficlog," V%d=%d ",Tvaraff[j1],nbcode[Tvaraff[j1]][codtabm(k,j1)]); */
     fprintf(ficlog,"Prevalence combination of varying and fixed dummies %d\n",j1);
-    
+    int ierroragemin=0;int ierroragemax=0;
     for (i=1; i<=imx; i++) { /* Each individual */
       bool=1;
       /* for(m=firstpass; m<=lastpass; m++){/\* Other selection (we can limit to certain interviews*\/ */
     for (i=1; i<=imx; i++) { /* Each individual */
       bool=1;
       /* for(m=firstpass; m<=lastpass; m++){/\* Other selection (we can limit to certain interviews*\/ */
@@ -7874,9 +7875,13 @@ void prevalence(double ***probs, double agemin, double agemax, int **s, double *
            if ((y2>=dateprev1) && (y2<=dateprev2)) { /* Here is the main selection (fractional years) */
              if(agev[m][i]==0) agev[m][i]=iagemax+1;
              if(agev[m][i]==1) agev[m][i]=iagemax+2;
            if ((y2>=dateprev1) && (y2<=dateprev2)) { /* Here is the main selection (fractional years) */
              if(agev[m][i]==0) agev[m][i]=iagemax+1;
              if(agev[m][i]==1) agev[m][i]=iagemax+2;
-             if((int)agev[m][i] <iagemin-AGEMARGE || (int)agev[m][i] >iagemax+4+AGEMARGE){
-               printf("Error on individual # %d agev[m][i]=%f <%d-%d or > %d+3+%d  m=%d; either change agemin or agemax or fix data\n",i, agev[m][i],iagemin,AGEMARGE, iagemax,AGEMARGE,m); 
-               exit(1);
+             if((int)agev[m][i] <iagemin-AGEMARGE){
+               ierroragemin++;
+               printf("Error on individual # ...%09ld around line %d agev[m][i]=%f <%d-%d=%d  m=%d; decrease 'agemin' or fix data\n",num[i],i, agev[m][i],iagemin,AGEMARGE, iagemin-AGEMARGE,m); 
+             }
+             if((int)agev[m][i] >iagemax+4+AGEMARGE){
+               ierroragemax++;
+               printf("Error on individual # ...%09ld around line %d agev[m][i]=%f > %d+3+%d=%d  m=%d;increase 'agemax' or fix data\n",num[i],i, agev[m][i],iagemax,AGEMARGE, iagemax+AGEMARGE,m); 
              }
              if (s[m][i]>0 && s[m][i]<=nlstate) { 
                /*if(i>4620) printf(" i=%d m=%d s[m][i]=%d (int)agev[m][i]=%d weight[i]=%f prop=%f\n",i,m,s[m][i],(int)agev[m][m],weight[i],prop[s[m][i]][(int)agev[m][i]]);*/
              }
              if (s[m][i]>0 && s[m][i]<=nlstate) { 
                /*if(i>4620) printf(" i=%d m=%d s[m][i]=%d (int)agev[m][i]=%d weight[i]=%f prop=%f\n",i,m,s[m][i],(int)agev[m][m],weight[i],prop[s[m][i]][(int)agev[m][i]]);*/
@@ -7888,6 +7893,13 @@ void prevalence(double ***probs, double agemin, double agemax, int **s, double *
        } /* end bool */
       } /* end wave */
     } /* end individual */
        } /* end bool */
       } /* end wave */
     } /* end individual */
+    if(ierroragemin>=1 || ierroragemax>=1){
+      if(ierroragemin>=1)
+       printf("%d error(s) on extreme joung age(s) of persons, check data or decrease agemin=%d\n",ierroragemin,iagemin);
+      if(ierroragemax>=1)
+       printf("%d error(s) on extreme old age(s) of persons, check data or increase agemax=%d\n",ierroragemax,iagemax);
+      exit(1);
+    }
     for(i=iagemin; i <= iagemax+3; i++){  
       for(jk=1,posprop=0; jk <=nlstate ; jk++) { 
        posprop += prop[jk][i]; 
     for(i=iagemin; i <= iagemax+3; i++){  
       for(jk=1,posprop=0; jk <=nlstate ; jk++) { 
        posprop += prop[jk][i]; 
index bb0755c97ab134e44e528a0312a914a524e0ceb5..ec41754f8f7f306370e09cbdb4fecc2280cfd52c 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 #define __IMACH_VERSION_MAJOR__ 0
 #define __IMACH_VERSION_MAJOR__ 0
-#define __IMACH_VERSION_MINOR__ 99s12
+#define __IMACH_VERSION_MINOR__ 99s13
 #define __IMACH_VERSION_PATCH__ 0
 
 #define __IMACH_VERSION_PATCH__ 0
 
-#define __IMACH_VERSION__ "0.99s12"
+#define __IMACH_VERSION__ "0.99s13"