]> henry.ined.fr Git - .git/commitdiff
*** empty log message ***
authorN. Brouard <brouard@ined.fr>
Wed, 22 May 2019 23:12:10 +0000 (23:12 +0000)
committerN. Brouard <brouard@ined.fr>
Wed, 22 May 2019 23:12:10 +0000 (23:12 +0000)
html/doc/biaspar-cov.htm
html/doc/biaspar.gp
html/doc/biaspar.htm
html/doc/biaspar.imach
html/doc/biaspar.log
html/doc/rbiaspar.imach

index 2968b3fe74b0f2e92641ec87774597a3af98467e..9854ff8bc2daf2e08af03caf3c2ef199ce2b9e40 100644 (file)
@@ -1,33 +1,33 @@
 <html><head>
 <title>IMaCh Cov biaspar-cov.htm</title></head>
- <body><font size="2">Imach version 0.98q5, August 2015,INED-EUROREVES-Institut de longevite-Japan Society for the Promotion of Science (Grant-in-Aid for Scientific Research 25293121), Intel Software 2015 <br> $Revision$ $Date$</font> <hr size="2" color="#EC5E5E"> 
-Title=1st_example <br>Datafile=data1.txt Firstpass=1 Lastpass=4 Stepm=1 Weight=0 Model=<br>
+ <body><font size="2">0.99r19 <br> $Revision$ $Date$</font> <hr size="2" color="#EC5E5E"> 
+Title=1st_example <br>Datafile=data1.txt Firstpass=1 Lastpass=4 Stepm=1 Weight=0 Model=1+age+<br>
+Current page is file <a href="biaspar-cov.htm">biaspar-cov.htm</a><br>
 
 <h4>Matrix of variance-covariance of pairs of step probabilities</h4>
-  file biaspar-cov.htm<br>
 
-Ellipsoids of confidence centered on point (p<inf>ij</inf>, p<inf>kl</inf>) are estimatedand drawn. It helps understanding how is the covariance between two incidences. They are expressed in year<sup>-1</sup> in order to be less dependent of stepm.<br>
+Ellipsoids of confidence centered on point (p<inf>ij</inf>, p<inf>kl</inf>) are estimated and drawn. It helps understanding how is the covariance between two incidences. They are expressed in year<sup>-1</sup> in order to be less dependent of stepm.<br>
 
 <br> Contour plot corresponding to x'cov<sup>-1</sup>x = 4 (where x is the column vector (pij,pkl)) are drawn. It can be understood this way: if pij and pkl where uncorrelated the (2x2) matrix of covariance would have been (1/(var pij), 0 , 0, 1/(var pkl)), and the confidence interval would be 2 standard deviations wide on each axis. <br> Now, if both incidences are correlated (usual case) we diagonalised the inverse of the covariance matrix and made the appropriate rotation to look at the uncorrelated principal directions.<br>To be simple, these graphs help to understand the significativity of each parameter in relation to a second other one.<br> 
 
-<br>Ellipsoids of confidence cov(p13,p12) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/varpijgrbiaspar113-12.png">biaspar/varpijgrbiaspar113-12.png</A>, 
-<br><img src="biaspar/varpijgrbiaspar113-12.png"> 
-<br> Correlation at age 65 (-0.338), 70 (-0.360), 75 (-0.404), 80 (-0.456), 85 (-0.418), 90 (-0.359), 95 (-0.341),
-<br>Ellipsoids of confidence cov(p21,p12) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/varpijgrbiaspar121-12.png">biaspar/varpijgrbiaspar121-12.png</A>, 
-<br><img src="biaspar/varpijgrbiaspar121-12.png"> 
-<br> Correlation at age 65 (0.333), 70 (0.332), 75 (0.326), 80 (0.304), 85 (0.276), 90 (0.289), 95 (0.302),
-<br>Ellipsoids of confidence cov(p23,p12) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/varpijgrbiaspar123-12.png">biaspar/varpijgrbiaspar123-12.png</A>, 
-<br><img src="biaspar/varpijgrbiaspar123-12.png"> 
-<br> Correlation at age 65 (0.364), 70 (0.388), 75 (0.423), 80 (0.449), 85 (0.356), 90 (0.255), 95 (0.238),
-<br>Ellipsoids of confidence cov(p21,p13) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/varpijgrbiaspar121-13.png">biaspar/varpijgrbiaspar121-13.png</A>, 
-<br><img src="biaspar/varpijgrbiaspar121-13.png"> 
-<br> Correlation at age 65 (0.047), 70 (0.037), 75 (0.024), 80 (0.024), 85 (0.078), 90 (0.100), 95 (0.097),
-<br>Ellipsoids of confidence cov(p23,p13) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/varpijgrbiaspar123-13.png">biaspar/varpijgrbiaspar123-13.png</A>, 
-<br><img src="biaspar/varpijgrbiaspar123-13.png"> 
-<br> Correlation at age 65 (-0.409), 70 (-0.453), 75 (-0.528), 80 (-0.585), 85 (-0.513), 90 (-0.434), 95 (-0.363),
-<br>Ellipsoids of confidence cov(p23,p21) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/varpijgrbiaspar123-21.png">biaspar/varpijgrbiaspar123-21.png</A>, 
-<br><img src="biaspar/varpijgrbiaspar123-21.png"> 
-<br> Correlation at age 65 (-0.015), 70 (-0.013), 75 (-0.014), 80 (-0.029), 85 (-0.061), 90 (-0.062), 95 (-0.040),<br>Local time at start Tue Aug 18 18:20:44 2015
-<br>Local time at end   Tue Aug 18 18:26:33 2015
+<p><br>Ellipsoids of confidence cov(p13,p12) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/VARPIJGR_biaspar_113-12.svg">                                                                                                                                            biaspar/VARPIJGR_biaspar_113-12.svg</A>, 
+<br><img src="biaspar/VARPIJGR_biaspar_113-12.svg"> 
+<br> Correlation at age 70 (-0.351), 75 (-0.393), 80 (-0.446), 85 (-0.413), 90 (-0.358), 95 (-0.340),
+<p><br>Ellipsoids of confidence cov(p21,p12) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-12.svg">                                                                                                                                            biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-12.svg</A>, 
+<br><img src="biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-12.svg"> 
+<br> Correlation at age 70 (0.342), 75 (0.332), 80 (0.305), 85 (0.283), 90 (0.307), 95 (0.322),
+<p><br>Ellipsoids of confidence cov(p23,p12) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-12.svg">                                                                                                                                            biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-12.svg</A>, 
+<br><img src="biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-12.svg"> 
+<br> Correlation at age 70 (0.368), 75 (0.405), 80 (0.436), 85 (0.352), 90 (0.249), 95 (0.226),
+<p><br>Ellipsoids of confidence cov(p21,p13) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-13.svg">                                                                                                                                            biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-13.svg</A>, 
+<br><img src="biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-13.svg"> 
+<br> Correlation at age 70 (0.029), 75 (0.021), 80 (0.028), 85 (0.070), 90 (0.082), 95 (0.076),
+<p><br>Ellipsoids of confidence cov(p23,p13) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-13.svg">                                                                                                                                            biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-13.svg</A>, 
+<br><img src="biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-13.svg"> 
+<br> Correlation at age 70 (-0.461), 75 (-0.531), 80 (-0.579), 85 (-0.506), 90 (-0.442), 95 (-0.379),
+<p><br>Ellipsoids of confidence cov(p23,p21) expressed in year<sup>-1</sup> :<a href="biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-21.svg">                                                                                                                                            biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-21.svg</A>, 
+<br><img src="biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-21.svg"> 
+<br> Correlation at age 70 (-0.033), 75 (-0.032), 80 (-0.038), 85 (-0.055), 90 (-0.060), 95 (-0.050),<br>Local time at start Wed May 22 22:32:36 2019
+<br>Local time at end   Wed May 22 22:34:09 2019
 <br>
 </body></html>
\ No newline at end of file
index b7d94c7386140505366b8f81efcdf602296d1bf4..2f34b7e7812402a1a7e305f1b020ff799baa5497 100644 (file)
 
-# Imach version 0.98q5, August 2015,INED-EUROREVES-Institut de longevite-Japan Society for the Promotion of Science (Grant-in-Aid for Scientific Research 25293121), Intel Software 2015
+# IMaCh-0.99r19
 # biaspar.gp
 set datafile missing 'NaNq'
-cd "/Users/nbrouard/Documents/imach/cvs/imach/build/osx/html/doc" 
+cd "/Users/nbrouard/Documents/imach/cvs/imach/html/doc" 
 
-# 1st: Period (stable) prevalence with CI: 'vpl' files
+#Diagram of the model 
 
-set out "biaspar/vbiaspar1_1.png" 
+delta=0.03;delta2=0.07;unset arrow;
+yoff=(2 > 2? 0:1);
 
-#set out "vbiaspar1_1.png" 
+#Peripheral arrows
+set for [i=1:2] for [j=1:2] arrow i*10+j from cos(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(i-1)*2./2))-(i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0), yoff +sin(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(i-1)*2./2)) + (i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0) rto -0.95*(cos(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(i-1)*2./2))+(i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0) - cos(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(j-1)*2./2)) + (i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta2:0)), -0.95*(sin(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(i-1)*2./2)) + (i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0) - sin(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(j-1)*2./2))+( i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta2:0)) ls (i < j? 1:2)
+
+#Centripete arrows (turning in other direction (1-i) instead of (i-1)) 
+set for [i=1:2] arrow (2+1)*10+i from cos(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(1-i)*2./2))-(i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0), yoff +sin(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(1-i)*2./2)) + (i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0) rto -0.80*(cos(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(1-i)*2./2))+(i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0)  ), -0.80*(sin(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(1-i)*2./2)) + (i!=j?(i-j)/abs(i-j)*delta:0) + yoff ) ls 4
+
+#show arrow
+unset label
+
+#States labels, starting from 2 (2-i) instead of (1-i), was (i-1)
+set for [i=1:2] label i sprintf("State %d",i) center at cos(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(2-i)*2./2)), yoff+sin(pi*((1-(2/2)*2./2)/2+(2-i)*2./2)) font "helvetica, 16" tc rgbcolor "blue"
+
+set label 2+1 sprintf("State %d",2+1) center at 0.,0.  font "helvetica, 16" tc rgbcolor "red"
+
+#show label
+unset border;unset xtics; unset ytics;
+
+
+set ter svg size 640, 480;set out "biaspar/D_biaspar_.svg" 
+unset log y; plot [-1.2:1.2][yoff-1.2:1.2] 1/0 not; set out;reset;
+
+# Contributions to the Likelihood, mle >=1. For mle=4 no interpolation, pure matrix products.
+#
+
+ set log y; unset log x;set xlabel "Age"; set ylabel "Likelihood (-2Log(L))";
+set ter pngcairo size 640, 480
+set out "biaspar/ILK_biaspar-dest.png";
+set log y;plot  "biaspar/ILK_biaspar.txt" u 2:(-$13):6 t "All sample, transitions colored by destination" with dots lc variable; set out;
+
+set out "biaspar/ILK_biaspar-ori.png";
+set log y;plot  "biaspar/ILK_biaspar.txt" u 2:(-$13):5 t "All sample, transitions colored by origin" with dots lc variable; set out;
+
+
+set out "biaspar/ILK_biaspar-p1j.png";set ylabel "Probability for each individual/wave";unset log;
+# plot weighted, mean weight should have point size of 0.5
+ plot  "biaspar/ILK_biaspar.txt"  u  2:($5 == 1 && $6==1 ? $10 : 1/0):($12/4.):6 t "p11" with points pointtype 7 ps variable lc variable \
+,\
+ "" u  2:($5 == 1 && $6==2 ? $10 : 1/0):($12/4.):6 t "p12" with points pointtype 7 ps variable lc variable ,\
+ "" u  2:($5 == 1 && $6==3 ? $10 : 1/0):($12/4.):6 t "p13" with points pointtype 7 ps variable lc variable ;
+set out; unset ylabel;
+
+set out "biaspar/ILK_biaspar-p2j.png";set ylabel "Probability for each individual/wave";unset log;
+# plot weighted, mean weight should have point size of 0.5
+ plot  "biaspar/ILK_biaspar.txt"  u  2:($5 == 2 && $6==1 ? $10 : 1/0):($12/4.):6 t "p21" with points pointtype 7 ps variable lc variable \
+,\
+ "" u  2:($5 == 2 && $6==2 ? $10 : 1/0):($12/4.):6 t "p22" with points pointtype 7 ps variable lc variable ,\
+ "" u  2:($5 == 2 && $6==3 ? $10 : 1/0):($12/4.):6 t "p23" with points pointtype 7 ps variable lc variable ;
+set out; unset ylabel;
+
+set out;unset log
+
+# 1st: Forward (stable period) prevalence with CI: 'VPL_' files  and live state =1 
+#
+
+set out "biaspar/V_biaspar_1-1-1.svg" 
+
+#set out "V_biaspar_1-1-1.svg" 
+set title "Alive state 1 ()" font "Helvetica,12"
 set xlabel "Age" 
 set ylabel "Probability" 
-set ter png small size 320, 240
-plot [70:95] "biaspar/vplrbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 "%lf %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"Period (stable) prevalence" w l lt 0,"biaspar/vplrbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2+1.96*$3) "%lf %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"95% CI" w l lt 1,"biaspar/vplrbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2-1.96*$3) "%lf %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 1,"biaspar/prbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2) t"Observed prevalence " w l lt 2
-set out "biaspar/vbiaspar2_1.png" 
+set ter svg size 640, 480
+plot [70:95] "biaspar/VPL_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 ? $3:1/0) "%lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"Forward prevalence" w l lt 0,"biaspar/VPL_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 ? $3+1.96*$4 : 1/0) "%lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"95% CI" w l lt 1,"biaspar/VPL_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 ? $3-1.96*$4 : 1/0) "%lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 1,"biaspar/P_biaspar.txt" u 1:(($2)) t 'Observed prevalence in state 1' with line lt 3
+set out ;unset title;
+
+# 1st: Forward (stable period) prevalence with CI: 'VPL_' files  and live state =2 
+#
 
-#set out "vbiaspar2_1.png" 
+set out "biaspar/V_biaspar_2-1-1.svg" 
+
+#set out "V_biaspar_2-1-1.svg" 
+set title "Alive state 2 ()" font "Helvetica,12"
 set xlabel "Age" 
 set ylabel "Probability" 
-set ter png small size 320, 240
-plot [70:95] "biaspar/vplrbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 "%lf %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"Period (stable) prevalence" w l lt 0,"biaspar/vplrbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2+1.96*$3) "%lf %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"95% CI" w l lt 1,"biaspar/vplrbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2-1.96*$3) "%lf %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 1,"biaspar/prbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($6) t"Observed prevalence " w l lt 2
-# 2nd: Total life expectancy with CI: 't' files
+set ter svg size 640, 480
+plot [70:95] "biaspar/VPL_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 ? $3:1/0) "%lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"Forward prevalence" w l lt 0,"biaspar/VPL_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 ? $3+1.96*$4 : 1/0) "%lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"95% CI" w l lt 1,"biaspar/VPL_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 ? $3-1.96*$4 : 1/0) "%lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 1,"biaspar/P_biaspar.txt" u 1:(($5)) t 'Observed prevalence in state 2' with line lt 3
+set out ;unset title;
+
+# 2nd: Total life expectancy with CI: 't' files 
+#
+
+set out "biaspar/E_biaspar_1-1.svg" 
 
-set out "biaspar/ebiaspar1.png" 
+set label "popbased 0 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
 set ylabel "Years" 
-set ter png small size 320, 240
-plot [70:95] "biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 "%lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"TLE" w l ,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2-$3*2) "%lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2+$3*2) "%lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 "%lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"LE in state (1)" w l ,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2-$3*2) "%lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2+$3*2) "%lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 "%lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"LE in state (2)" w l ,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2-$3*2) "%lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/trbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2+$3*2) "%lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 0
-set out "biaspar/expbiaspar11.png" 
-set ter png small size 320, 240
-plot [70:95] "biaspar/erbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 t "e11" w l ,"biaspar/erbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:3 t "e12" w l ,"biaspar/erbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:4 t "e1." w l
-set out "biaspar/expbiaspar21.png" 
-set ter png small size 320, 240
-plot [70:95] "biaspar/erbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:5 t "e21" w l ,"biaspar/erbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:6 t "e22" w l ,"biaspar/erbiaspar.txt" every :::0::0 u 1:7 t "e2." w l
-#
-#
-#CV preval stable (period): 'pij' files, cov=1 state=1
-set out "biaspar/pbiaspar1_1.png" 
+set ter svg size 640, 480
+plot [70:95] "biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ?$4 : 1/0) "%lf %lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"TLE" w l lt 1, \
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ? $4-$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ? $4+$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,\
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ?$4 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"LE in state (1)" w l lt 3, \
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ? $4-$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ? $4+$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,\
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ?$4 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"LE in state (2)" w l lt 4, \
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ? $4-$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==0 && $4!=0 ? $4+$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 0
+set label "popbased 1 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+
+replot "biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ?$4 : 1/0) "%lf %lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"TLE" w l lt 1, \
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ? $4-$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ? $4+$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %lf (%lf) %*lf (%*lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,\
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ?$4 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"LE in state (1)" w l lt 3, \
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ? $4-$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ? $4+$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %lf (%lf) %*lf (%*lf)" t"" w l lt 0,\
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ?$4 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"LE in state (2)" w l lt 4, \
+"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ? $4-$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 0,"biaspar/T_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:($2==1 && $4!=0 ? $4+$5*2 : 1/0) "%lf %lf %lf %*lf (%*lf) %*lf (%*lf) %lf (%lf)" t"" w l lt 0
+set out;set out "biaspar/E_biaspar_1-1.svg"; replot; set out; unset label;
+
+
+# 3d: Life expectancy with EXP_ files:  combination=1 state=1
+#
+
+set out "biaspar/EXP_biaspar_1-1-1.svg" 
+set label "()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set ter svg size 640, 480
+plot [70:95] "biaspar/E_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:2 t "e11" w l ,"biaspar/E_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:3 t "e12" w l ,"biaspar/E_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:4 t "e1." w l
+
+# 3d: Life expectancy with EXP_ files:  combination=1 state=2
+#
+
+set out "biaspar/EXP_biaspar_2-1-1.svg" 
+set label "()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set ter svg size 640, 480
+plot [70:95] "biaspar/E_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:5 t "e21" w l ,"biaspar/E_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:6 t "e22" w l ,"biaspar/E_biaspar.txt" every :::0::0 u 1:7 t "e2." w l
+unset label;
+
+#
+#
+# Survival functions in state j : 'LIJ_' files, cov=1 state=1
+#
+
+set out "biaspar/LIJ_biaspar_1-1-1.svg" 
+set label "Alive state 1 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set xlabel "Age" 
+set ylabel "Probability to be alive" 
+set ter svg size 640, 480
+unset log y
+plot [70:95]  "biaspar/PIJ_biaspar.txt" u ($1==1 ? ($3):1/0):($4/($4+$5+$6)) t "l(1,1)" w l, ''  u ($1==1 ? ($3):1/0):($7/($7+$8+$9)) t "l(2,1)" w l
+set out; unset label;
+
+#
+#
+# Survival functions in state j : 'LIJ_' files, cov=1 state=2
+#
+
+set out "biaspar/LIJ_biaspar_2-1-1.svg" 
+set label "Alive state 2 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set xlabel "Age" 
+set ylabel "Probability to be alive" 
+set ter svg size 640, 480
+unset log y
+plot [70:95]  "biaspar/PIJ_biaspar.txt" u ($1==1 ? ($3):1/0):($5/($4+$5+$6)) t "l(1,2)" w l, ''  u ($1==1 ? ($3):1/0):($8/($7+$8+$9)) t "l(2,2)" w l
+set out; unset label;
+
+#
+#
+# Survival functions in state j and all livestates from state i by final state j: 'lij' files, cov=1 state=1
+#
+
+set out "biaspar/LIJT_biaspar_1-1-1.svg" 
+set label "Alive state 1 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set xlabel "Age" 
+set ylabel "Probability to be alive" 
+set ter svg size 640, 480
+unset log y
+plot [70:95]  "biaspar/PIJ_biaspar.txt" u (($1==1 && (floor($2)%5 == 0)) ? ($3):1/0):($4) t "l(1,1)" w l, ''  u (($1==1 && (floor($2)%5 == 0)) ? ($3):1/0):($5) t "l(1,2)" w l, ''  u (($1==1 && (floor($2)%5 == 0)) ? ($3):1/0):($4 +$5) t"l(1,.)" w l
+set out; unset label;
+
+#
+#
+# Survival functions in state j and all livestates from state i by final state j: 'lij' files, cov=1 state=2
+#
+
+set out "biaspar/LIJT_biaspar_2-1-1.svg" 
+set label "Alive state 2 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set xlabel "Age" 
+set ylabel "Probability to be alive" 
+set ter svg size 640, 480
+unset log y
+plot [70:95]  "biaspar/PIJ_biaspar.txt" u (($1==1 && (floor($2)%5 == 0)) ? ($3):1/0):($7) t "l(2,1)" w l, ''  u (($1==1 && (floor($2)%5 == 0)) ? ($3):1/0):($8) t "l(2,2)" w l, ''  u (($1==1 && (floor($2)%5 == 0)) ? ($3):1/0):($7 +$8) t"l(2,.)" w l
+set out; unset label;
+
+#
+#
+#CV preval stable (forward): 'pij' files, covariatecombination#=1 state=1
+#
+
+set out "biaspar/P_biaspar_1-1-1.svg" 
+set label "Alive state 1 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
 set xlabel "Age" 
 set ylabel "Probability" 
-set ter png small size 320, 240
+set ter svg size 640, 480
 unset log y
-plot [70:95]  "biaspar/pijrbiaspar.txt" u ($1==1 ? ($3):1/0):($4/($4+$5)) t "prev(1,1)" w l, ''  u ($1==1 ? ($3):1/0):($7/($7+$8)) t "prev(2,1)" w l
+plot [70:95]  "biaspar/PIJ_biaspar.txt" u ($1==1 ? ($3):1/0):($4/($4+$5)) t "prev(1,1)" w l, ''  u ($1==1 ? ($3):1/0):($7/($7+$8)) t "prev(2,1)" w l
+set out; unset label;
 
 #
 #
-#CV preval stable (period): 'pij' files, cov=1 state=2
-set out "biaspar/pbiaspar2_1.png" 
+#CV preval stable (forward): 'pij' files, covariatecombination#=1 state=2
+#
+
+set out "biaspar/P_biaspar_2-1-1.svg" 
+set label "Alive state 2 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
 set xlabel "Age" 
 set ylabel "Probability" 
-set ter png small size 320, 240
+set ter svg size 640, 480
+unset log y
+plot [70:95]  "biaspar/PIJ_biaspar.txt" u ($1==1 ? ($3):1/0):($5/($4+$5)) t "prev(1,2)" w l, ''  u ($1==1 ? ($3):1/0):($8/($7+$8)) t "prev(2,2)" w l
+set out; unset label;
+
+#
+#
+#Projection of prevalence to forward stable prevalence (period): 'PROJ_' files, covariatecombination#=1 state=1
+#
+# hpijx=probability over h years, hp.jx is weighted by observed prev
+set out "biaspar/PROJ_biaspar_1-1-1.svg" 
+set label "Alive state 1 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set xlabel "Age" 
+set ylabel "Prevalence" 
+set ter svg size 640, 480
+unset log y
+plot [70:95]  "biaspar/F_biaspar.txt" u 2:( $5/(1.-$11)):1 t 'pw.1' with line lc variable ,\
+ ''  u 2:( (($1-$2) == 1919 ) ? $5/(1.-$11) : 1/0):1 with labels center not 
+set out; unset label;
+
+#
+#
+#Projection of prevalence to forward stable prevalence (period): 'PROJ_' files, covariatecombination#=1 state=2
+#
+# hpijx=probability over h years, hp.jx is weighted by observed prev
+set out "biaspar/PROJ_biaspar_2-1-1.svg" 
+set label "Alive state 2 ()" at graph 0.98,0.5 center rotate font "Helvetica,12"
+set xlabel "Age" 
+set ylabel "Prevalence" 
+set ter svg size 640, 480
 unset log y
-plot [70:95]  "biaspar/pijrbiaspar.txt" u ($1==1 ? ($3):1/0):($5/($4+$5)) t "prev(1,2)" w l, ''  u ($1==1 ? ($3):1/0):($8/($7+$8)) t "prev(2,2)" w l
+plot [70:95]  "biaspar/F_biaspar.txt" u 2:( $8/(1.-$11)):1 t 'pw.2' with line lc variable ,\
+ ''  u 2:( (($1-$2) == 1919 ) ? $8/(1.-$11) : 1/0):1 with labels center not 
+set out; unset label;
 
 ##############
-#MLE estimated parameters
+#9eme MLE estimated parameters
 #############
 # initial state 1
 #   current state 2
-p1=-12.202711; p2=0.091764
+p1=-12.317578; p2=0.093112
 #   current state 3
-p3=-10.299238; p4=0.056626
+p3=-10.163170; p4=0.054838
 # initial state 2
 #   current state 1
-p5=-1.545619; p6=-0.035395
+p5=-1.668569; p6=-0.033906
 #   current state 3
-p7=-5.565963; p8=0.016951
+p7=-5.686920; p8=0.018135
 ##############
 #
 
 ##############
-#Graphics of of probabilities or incidences
+#10eme Graphics of probabilities or incidences
 #############
 # logi(p12/p11)=a12+b12*age+c12age*age+d12*V1+e12*V1*age
 # logi(p12/p11)=p1 +p2*age +p3*age*age+ p4*V1+ p5*V1*age
@@ -84,188 +276,247 @@ p7=-5.565963; p8=0.016951;
 #       +exp(a13+b13*age+c13age*age+d13*V1+e13*V1*age))
 #       +exp(a14+b14*age+c14age*age+d14*V1+e14*V1*age)+...)
 #
-# ng=1
-#   jk=1 to 2^0=1
-#    jk=1
+#Number of graphics: first is logit, 2nd is probabilities, third is incidences per year
+#model= 
+# Type of graphic ng=1
+#   k1=1 to 2^0=1
 
-set out "biaspar/pebiaspar1_1.png" 
 
-set title "Probability"
+# Combination of dummy  k1=1 which is 
+#
+
+set out "biaspar/PE_biaspar_1-1-1.svg" 
+set key outside 
+set title "()" font "Helvetica,12"
+
+set ter svg size 640, 480 
+set ylabel "Value of the logit of the model"
+
+unset log y
+plot  [70:95]  p1+p2*x w l lw 2 lt (3*1+2)%3+1 dt 1 t "logit(p12)" , p3+p4*x w l lw 2 lt (3*1+3)%3+1 dt 1 t "logit(p13)" , p5+p6*x w l lw 2 lt (3*2+1)%3+1 dt 2 t "logit(p21)" , p7+p8*x w l lw 2 lt (3*2+3)%3+1 dt 2 t "logit(p23)" 
+ set out; unset title;set key default;
+#Number of graphics: first is logit, 2nd is probabilities, third is incidences per year
+#model= 
+# Type of graphic ng=2
+#   k1=1 to 2^0=1
+
+
+# Combination of dummy  k1=1 which is 
+#
+
+set out "biaspar/PE_biaspar_1-2-1.svg" 
+set key outside 
+set title "()" font "Helvetica,12"
+
+set ter svg size 640, 480 
+set ylabel "Probability"
 
-set ter png small size 320, 240
 set log y
-plot  [70:95]  exp(p1+p2*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) t "p12" , exp(p3+p4*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) t "p13" , exp(p5+p6*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) t "p21" , exp(p7+p8*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) t "p23" # ng=2
-#   jk=1 to 2^0=1
-#    jk=1
+plot  [70:95]  (1.)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) w l lw 2 lt (3*1+1)%3+1 dt 1 t "p11" , exp(p1+p2*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) w l lw 2 lt (3*1+2)%3+1 dt 1 t "p12" , exp(p3+p4*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) w l lw 2 lt (3*1+3)%3+1 dt 1 t "p13" , exp(p5+p6*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) w l lw 2 lt (3*2+1)%3+1 dt 2 t "p21" , (1.)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) w l lw 2 lt (3*2+2)%3+1 dt 2 t "p22" , exp(p7+p8*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) w l lw 2 lt (3*2+3)%3+1 dt 2 t "p23" 
+ set out; unset title;set key default;
+#Number of graphics: first is logit, 2nd is probabilities, third is incidences per year
+#model= 
+# Type of graphic ng=3
+#   k1=1 to 2^0=1
+
 
-set out "biaspar/pebiaspar1_2.png" 
+# Combination of dummy  k1=1 which is 
+#
+
+set out "biaspar/PE_biaspar_1-3-1.svg" 
+set key outside 
+set title "()" font "Helvetica,12"
 
+set ter svg size 640, 480 
 set ylabel "Quasi-incidence per year"
 
-set ter png small size 320, 240
 set log y
-plot  [70:95]  12.000000*exp(p1+p2*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) t "p12" , 12.000000*exp(p3+p4*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) t "p13" , 12.000000*exp(p5+p6*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) t "p21" , 12.000000*exp(p7+p8*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) t "p23" 
+plot  [70:95]  (1.)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) w l lw 2 lt (3*1+1)%3+1 dt 1 t "i11" , 12.000000*exp(p1+p2*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) w l lw 2 lt (3*1+2)%3+1 dt 1 t "i12" , 12.000000*exp(p3+p4*x)/(1+exp(p1+p2*x)+exp(p3+p4*x)) w l lw 2 lt (3*1+3)%3+1 dt 1 t "i13" , 12.000000*exp(p5+p6*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) w l lw 2 lt (3*2+1)%3+1 dt 2 t "i21" , (1.)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) w l lw 2 lt (3*2+2)%3+1 dt 2 t "i22" , 12.000000*exp(p7+p8*x)/(1+exp(p5+p6*x)+exp(p7+p8*x)) w l lw 2 lt (3*2+3)%3+1 dt 2 t "i23" 
+ set out; unset title;set key default;
+
 # Routine varprob
+# Ellipsoids of confidence
+#
+
 set parametric;unset label
 set log y;set log x; set xlabel "p13 (year-1)";set ylabel "p12 (year-1)"
-set ter png small size 320, 240
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar113-12.png"
-set label "65" at   1.597e-02,  2.337e-02 center
-# Age 65, p13 - p12
-plot [-pi:pi]   1.597e-02+ 2.000*(  7.325e-01*  2.084e-03*cos(t)+  6.807e-01*  1.465e-03*sin(t)),   2.337e-02 +2.000*( -6.807e-01*  2.084e-03*cos(t)+  7.325e-01*  1.465e-03*sin(t)) not
+set ter svg size 640, 480
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_113-12.svg"
+set label "70" at   2.140e-02,  3.617e-02 center
 # Age 70, p13 - p12
-set label "70" at   2.117e-02,  3.691e-02 center
-replot   2.117e-02+ 2.000*(  5.240e-01*  2.315e-03*cos(t)+  8.517e-01*  1.521e-03*sin(t)),   3.691e-02 +2.000*( -8.517e-01*  2.315e-03*cos(t)+  5.240e-01*  1.521e-03*sin(t)) not
+plot [-pi:pi]   2.140e-02+ 2.000*(  5.514e-01*  2.264e-03*cos(t)+  8.342e-01*  1.523e-03*sin(t)),   3.617e-02 +2.000*( -8.342e-01*  2.264e-03*cos(t)+  5.514e-01*  1.523e-03*sin(t)) not
 # Age 75, p13 - p12
-set label "75" at   2.803e-02,  5.827e-02 center
-replot   2.803e-02+ 2.000*(  3.929e-01*  2.501e-03*cos(t)+  9.196e-01*  1.403e-03*sin(t)),   5.827e-02 +2.000*( -9.196e-01*  2.501e-03*cos(t)+  3.929e-01*  1.403e-03*sin(t)) not
+set label "75" at   2.808e-02,  5.747e-02 center
+replot   2.808e-02+ 2.000*(  3.943e-01*  2.448e-03*cos(t)+  9.190e-01*  1.398e-03*sin(t)),   5.747e-02 +2.000*( -9.190e-01*  2.448e-03*cos(t)+  3.943e-01*  1.398e-03*sin(t)) not
 # Age 80, p13 - p12
-set label "80" at   3.707e-02,  9.186e-02 center
-replot   3.707e-02+ 2.000*(  3.828e-01*  2.718e-03*cos(t)+  9.238e-01*  1.387e-03*sin(t)),   9.186e-02 +2.000*( -9.238e-01*  2.718e-03*cos(t)+  3.828e-01*  1.387e-03*sin(t)) not
+set label "80" at   3.681e-02,  9.123e-02 center
+replot   3.681e-02+ 2.000*(  3.741e-01*  2.676e-03*cos(t)+  9.274e-01*  1.373e-03*sin(t)),   9.123e-02 +2.000*( -9.274e-01*  2.676e-03*cos(t)+  3.741e-01*  1.373e-03*sin(t)) not
 # Age 85, p13 - p12
-set label "85" at   4.893e-02,  1.445e-01 center
-replot   4.893e-02+ 2.000*(  4.026e-01*  4.082e-03*cos(t)+  9.154e-01*  2.265e-03*sin(t)),   1.445e-01 +2.000*( -9.154e-01*  4.082e-03*cos(t)+  4.026e-01*  2.265e-03*sin(t)) not
+set label "85" at   4.816e-02,  1.445e-01 center
+replot   4.816e-02+ 2.000*(  3.906e-01*  4.057e-03*cos(t)+  9.206e-01*  2.238e-03*sin(t)),   1.445e-01 +2.000*( -9.206e-01*  4.057e-03*cos(t)+  3.906e-01*  2.238e-03*sin(t)) not
 # Age 90, p13 - p12
-set label "90" at   6.441e-02,  2.268e-01 center
-replot   6.441e-02+ 2.000*(  2.874e-01*  8.787e-03*cos(t)+  9.578e-01*  4.578e-03*sin(t)),   2.268e-01 +2.000*( -9.578e-01*  8.787e-03*cos(t)+  2.874e-01*  4.578e-03*sin(t)) not
+set label "90" at   6.283e-02,  2.283e-01 center
+replot   6.283e-02+ 2.000*(  2.754e-01*  8.795e-03*cos(t)+  9.613e-01*  4.488e-03*sin(t)),   2.283e-01 +2.000*( -9.613e-01*  8.795e-03*cos(t)+  2.754e-01*  4.488e-03*sin(t)) not
 # Age 95, p13 - p12
-set label "95" at   8.441e-02,  3.543e-01 center
-replot   8.441e-02+ 2.000*(  2.019e-01*  1.921e-02*cos(t)+  9.794e-01*  8.453e-03*sin(t)),   3.543e-01 +2.000*( -9.794e-01*  1.921e-02*cos(t)+  2.019e-01*  8.453e-03*sin(t)) not
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar113-12.png";replot;
+set label "95" at   8.159e-02,  3.590e-01 center
+replot   8.159e-02+ 2.000*(  1.909e-01*  1.934e-02*cos(t)+  9.816e-01*  8.213e-03*sin(t)),   3.590e-01 +2.000*( -9.816e-01*  1.934e-02*cos(t)+  1.909e-01*  8.213e-03*sin(t)) not
+set out;
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_113-12.svg";replot;set out;
+# Ellipsoids of confidence
+#
+
 set parametric;unset label
 set log y;set log x; set xlabel "p21 (year-1)";set ylabel "p12 (year-1)"
-set ter png small size 320, 240
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar121-12.png"
-set label "65" at   2.481e-01,  2.337e-02 center
-# Age 65, p21 - p12
-plot [-pi:pi]   2.481e-01+ 2.000*(  9.999e-01*  3.884e-02*cos(t)+ -1.528e-02*  1.677e-03*sin(t)),   2.337e-02 +2.000*(  1.528e-02*  3.884e-02*cos(t)+  9.999e-01*  1.677e-03*sin(t)) not
+set ter svg size 640, 480
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-12.svg"
+set label "70" at   2.047e-01,  3.617e-02 center
 # Age 70, p21 - p12
-set label "70" at   2.084e-01,  3.691e-02 center
-replot   2.084e-01+ 2.000*(  9.996e-01*  2.493e-02*cos(t)+ -2.848e-02*  2.005e-03*sin(t)),   3.691e-02 +2.000*(  2.848e-02*  2.493e-02*cos(t)+  9.996e-01*  2.005e-03*sin(t)) not
+plot [-pi:pi]   2.047e-01+ 2.000*(  9.996e-01*  2.493e-02*cos(t)+ -2.854e-02*  1.942e-03*sin(t)),   3.617e-02 +2.000*(  2.854e-02*  2.493e-02*cos(t)+  9.996e-01*  1.942e-03*sin(t)) not
 # Age 75, p21 - p12
-set label "75" at   1.749e-01,  5.827e-02 center
-replot   1.749e-01+ 2.000*(  9.986e-01*  1.487e-02*cos(t)+ -5.306e-02*  2.233e-03*sin(t)),   5.827e-02 +2.000*(  5.306e-02*  1.487e-02*cos(t)+  9.986e-01*  2.233e-03*sin(t)) not
+set label "75" at   1.730e-01,  5.747e-02 center
+replot   1.730e-01+ 2.000*(  9.986e-01*  1.494e-02*cos(t)+ -5.266e-02*  2.181e-03*sin(t)),   5.747e-02 +2.000*(  5.266e-02*  1.494e-02*cos(t)+  9.986e-01*  2.181e-03*sin(t)) not
 # Age 80, p21 - p12
-set label "80" at   1.467e-01,  9.186e-02 center
-replot   1.467e-01+ 2.000*(  9.949e-01*  8.452e-03*cos(t)+ -1.006e-01*  2.434e-03*sin(t)),   9.186e-02 +2.000*(  1.006e-01*  8.452e-03*cos(t)+  9.949e-01*  2.434e-03*sin(t)) not
+set label "80" at   1.462e-01,  9.123e-02 center
+replot   1.462e-01+ 2.000*(  9.951e-01*  8.486e-03*cos(t)+ -9.892e-02*  2.403e-03*sin(t)),   9.123e-02 +2.000*(  9.892e-02*  8.486e-03*cos(t)+  9.951e-01*  2.403e-03*sin(t)) not
 # Age 85, p21 - p12
-set label "85" at   1.230e-01,  1.445e-01 center
-replot   1.230e-01+ 2.000*(  9.691e-01*  6.397e-03*cos(t)+ -2.468e-01*  3.619e-03*sin(t)),   1.445e-01 +2.000*(  2.468e-01*  6.397e-03*cos(t)+  9.691e-01*  3.619e-03*sin(t)) not
+set label "85" at   1.235e-01,  1.445e-01 center
+replot   1.235e-01+ 2.000*(  9.684e-01*  6.423e-03*cos(t)+ -2.493e-01*  3.599e-03*sin(t)),   1.445e-01 +2.000*(  2.493e-01*  6.423e-03*cos(t)+  9.684e-01*  3.599e-03*sin(t)) not
 # Age 90, p21 - p12
-set label "90" at   1.031e-01,  2.268e-01 center
-replot   1.031e-01+ 2.000*(  5.313e-01*  9.166e-03*cos(t)+ -8.472e-01*  6.591e-03*sin(t)),   2.268e-01 +2.000*(  8.472e-01*  9.166e-03*cos(t)+  5.313e-01*  6.591e-03*sin(t)) not
+set label "90" at   1.042e-01,  2.283e-01 center
+replot   1.042e-01+ 2.000*(  5.573e-01*  9.289e-03*cos(t)+ -8.303e-01*  6.600e-03*sin(t)),   2.283e-01 +2.000*(  8.303e-01*  9.289e-03*cos(t)+  5.573e-01*  6.600e-03*sin(t)) not
 # Age 95, p21 - p12
-set label "95" at   8.634e-02,  3.543e-01 center
-replot   8.634e-02+ 2.000*(  1.792e-01*  1.914e-02*cos(t)+ -9.838e-01*  8.537e-03*sin(t)),   3.543e-01 +2.000*(  9.838e-01*  1.914e-02*cos(t)+  1.792e-01*  8.537e-03*sin(t)) not
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar121-12.png";replot;
+set label "95" at   8.796e-02,  3.590e-01 center
+replot   8.796e-02+ 2.000*(  1.959e-01*  1.934e-02*cos(t)+ -9.806e-01*  8.711e-03*sin(t)),   3.590e-01 +2.000*(  9.806e-01*  1.934e-02*cos(t)+  1.959e-01*  8.711e-03*sin(t)) not
+set out;
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-12.svg";replot;set out;
+# Ellipsoids of confidence
+#
+
 set parametric;unset label
 set log y;set log x; set xlabel "p23 (year-1)";set ylabel "p12 (year-1)"
-set ter png small size 320, 240
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar123-12.png"
-set label "65" at   1.338e-01,  2.337e-02 center
-# Age 65, p23 - p12
-plot [-pi:pi]   1.338e-01+ 2.000*(  9.993e-01*  1.768e-02*cos(t)+ -3.696e-02*  1.655e-03*sin(t)),   2.337e-02 +2.000*(  3.696e-02*  1.768e-02*cos(t)+  9.993e-01*  1.655e-03*sin(t)) not
+set ter svg size 640, 480
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-12.svg"
+set label "70" at   1.406e-01,  3.617e-02 center
 # Age 70, p23 - p12
-set label "70" at   1.460e-01,  3.691e-02 center
-replot   1.460e-01+ 2.000*(  9.985e-01*  1.541e-02*cos(t)+ -5.441e-02*  1.957e-03*sin(t)),   3.691e-02 +2.000*(  5.441e-02*  1.541e-02*cos(t)+  9.985e-01*  1.957e-03*sin(t)) not
+plot [-pi:pi]   1.406e-01+ 2.000*(  9.987e-01*  1.493e-02*cos(t)+ -5.178e-02*  1.920e-03*sin(t)),   3.617e-02 +2.000*(  5.178e-02*  1.493e-02*cos(t)+  9.987e-01*  1.920e-03*sin(t)) not
 # Age 75, p23 - p12
-set label "75" at   1.591e-01,  5.827e-02 center
-replot   1.591e-01+ 2.000*(  9.967e-01*  1.275e-02*cos(t)+ -8.076e-02*  2.137e-03*sin(t)),   5.827e-02 +2.000*(  8.076e-02*  1.275e-02*cos(t)+  9.967e-01*  2.137e-03*sin(t)) not
+set label "75" at   1.542e-01,  5.747e-02 center
+replot   1.542e-01+ 2.000*(  9.970e-01*  1.241e-02*cos(t)+ -7.775e-02*  2.112e-03*sin(t)),   5.747e-02 +2.000*(  7.775e-02*  1.241e-02*cos(t)+  9.970e-01*  2.112e-03*sin(t)) not
 # Age 80, p23 - p12
-set label "80" at   1.734e-01,  9.186e-02 center
-replot   1.734e-01+ 2.000*(  9.924e-01*  9.884e-03*cos(t)+ -1.231e-01*  2.277e-03*sin(t)),   9.186e-02 +2.000*(  1.231e-01*  9.884e-03*cos(t)+  9.924e-01*  2.277e-03*sin(t)) not
+set label "80" at   1.690e-01,  9.123e-02 center
+replot   1.690e-01+ 2.000*(  9.927e-01*  9.663e-03*cos(t)+ -1.210e-01*  2.265e-03*sin(t)),   9.123e-02 +2.000*(  1.210e-01*  9.663e-03*cos(t)+  9.927e-01*  2.265e-03*sin(t)) not
 # Age 85, p23 - p12
-set label "85" at   1.889e-01,  1.445e-01 center
-replot   1.889e-01+ 2.000*(  9.741e-01*  7.696e-03*cos(t)+ -2.260e-01*  3.522e-03*sin(t)),   1.445e-01 +2.000*(  2.260e-01*  7.696e-03*cos(t)+  9.741e-01*  3.522e-03*sin(t)) not
+set label "85" at   1.851e-01,  1.445e-01 center
+replot   1.851e-01+ 2.000*(  9.733e-01*  7.552e-03*cos(t)+ -2.295e-01*  3.515e-03*sin(t)),   1.445e-01 +2.000*(  2.295e-01*  7.552e-03*cos(t)+  9.733e-01*  3.515e-03*sin(t)) not
 # Age 90, p23 - p12
-set label "90" at   2.057e-01,  2.268e-01 center
-replot   2.057e-01+ 2.000*(  6.276e-01*  9.309e-03*cos(t)+ -7.786e-01*  7.132e-03*sin(t)),   2.268e-01 +2.000*(  7.786e-01*  9.309e-03*cos(t)+  6.276e-01*  7.132e-03*sin(t)) not
+set label "90" at   2.028e-01,  2.283e-01 center
+replot   2.028e-01+ 2.000*(  6.011e-01*  9.259e-03*cos(t)+ -7.992e-01*  7.110e-03*sin(t)),   2.283e-01 +2.000*(  7.992e-01*  9.259e-03*cos(t)+  6.011e-01*  7.110e-03*sin(t)) not
 # Age 95, p23 - p12
-set label "95" at   2.238e-01,  3.543e-01 center
-replot   2.238e-01+ 2.000*(  2.443e-01*  1.925e-02*cos(t)+ -9.697e-01*  1.172e-02*sin(t)),   3.543e-01 +2.000*(  9.697e-01*  1.925e-02*cos(t)+  2.443e-01*  1.172e-02*sin(t)) not
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar123-12.png";replot;
+set label "95" at   2.219e-01,  3.590e-01 center
+replot   2.219e-01+ 2.000*(  2.273e-01*  1.937e-02*cos(t)+ -9.738e-01*  1.173e-02*sin(t)),   3.590e-01 +2.000*(  9.738e-01*  1.937e-02*cos(t)+  2.273e-01*  1.173e-02*sin(t)) not
+set out;
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-12.svg";replot;set out;
+# Ellipsoids of confidence
+#
+
 set parametric;unset label
 set log y;set log x; set xlabel "p21 (year-1)";set ylabel "p13 (year-1)"
-set ter png small size 320, 240
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar121-13.png"
-set label "65" at   2.481e-01,  1.597e-02 center
-# Age 65, p21 - p13
-plot [-pi:pi]   2.481e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  3.883e-02*cos(t)+ -2.210e-03*  1.821e-03*sin(t)),   1.597e-02 +2.000*(  2.210e-03*  3.883e-02*cos(t)+  1.000e+00*  1.821e-03*sin(t)) not
+set ter svg size 640, 480
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-13.svg"
+set label "70" at   2.047e-01,  2.140e-02 center
 # Age 70, p21 - p13
-set label "70" at   2.084e-01,  2.117e-02 center
-replot   2.084e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  2.492e-02*cos(t)+ -2.683e-03*  1.773e-03*sin(t)),   2.117e-02 +2.000*(  2.683e-03*  2.492e-02*cos(t)+  1.000e+00*  1.773e-03*sin(t)) not
+plot [-pi:pi]   2.047e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  2.492e-02*cos(t)+ -2.081e-03*  1.781e-03*sin(t)),   2.140e-02 +2.000*(  2.081e-03*  2.492e-02*cos(t)+  1.000e+00*  1.781e-03*sin(t)) not
 # Age 75, p21 - p13
-set label "75" at   1.749e-01,  2.803e-02 center
-replot   1.749e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  1.485e-02*cos(t)+ -2.605e-03*  1.622e-03*sin(t)),   2.803e-02 +2.000*(  2.605e-03*  1.485e-02*cos(t)+  1.000e+00*  1.622e-03*sin(t)) not
+set label "75" at   1.730e-01,  2.808e-02 center
+replot   1.730e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  1.492e-02*cos(t)+ -2.295e-03*  1.606e-03*sin(t)),   2.808e-02 +2.000*(  2.295e-03*  1.492e-02*cos(t)+  1.000e+00*  1.606e-03*sin(t)) not
 # Age 80, p21 - p13
-set label "80" at   1.467e-01,  3.707e-02 center
-replot   1.467e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  8.412e-03*cos(t)+ -4.929e-03*  1.650e-03*sin(t)),   3.707e-02 +2.000*(  4.929e-03*  8.412e-03*cos(t)+  1.000e+00*  1.650e-03*sin(t)) not
+set label "80" at   1.462e-01,  3.681e-02 center
+replot   1.462e-01+ 2.000*(  1.000e+00*  8.448e-03*cos(t)+ -5.527e-03*  1.619e-03*sin(t)),   3.681e-02 +2.000*(  5.527e-03*  8.448e-03*cos(t)+  1.000e+00*  1.619e-03*sin(t)) not
 # Age 85, p21 - p13
-set label "85" at   1.230e-01,  4.893e-02 center
-replot   1.230e-01+ 2.000*(  9.992e-01*  6.267e-03*cos(t)+ -3.981e-02*  2.636e-03*sin(t)),   4.893e-02 +2.000*(  3.981e-02*  6.267e-03*cos(t)+  9.992e-01*  2.636e-03*sin(t)) not
+set label "85" at   1.235e-01,  4.816e-02 center
+replot   1.235e-01+ 2.000*(  9.994e-01*  6.288e-03*cos(t)+ -3.508e-02*  2.591e-03*sin(t)),   4.816e-02 +2.000*(  3.508e-02*  6.288e-03*cos(t)+  9.994e-01*  2.591e-03*sin(t)) not
 # Age 90, p21 - p13
-set label "90" at   1.031e-01,  6.441e-02 center
-replot   1.031e-01+ 2.000*(  9.921e-01*  7.441e-03*cos(t)+ -1.255e-01*  5.013e-03*sin(t)),   6.441e-02 +2.000*(  1.255e-01*  7.441e-03*cos(t)+  9.921e-01*  5.013e-03*sin(t)) not
+set label "90" at   1.042e-01,  6.283e-02 center
+replot   1.042e-01+ 2.000*(  9.956e-01*  7.558e-03*cos(t)+ -9.337e-02*  4.919e-03*sin(t)),   6.283e-02 +2.000*(  9.337e-02*  7.558e-03*cos(t)+  9.956e-01*  4.919e-03*sin(t)) not
 # Age 95, p21 - p13
-set label "95" at   8.634e-02,  8.441e-02 center
-replot   8.634e-02+ 2.000*(  6.785e-01*  9.541e-03*cos(t)+ -7.346e-01*  8.651e-03*sin(t)),   8.441e-02 +2.000*(  7.346e-01*  9.541e-03*cos(t)+  6.785e-01*  8.651e-03*sin(t)) not
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar121-13.png";replot;
+set label "95" at   8.796e-02,  8.159e-02 center
+replot   8.796e-02+ 2.000*(  8.858e-01*  9.520e-03*cos(t)+ -4.641e-01*  8.679e-03*sin(t)),   8.159e-02 +2.000*(  4.641e-01*  9.520e-03*cos(t)+  8.858e-01*  8.679e-03*sin(t)) not
+set out;
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_121-13.svg";replot;set out;
+# Ellipsoids of confidence
+#
+
 set parametric;unset label
 set log y;set log x; set xlabel "p23 (year-1)";set ylabel "p13 (year-1)"
-set ter png small size 320, 240
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar123-13.png"
-set label "65" at   1.338e-01,  1.597e-02 center
-# Age 65, p23 - p13
-plot [-pi:pi]   1.338e-01+ 2.000*(  9.991e-01*  1.769e-02*cos(t)+  4.256e-02*  1.662e-03*sin(t)),   1.597e-02 +2.000*( -4.256e-02*  1.769e-02*cos(t)+  9.991e-01*  1.662e-03*sin(t)) not
+set ter svg size 640, 480
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-13.svg"
+set label "70" at   1.406e-01,  2.140e-02 center
 # Age 70, p23 - p13
-set label "70" at   1.460e-01,  2.117e-02 center
-replot   1.460e-01+ 2.000*(  9.986e-01*  1.541e-02*cos(t)+  5.267e-02*  1.580e-03*sin(t)),   2.117e-02 +2.000*( -5.267e-02*  1.541e-02*cos(t)+  9.986e-01*  1.580e-03*sin(t)) not
+plot [-pi:pi]   1.406e-01+ 2.000*(  9.985e-01*  1.494e-02*cos(t)+  5.556e-02*  1.579e-03*sin(t)),   2.140e-02 +2.000*( -5.556e-02*  1.494e-02*cos(t)+  9.985e-01*  1.579e-03*sin(t)) not
 # Age 75, p23 - p13
-set label "75" at   1.591e-01,  2.803e-02 center
-replot   1.591e-01+ 2.000*(  9.977e-01*  1.273e-02*cos(t)+  6.800e-02*  1.375e-03*sin(t)),   2.803e-02 +2.000*( -6.800e-02*  1.273e-02*cos(t)+  9.977e-01*  1.375e-03*sin(t)) not
+set label "75" at   1.542e-01,  2.808e-02 center
+replot   1.542e-01+ 2.000*(  9.976e-01*  1.240e-02*cos(t)+  6.965e-02*  1.358e-03*sin(t)),   2.808e-02 +2.000*( -6.965e-02*  1.240e-02*cos(t)+  9.976e-01*  1.358e-03*sin(t)) not
 # Age 80, p23 - p13
-set label "80" at   1.734e-01,  3.707e-02 center
-replot   1.734e-01+ 2.000*(  9.950e-01*  9.861e-03*cos(t)+  9.978e-02*  1.332e-03*sin(t)),   3.707e-02 +2.000*( -9.978e-02*  9.861e-03*cos(t)+  9.950e-01*  1.332e-03*sin(t)) not
+set label "80" at   1.690e-01,  3.681e-02 center
+replot   1.690e-01+ 2.000*(  9.951e-01*  9.643e-03*cos(t)+  9.913e-02*  1.314e-03*sin(t)),   3.681e-02 +2.000*( -9.913e-02*  9.643e-03*cos(t)+  9.951e-01*  1.314e-03*sin(t)) not
 # Age 85, p23 - p13
-set label "85" at   1.889e-01,  4.893e-02 center
-replot   1.889e-01+ 2.000*(  9.810e-01*  7.672e-03*cos(t)+  1.938e-01*  2.231e-03*sin(t)),   4.893e-02 +2.000*( -1.938e-01*  7.672e-03*cos(t)+  9.810e-01*  2.231e-03*sin(t)) not
+set label "85" at   1.851e-01,  4.816e-02 center
+replot   1.851e-01+ 2.000*(  9.815e-01*  7.522e-03*cos(t)+  1.914e-01*  2.205e-03*sin(t)),   4.816e-02 +2.000*( -1.914e-01*  7.522e-03*cos(t)+  9.815e-01*  2.205e-03*sin(t)) not
 # Age 90, p23 - p13
-set label "90" at   2.057e-01,  6.441e-02 center
-replot   2.057e-01+ 2.000*(  9.336e-01*  8.471e-03*cos(t)+  3.582e-01*  4.337e-03*sin(t)),   6.441e-02 +2.000*( -3.582e-01*  8.471e-03*cos(t)+  9.336e-01*  4.337e-03*sin(t)) not
+set label "90" at   2.028e-01,  6.283e-02 center
+replot   2.028e-01+ 2.000*(  9.340e-01*  8.361e-03*cos(t)+  3.573e-01*  4.223e-03*sin(t)),   6.283e-02 +2.000*( -3.573e-01*  8.361e-03*cos(t)+  9.340e-01*  4.223e-03*sin(t)) not
 # Age 95, p23 - p13
-set label "95" at   2.238e-01,  8.441e-02 center
-replot   2.238e-01+ 2.000*(  9.049e-01*  1.305e-02*cos(t)+  4.257e-01*  8.023e-03*sin(t)),   8.441e-02 +2.000*( -4.257e-01*  1.305e-02*cos(t)+  9.049e-01*  8.023e-03*sin(t)) not
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar123-13.png";replot;
+set label "95" at   2.219e-01,  8.159e-02 center
+replot   2.219e-01+ 2.000*(  9.094e-01*  1.298e-02*cos(t)+  4.159e-01*  7.733e-03*sin(t)),   8.159e-02 +2.000*( -4.159e-01*  1.298e-02*cos(t)+  9.094e-01*  7.733e-03*sin(t)) not
+set out;
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-13.svg";replot;set out;
+# Ellipsoids of confidence
+#
+
 set parametric;unset label
 set log y;set log x; set xlabel "p23 (year-1)";set ylabel "p21 (year-1)"
-set ter png small size 320, 240
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar123-21.png"
-set label "65" at   1.338e-01,  2.481e-01 center
-# Age 65, p23 - p21
-plot [-pi:pi]   1.338e-01+ 2.000*(  8.647e-03*  3.884e-02*cos(t)+  1.000e+00*  1.767e-02*sin(t)),   2.481e-01 +2.000*( -1.000e+00*  3.884e-02*cos(t)+  8.647e-03*  1.767e-02*sin(t)) not
+set ter svg size 640, 480
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-21.svg"
+set label "70" at   1.406e-01,  2.047e-01 center
 # Age 70, p23 - p21
-set label "70" at   1.460e-01,  2.084e-01 center
-replot   1.460e-01+ 2.000*(  1.255e-02*  2.493e-02*cos(t)+  9.999e-01*  1.539e-02*sin(t)),   2.084e-01 +2.000*( -9.999e-01*  2.493e-02*cos(t)+  1.255e-02*  1.539e-02*sin(t)) not
+plot [-pi:pi]   1.406e-01+ 2.000*(  3.099e-02*  2.492e-02*cos(t)+  9.995e-01*  1.490e-02*sin(t)),   2.047e-01 +2.000*( -9.995e-01*  2.492e-02*cos(t)+  3.099e-02*  1.490e-02*sin(t)) not
 # Age 75, p23 - p21
-set label "75" at   1.591e-01,  1.749e-01 center
-replot   1.591e-01+ 2.000*(  4.580e-02*  1.486e-02*cos(t)+  9.990e-01*  1.270e-02*sin(t)),   1.749e-01 +2.000*( -9.990e-01*  1.486e-02*cos(t)+  4.580e-02*  1.270e-02*sin(t)) not
+set label "75" at   1.542e-01,  1.730e-01 center
+replot   1.542e-01+ 2.000*(  8.468e-02*  1.494e-02*cos(t)+  9.964e-01*  1.235e-02*sin(t)),   1.730e-01 +2.000*( -9.964e-01*  1.494e-02*cos(t)+  8.468e-02*  1.235e-02*sin(t)) not
 # Age 80, p23 - p21
-set label "80" at   1.734e-01,  1.467e-01 center
-replot   1.734e-01+ 2.000*(  9.957e-01*  9.824e-03*cos(t)+  9.255e-02*  8.399e-03*sin(t)),   1.467e-01 +2.000*( -9.255e-02*  9.824e-03*cos(t)+  9.957e-01*  8.399e-03*sin(t)) not
+set label "80" at   1.690e-01,  1.462e-01 center
+replot   1.690e-01+ 2.000*(  9.896e-01*  9.619e-03*cos(t)+  1.436e-01*  8.421e-03*sin(t)),   1.462e-01 +2.000*( -1.436e-01*  9.619e-03*cos(t)+  9.896e-01*  8.421e-03*sin(t)) not
 # Age 85, p23 - p21
-set label "85" at   1.889e-01,  1.230e-01 center
-replot   1.889e-01+ 2.000*(  9.875e-01*  7.569e-03*cos(t)+  1.578e-01*  6.226e-03*sin(t)),   1.230e-01 +2.000*( -1.578e-01*  7.569e-03*cos(t)+  9.875e-01*  6.226e-03*sin(t)) not
+set label "85" at   1.851e-01,  1.235e-01 center
+replot   1.851e-01+ 2.000*(  9.870e-01*  7.423e-03*cos(t)+  1.606e-01*  6.252e-03*sin(t)),   1.235e-01 +2.000*( -1.606e-01*  7.423e-03*cos(t)+  9.870e-01*  6.252e-03*sin(t)) not
 # Age 90, p23 - p21
-set label "90" at   2.057e-01,  1.031e-01 center
-replot   2.057e-01+ 2.000*(  9.508e-01*  8.134e-03*cos(t)+  3.099e-01*  7.328e-03*sin(t)),   1.031e-01 +2.000*( -3.099e-01*  8.134e-03*cos(t)+  9.508e-01*  7.328e-03*sin(t)) not
+set label "90" at   2.028e-01,  1.042e-01 center
+replot   2.028e-01+ 2.000*(  9.136e-01*  8.053e-03*cos(t)+  4.065e-01*  7.432e-03*sin(t)),   1.042e-01 +2.000*( -4.065e-01*  8.053e-03*cos(t)+  9.136e-01*  7.432e-03*sin(t)) not
 # Age 95, p23 - p21
-set label "95" at   2.238e-01,  8.634e-02 center
-replot   2.238e-01+ 2.000*(  9.979e-01*  1.231e-02*cos(t)+  6.495e-02*  9.056e-03*sin(t)),   8.634e-02 +2.000*( -6.495e-02*  1.231e-02*cos(t)+  9.979e-01*  9.056e-03*sin(t)) not
-set out "biaspar/varpijgrbiaspar123-21.png";replot;
+set label "95" at   2.219e-01,  8.796e-02 center
+replot   2.219e-01+ 2.000*(  9.960e-01*  1.226e-02*cos(t)+  8.959e-02*  9.318e-03*sin(t)),   8.796e-02 +2.000*( -8.959e-02*  1.226e-02*cos(t)+  9.960e-01*  9.318e-03*sin(t)) not
+set out;
+set out "biaspar/VARPIJGR_biaspar_123-21.svg";replot;set out;
+# Routine varevsij
+unset title 
+
+unset parametric;unset label; set ter svg size 640, 480
+ set log y; unset log x;set xlabel "Age"; set ylabel "Force of mortality (year-1)";
+set out "biaspar/VARMUPTJGR--STABLBASED_biaspar1.svg";
+ plot "biaspar/PRMORPREV-1-STABLBASED_biaspar.txt"  u 1:($3) not w l lt 1 
+ replot "biaspar/PRMORPREV-1-STABLBASED_biaspar.txt"  u 1:(($3+1.96*$4)) t "95% interval" w l lt 2 
+ replot "biaspar/PRMORPREV-1-STABLBASED_biaspar.txt"  u 1:(($3-1.96*$4)) not w l lt 2 
+set out;
+set out "biaspar/VARMUPTJGR--STABLBASED_biaspar1.svg";replot;set out;
+
 # Routine varevsij
-unset parametric;unset label; set ter png small size 320, 240
+unset title 
+
+unset parametric;unset label; set ter svg size 640, 480
  set log y; unset log x;set xlabel "Age"; set ylabel "Force of mortality (year-1)";
- plot "biaspar/prmorprev1-stablbased-rbiaspar.txt"  u 1:($3) not w l lt 1 
- replot "biaspar/prmorprev1-stablbased-rbiaspar.txt"  u 1:(($3+1.96*$4)) t "95% interval" w l lt 2 
- replot "biaspar/prmorprev1-stablbased-rbiaspar.txt"  u 1:(($3-1.96*$4)) not w l lt 2 
-set out "biaspar/varmuptjgr-stablbased-biaspar1.png";replot;
+set out "biaspar/VARMUPTJGR--POPULBASED-NOMOBIL_biaspar1.svg";
+ plot "biaspar/PRMORPREV-1-POPULBASED-NOMOBIL_biaspar.txt"  u 1:($3) not w l lt 1 
+ replot "biaspar/PRMORPREV-1-POPULBASED-NOMOBIL_biaspar.txt"  u 1:(($3+1.96*$4)) t "95% interval" w l lt 2 
+ replot "biaspar/PRMORPREV-1-POPULBASED-NOMOBIL_biaspar.txt"  u 1:(($3-1.96*$4)) not w l lt 2 
+set out;
+set out "biaspar/VARMUPTJGR--POPULBASED-NOMOBIL_biaspar1.svg";replot;set out;
index a7b053f0064d204ec1fb050e5d9f6eccdf2b238e..6921d63a9afd4db82b55ad86adeaa1cad626303b 100644 (file)
 <html><head>
+<head>
+<meta charset="utf-8"/><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
 <title>IMaCh biaspar.htm</title></head>
- <body><font size="2">Imach version 0.98q5, August 2015,INED-EUROREVES-Institut de longevite-Japan Society for the Promotion of Science (Grant-in-Aid for Scientific Research 25293121), Intel Software 2015 <br> $Revision$ $Date$</font> <hr size="2" color="#EC5E5E"> 
-Title=1st_example <br>Datafile=data1.txt Firstpass=1 Lastpass=4 Stepm=1 Weight=0 Model=<br>
+ <body><font size="7"><a href=http:/euroreves.ined.fr/imach>IMaCh for Interpolated Markov Chain</a> </font><br>
+<font size="3">Sponsored by Copyright (C)  2002-2015 <a href=http://www.ined.fr>INED</a>-EUROREVES-Institut de longévité-2013-2016-Japan Society for the Promotion of Sciences æ—¥æœ¬å­¦è¡“振興会 (<a href=https://www.jsps.go.jp/english/e-grants/>Grant-in-Aid for Scientific Research 25293121</a>) - <a href=https://software.intel.com/en-us>Intel Software 2015-2018</a></font><br>  <hr size="2" color="#EC5E5E"> 
+<font size="2">IMaCh-0.99r19 <br> $Revision$ $Date$</font> <hr size="2" color="#EC5E5E"> 
+Title=1st_example <br>Datafile=data1.txt Firstpass=1 Lastpass=4 Stepm=1 Weight=0 Model=1+age+<br>
 
 <hr  size="2" color="#EC5E5E"> <ul><li><h4>Parameter files</h4>
  - Parameter file: <a href="biaspar.imach">biaspar.imach</a><br>
  - Copy of the parameter file: <a href="orbiaspar.txt">orbiaspar.txt</a><br>
  - Log file of the run: <a href="biaspar.log">biaspar.log</a><br>
  - Gnuplot file name: <a href="biaspar.gp">biaspar.gp</a><br>
- - Date and time at start: Tue Aug 18 18:20:44 2015
+ - Date and time at start: Wed May 22 22:32:36 2019
 </ul>
 
+<h4>Parameter line 2</h4><ul><li>Tolerance for the convergence of the likelihood: ftol=1e-08 
+<li>Interval for the elementary matrix (in month): stepm=1
+<li>Number of fixed dummy covariates: ncovcol=2 V1 V2 
+<li> Number of fixed quantitative variables: nqv=0 
+<li> Number of time varying (wave varying) dummy covariates: ntv=0 
+<li>Number of time varying  quantitative covariates: nqtv=0 
+<li>Weights column 
+<br>Number of alive states: nlstate=2 <br>Number of death states (not really implemented): ndeath=1 
+<li>Number of waves: maxwav=4 
+<li>Parameter for maximization (1), using parameter values (0), for design of parameters and variance-covariance matrix: mle=1 
+<li>Does the weight column be taken into account (1), or not (0): weight=0</ul>
+<h4> Diagram of states <a href="biaspar/D_biaspar_.svg">biaspar/D_biaspar_.svg</a></h4> 
+<img src="biaspar/D_biaspar_.svg">
+<h4>Some descriptive statistics </h4>
 <br>Total number of observations=8270 <br>
 Youngest age at first (selected) pass 70.00, oldest age 104.17<br>
-Interval (in months) between two waves: Min=1 Max=74 Mean=24.04<br>
+Interval (in months) between two waves: Min=1 Max=74 Mean=24.06<br>
 
-<br>File of contributions to the likelihood: <a href="biaspar/ilkrbiaspar.txt">biaspar/ilkrbiaspar.txt</a><br>
-<ul><li><a href='#firstorder'>Result files (first order: no variance)</a>
+<br>File of contributions to the likelihood computed with optimized parameters mle = 1. You should at least run with mle >= 1 to get starting values corresponding to the optimized parameters in order to visualize the real contribution of each individual/wave: <a href="biaspar/ILK_biaspar.txt">biaspar/ILK_biaspar.txt</a><br>
+
+<br>Equation of the model: <b>model=1+age+</b><br>
+<br>- Probability p<sub>1j</sub> by origin 1 and destination j. Dot's sizes are related to corresponding weight: <a href="biaspar/ILK_biaspar-p1j.png">biaspar/ILK_biaspar-p1j.png</a><br> <img src="biaspar/ILK_biaspar-p1j.png"><br>- Probability p<sub>2j</sub> by origin 2 and destination j. Dot's sizes are related to corresponding weight: <a href="biaspar/ILK_biaspar-p2j.png">biaspar/ILK_biaspar-p2j.png</a><br> <img src="biaspar/ILK_biaspar-p2j.png"><br>- The function drawn is -2Log(L) in Log scale: by state of origin <a href="biaspar/ILK_biaspar-ori.png">biaspar/ILK_biaspar-ori.png</a><br> <img src="biaspar/ILK_biaspar-ori.png"><br>- and by state of destination <a href="biaspar/ILK_biaspar-dest.png">biaspar/ILK_biaspar-dest.png</a><br> <img src="biaspar/ILK_biaspar-dest.png"><ul><li><a href='#firstorder'>Result files (first order: no variance)</a>
     <li><a href='#secondorder'>Result files (second order (variance)</a>
+ </ul><ul><li> model=1+age+
  </ul><ul><li><h4><a name='firstorder'>Result files (first order: no variance)</a></h4>
-  - Observed prevalence in each state (during the period defined between 1/1/1984 and 1/6/1988): <a href="biaspar/prbiaspar.txt">biaspar/prbiaspar.txt</a> <br>
-  - Estimated transition probabilities over 1 (stepm) months: <a href="biaspar/pijrbiaspar.txt">biaspar/pijrbiaspar.txt</a><br>
-  - Period (stable) prevalence in each health state: <a href="biaspar/plrbiaspar.txt">biaspar/plrbiaspar.txt</a> <br>
- - (a) Life expectancies by health status at initial age, ei. (b) health expectancies by health status at initial age, eij . If one or more covariates are included, specific tables for each value of the covariate are output in sequences within the same file (estepm= 1 months):    <a href="biaspar/erbiaspar.txt">biaspar/erbiaspar.txt</a> <br>
- - Population projections by age and states:    <a href="biaspar/frbiaspar.txt">biaspar/frbiaspar.txt</a> <br>
+<li>- Observed frequency between two states (during the period defined between 1/1/1984 and 1/6/1988): <a href="biaspar/PHTMFR_biaspar.htm">biaspar/PHTMFR_biaspar.htm</a> (html file)<br/>
+<li> - Observed prevalence in each state (during the period defined between 1/1/1984 and 1/6/1988): <a href="biaspar/PHTM_biaspar.htm">biaspar/PHTM_biaspar.htm</a> (html file) ,  <a href="biaspar/P_biaspar.txt">biaspar/P_biaspar.txt</a> (text file) <br>
+ - Estimated transition probabilities over 1 (stepm) months: <a href="biaspar/PIJ_biaspar.txt">biaspar/PIJ_biaspar.txt</a><br>
+  - Estimated back transition probabilities over 1 (stepm) months: <a href="biaspar/PIJB_biaspar.txt">biaspar/PIJB_biaspar.txt</a><br>
+  - Period (forward) prevalence in each health state: <a href="biaspar/PL_biaspar.txt">biaspar/PL_biaspar.txt</a> <br>
+ - Backward prevalence in each health state: <a href="biaspar/PLB_biaspar.txt">biaspar/PLB_biaspar.txt</a> <br>
+ - (a) Life expectancies by health status at initial age, e<sub>i.</sub> (b) health expectancies by health status at initial age, e<sub>ij</sub> . If one or more covariates are included, specific tables for each value of the covariate are output in sequences within the same file (estepm= 1 months):    <a href="biaspar/E_biaspar.txt">biaspar/E_biaspar.txt</a> <br>
+ - Prevalence projections by age and states:                              <a href="biaspar/F_biaspar.txt">biaspar/F_biaspar.txt</a> <br>
 </li> 
-<ul><li><b>Graphs</b></li><p><br>- Pij or Conditional probabilities to be observed in state j being in state i, 1 (stepm) months before: <a href="biaspar/pebiaspar1_1.png">biaspar/pebiaspar1_1.png</a><br> <img src="biaspar/pebiaspar1_1.png"><br>- Pij or Conditional probabilities to be observed in state j being in state i 1 (stepm) months before but expressed in per year i.e. quasi incidences if stepm is small and probabilities too: <a href="biaspar/pebiaspar1_2.png">biaspar/pebiaspar1_2.png</a><br> <img src="biaspar/pebiaspar1_2.png"><br>- Convergence to period (stable) prevalence in state 1. Or probability to be in state 1 being in state (1 to 2) at different ages. <a href="biaspar/pbiaspar1_1.png">biaspar/pbiaspar1_1.png</a><br> <img src="biaspar/pbiaspar1_1.png"><br>- Convergence to period (stable) prevalence in state 2. Or probability to be in state 2 being in state (1 to 2) at different ages. <a href="biaspar/pbiaspar2_1.png">biaspar/pbiaspar2_1.png</a><br> <img src="biaspar/pbiaspar2_1.png">
-<br>- Life expectancy by health state (1) at initial age and its decomposition into health expectancies in each alive state (1 to 2) : <a href="biaspar/expbiaspar11.png">biaspar/expbiaspar11.png</a> <br> <img src="biaspar/expbiaspar11.png">
-<br>- Life expectancy by health state (2) at initial age and its decomposition into health expectancies in each alive state (1 to 2) : <a href="biaspar/expbiaspar21.png">biaspar/expbiaspar21.png</a> <br> <img src="biaspar/expbiaspar21.png"></ul>
+<ul><li><b>Graphs</b></li><p> 
+<ul> 
+</ul><br>- Logit model (yours is: logit(pij)=log(pij/pii)= aij+ bij age+) as a function of age: <a href="biaspar/PE_biaspar_1-1-1.svg">biaspar/PE_biaspar_1-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/PE_biaspar_1-1-1.svg"><br>
+- P<sub>ij</sub> or conditional probabilities to be observed in state j being in state i, 1 (stepm) months before: <a href="biaspar/PE_biaspar_1-2-1.svg">biaspar/PE_biaspar_1-2-1.svg</a><br> <img src="biaspar/PE_biaspar_1-2-1.svg"><br>
+- I<sub>ij</sub> or Conditional probabilities to be observed in state j being in state i 1 (stepm) months before but expressed in per year i.e. quasi incidences if stepm is small and probabilities too,  incidence (rates) are the limit when h tends to zero of the ratio of the probability  <sub>h</sub>P<sub>ij</sub> divided by h: <sub>h</sub>P<sub>ij</sub>/h : <a href="biaspar/PE_biaspar_1-3-1.svg">biaspar/PE_biaspar_1-3-1.svg</a><br> <img src="biaspar/PE_biaspar_1-3-1.svg"><br>
+- Survival functions in state 1. And probability to be observed in state 1 being in state (1 to 2) at different ages. <a href="biaspar/LIJ_biaspar_1-1-1.svg">biaspar/LIJ_biaspar_1-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/LIJ_biaspar_1-1-1.svg"><br>
+- Survival functions in state 2. And probability to be observed in state 2 being in state (1 to 2) at different ages. <a href="biaspar/LIJ_biaspar_2-1-1.svg">biaspar/LIJ_biaspar_2-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/LIJ_biaspar_2-1-1.svg"><br>
+- Survival functions in state 1 and in any other live state (total). And probability to be observed in various states (up to 2) being in state 1 at different ages.     <a href="biaspar/LIJT_biaspar_1-1-1.svg">biaspar/LIJT_biaspar_1-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/LIJT_biaspar_1-1-1.svg"><br>
+- Survival functions in state 2 and in any other live state (total). And probability to be observed in various states (up to 2) being in state 2 at different ages.     <a href="biaspar/LIJT_biaspar_2-1-1.svg">biaspar/LIJT_biaspar_2-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/LIJT_biaspar_2-1-1.svg"><br>
+- Convergence to period (stable) prevalence in state 1. Or probability for a person being in state (1 to 2) at different ages, to be in state 1 some years after. <a href="biaspar/P_biaspar_1-1-1.svg">biaspar/P_biaspar_1-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/P_biaspar_1-1-1.svg"><br>
+- Convergence to period (stable) prevalence in state 2. Or probability for a person being in state (1 to 2) at different ages, to be in state 2 some years after. <a href="biaspar/P_biaspar_2-1-1.svg">biaspar/P_biaspar_2-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/P_biaspar_2-1-1.svg"><br>
+- Projection of cross-sectional prevalence (estimated with cases observed from 1984.0 to 1988.4 and mobil_average=0), from year 1989.0 up to year 2000.0 tending to period (stable) forward prevalence in state 1. Or probability to be in state 1 being in an observed weighted state (from 1 to 2). <a href="biaspar/PROJ_biaspar_1-1-1.svg">biaspar/PROJ_biaspar_1-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/PROJ_biaspar_1-1-1.svg"><br>
+- Projection of cross-sectional prevalence (estimated with cases observed from 1984.0 to 1988.4 and mobil_average=0), from year 1989.0 up to year 2000.0 tending to period (stable) forward prevalence in state 2. Or probability to be in state 2 being in an observed weighted state (from 1 to 2). <a href="biaspar/PROJ_biaspar_2-1-1.svg">biaspar/PROJ_biaspar_2-1-1.svg</a><br> <img src="biaspar/PROJ_biaspar_2-1-1.svg">
+<br>- Life expectancy by health state (1) at initial age and its decomposition into health expectancies in each alive state (1 to 2) (or area under each survival functions): <a href="biaspar/EXP_biaspar_1-1-1.svg">biaspar/EXP_biaspar_1-1-1.svg</a> <br> <img src="biaspar/EXP_biaspar_1-1-1.svg">
+<br>- Life expectancy by health state (2) at initial age and its decomposition into health expectancies in each alive state (1 to 2) (or area under each survival functions): <a href="biaspar/EXP_biaspar_2-1-1.svg">biaspar/EXP_biaspar_2-1-1.svg</a> <br> <img src="biaspar/EXP_biaspar_2-1-1.svg"></ul>
 <br><li><h4> <a name='secondorder'>Result files (second order: variances)</a></h4>
- - Parameter file with estimated parameters and covariance matrix: <a href="rbiaspar.imach">rbiaspar.imach</a> <br>  - 95% confidence intervals and T statistics are in the log file.<br>
- - Standard deviation of one-step probabilities: <a href="biaspar/probrbiaspar.txt">biaspar/probrbiaspar.txt</a> <br>
- - Variance-covariance of one-step probabilities: <a href="biaspar/probcovrbiaspar.txt">biaspar/probcovrbiaspar.txt</a> <br>
- - Correlation matrix of one-step probabilities: <a href="biaspar/probcorrbiaspar.txt">biaspar/probcorrbiaspar.txt</a> <br>
- - Variances and covariances of health expectancies by age and <b>initial health status</b> (cov(e<sup>ij</sup>,e<sup>kl</sup>)(estepm= 1 months):    <a href="biaspar/cverbiaspar.txt">biaspar/cverbiaspar.txt</a> <br>
-</li> - (a) Health expectancies by health status at initial age (e<sup>ij</sup>) and standard errors (in parentheses) (b) life expectancies and standard errors (e<sup>i.</sup>=e<sup>i1</sup>+e<sup>i2</sup>+...)(estepm= 1 months):    <a href="biaspar/stderbiaspar.txt">biaspar/stderbiaspar.txt</a> <br>
-</li> - Variances and covariances of health expectancies by age. Status (i) based health expectancies (in state j), e<sup>ij</sup> are weighted by the period prevalences in each state i (if popbased=1, an additional computation is done using the cross-sectional prevalences, i.e population based) (estepm=1 months): <a href="biaspar/vrbiaspar.txt">biaspar/vrbiaspar.txt</a><br>
- - Total life expectancy and total health expectancies to be spent in each health state e<sup>.j</sup> with their standard errors (if popbased=1, an additional computation is done using the cross-sectional prevalences, i.e population based) (estepm=1 months): <a href="biaspar/trbiaspar.txt">biaspar/trbiaspar.txt</a> <br>
- - Standard deviation of period (stable) prevalences: <a href="biaspar/vplrbiaspar.txt">biaspar/vplrbiaspar.txt</a> <br>
- <ul><li><b>Graphs</b></li><p><br>- Observed (cross-sectional) and period (incidence based) prevalence (with 95% confidence interval) in state (1): biaspar/vbiaspar1_1.png <br><img src="biaspar/vbiaspar1_1.png"><br>- Observed (cross-sectional) and period (incidence based) prevalence (with 95% confidence interval) in state (2): biaspar/vbiaspar2_1.png <br><img src="biaspar/vbiaspar2_1.png">
-<br>- Total life expectancy by age and health expectancies in states (1) and (2). If popbased=1 the smooth (due to the model) true period expectancies (those weighted with period prevalences are also drawn in addition to the population based expectancies computed using observed and cahotic prevalences: biaspar/ebiaspar1.png<br><img src="biaspar/ebiaspar1.png"></ul>
+ - Parameter file with estimated parameters and covariance matrix: <a href="rbiaspar.imach">rbiaspar.imach</a> <br>  - 95% confidence intervals and Wald tests of the estimated parameters are in the log file if optimization has been done (mle != 0).<br> But because parameters are usually highly correlated (a higher incidence of disability and a higher incidence of recovery can give very close observed transition) it might be very useful to look not only at linear confidence intervals estimated from the variances but at the covariance matrix. And instead of looking at the estimated coefficients (parameters) of the logistic regression, it might be more meaningful to visualize the covariance matrix of the one-step probabilities. See page 'Matrix of variance-covariance of one-step probabilities' below. 
+ - Standard deviation of one-step probabilities: <a href="biaspar/PROB_biaspar.txt">biaspar/PROB_biaspar.txt</a> <br>
+ - Variance-covariance of one-step probabilities: <a href="biaspar/PROBCOV_biaspar.txt">biaspar/PROBCOV_biaspar.txt</a> <br>
+ - Correlation matrix of one-step probabilities: <a href="biaspar/PROBCOR_biaspar.txt">biaspar/PROBCOR_biaspar.txt</a> <br>
+ - Variances and covariances of health expectancies by age and <b>initial health status</b> (cov(e<sup>ij</sup>,e<sup>kl</sup>)(estepm= 1 months):    <a href="biaspar/CVE_biaspar.txt">biaspar/CVE_biaspar.txt</a> <br>
+</li> - (a) Health expectancies by health status at initial age (e<sup>ij</sup>) and standard errors (in parentheses) (b) life expectancies and standard errors (e<sup>i.</sup>=e<sup>i1</sup>+e<sup>i2</sup>+...)(estepm= 1 months):    <a href="biaspar/STDE_biaspar.txt">biaspar/STDE_biaspar.txt</a> <br>
+</li> - Variances and covariances of health expectancies by age. Status (i) based health expectancies (in state j), e<sup>ij</sup> are weighted by the forward (period) prevalences in each state i (if popbased=1, an additional computation is done using the cross-sectional prevalences, i.e population based) (estepm=1 months): <a href="biaspar/V_biaspar.txt">biaspar/V_biaspar.txt</a><br>
+ - Total life expectancy and total health expectancies to be spent in each health state e<sup>.j</sup> with their standard errors (if popbased=1, an additional computation is done using the cross-sectional prevalences, i.e population based) (estepm=1 months): <a href="biaspar/T_biaspar.txt">biaspar/T_biaspar.txt</a> <br>
+ - Standard deviation of forward (period) prevalences: <a href="biaspar/VPL_biaspar.txt">biaspar/VPL_biaspar.txt</a> <br>
+ <ul><li><b>Graphs</b></li><p>
+<br>- Observed (cross-sectional with mov_average=0) and period (incidence based) prevalence (with 95% confidence interval) in state (1): <a href="biaspar/V_biaspar_1-1-1.svg"> biaspar/V_biaspar_1-1-1.svg</a>
+ <br><img src="biaspar/V_biaspar_1-1-1.svg">
+<br>- Observed (cross-sectional with mov_average=0) and period (incidence based) prevalence (with 95% confidence interval) in state (2): <a href="biaspar/V_biaspar_2-1-1.svg"> biaspar/V_biaspar_2-1-1.svg</a>
+ <br><img src="biaspar/V_biaspar_2-1-1.svg">
+<br>- Total life expectancy by age and health expectancies in states (1) and (2). If popbased=1 the smooth (due to the model) true period expectancies (those weighted with period prevalences are also drawn in addition to the population based expectancies computed using observed and cahotic prevalences:  <a href="biaspar/E_biaspar_1-1.svg">biaspar/E_biaspar_1-1.svg</a>
+<br><img src="biaspar/E_biaspar_1-1.svg"></ul>
 <li><h4> Computing and drawing one step probabilities with their confidence intervals</h4></li>
 
 
-<li><h4> <a href="biaspar-cov.htm">Matrix of variance-covariance of pairs of step probabilities (drawings)</a></h4></li>
+<li><h4> <a href="biaspar-cov.htm">Matrix of variance-covariance of one-step probabilities (drawings)</a></h4> this page is important in order to visualize confidence intervals and especially correlation between disability and recovery, or more generally, way in and way back. File biaspar-cov.htm</li>
+
+<li><h4> Computing probabilities of dying over estepm months as a weighted average (i.e global mortality independent of initial healh state)</h4></li>
+
+<br>-STABLBASED_  <br>
+
+<br> File (multiple files are possible if covariates are present): <A href="biaspar/PRMORPREV-1-STABLBASED_biaspar.txt">biaspar/PRMORPREV-1-STABLBASED_biaspar.txt</a>
+
+<br> Probability is computed over estepm=1 months. <br> <img src="biaspar/VARMUPTJGR--STABLBASED_biaspar1.svg"> <br>
 
 <li><h4> Computing probabilities of dying over estepm months as a weighted average (i.e global mortality independent of initial healh state)</h4></li>
 
-<br>-stablbased-  <br>
+<br>-POPULBASED-NOMOBIL_  <br>
 
-<br> File (multiple files are possible if covariates are present): <A href="biaspar/prmorprev1-stablbased-rbiaspar.txt">biaspar/prmorprev1-stablbased-rbiaspar.txt</a>
+<br> File (multiple files are possible if covariates are present): <A href="biaspar/PRMORPREV-1-POPULBASED-NOMOBIL_biaspar.txt">biaspar/PRMORPREV-1-POPULBASED-NOMOBIL_biaspar.txt</a>
 
-<br> Probability is computed over estepm=1 months. <br> <img src="biaspar/varmuptjgr-stablbased-biaspar1.png"> <br>
-<br>Local time at start Tue Aug 18 18:20:44 2015
-<br>Local time at end   Tue Aug 18 18:26:33 2015
+<br> Probability is computed over estepm=1 months. <br> <img src="biaspar/VARMUPTJGR--POPULBASED-NOMOBIL_biaspar1.svg"> <br>
+<br>Local time at start Wed May 22 22:32:36 2019
+<br>Local time at end   Wed May 22 22:34:09 2019
 <br>
 </body></html>
\ No newline at end of file
index 5367613b0c9c9817e693106159d18ba5dde7fdf8..f89fa0c1e8930ba3aff29d5c11621e1daa480c6b 100644 (file)
@@ -1,44 +1,44 @@
-#0.99r10
-#Number of iterations & function calls = 33 & 6007, -2 Log likelihood = 46617.105944307616
-title=1st_example datafile=data1.txt lastobs=8600 firstpass=1 lastpass=4
-ftol=1.000000e-08 stepm=1 ncovcol=2 nqv=0 ntv=0 nqtv=0 nlstate=2 ndeath=1 maxwav=4 mle= 0 weight=0
-model=1+age+.
-# Parameters nlstate*nlstate*ncov a12*1 + b12 * age + ...
-12  -12.3175753    0.0931122 
-13  -10.1631670    0.0548384 
-21   -1.6685685   -0.0339056 
-23   -5.6869201    0.0181350 
-# Scales (for hessian or gradient estimation)
-12 2.00000e-04 2.00000e-06
-13 3.00000e-04 4.00000e-06
-21 1.00000e-04 1.00000e-06
-23 3.00000e-04 3.00000e-06
-# Covariance matrix 
-# 121 Var(a12)
-# 122 Cov(b12,a12) Var(b12)
-#   ...
-# 232 Cov(b23,a12)  Cov(b23,b12) ... Var (b23)
-#121 Var(a12)
-#122 Cov(b12,a12) Var(b12)
-#131 Cov(a13,a12) Cov(a13,b12) Var(a13)
-#132 Cov(b13,a12) Cov(b13,b12) Cov(b13,a13) Var(b13)
-#211 Cov(a21,a12) Cov(a21,b12) Cov(a21,a13) Cov(a21,b13) Var(a21)
-#212 Cov(b21,a12) Cov(b21,b12) Cov(b21,a13) Cov(b21,b13) Cov(b21,a21) Var(b21)
-#231 Cov(a23,a12) Cov(a23,b12) Cov(a23,a13) Cov(a23,b13) Cov(a23,a21) Cov(a23,b21) Var(a23)
-#232 Cov(b23,a12) Cov(b23,b12) Cov(b23,a13) Cov(b23,b13) Cov(b23,a21) Cov(b23,b21) Cov(b23,a23) Var(b23)
-121 1.0846319e-01
-122 -1.30062e-03 1.5689741e-05
-131 -5.39098e-02 6.59806e-04 3.0197746e-01
-132 6.43147e-04 -7.94760e-06 -3.73264e-03 4.6435109e-05
-211 7.75092e-02 -9.24613e-04 1.91004e-02 -2.45003e-04 4.7111318e-01
-212 -9.24119e-04 1.10769e-05 -2.40929e-04 3.09854e-06 -5.60404e-03 6.7019135e-05
-231 4.86258e-02 -5.50028e-04 -9.42536e-02 1.06700e-03 -2.57577e-03 2.94283e-05 2.5010261e-01
-232 -5.52529e-04 6.29410e-06 1.11646e-03 -1.27952e-05 3.55428e-05 -4.16204e-07 -2.83674e-03 3.2358065e-05
-# agemin agemax for life expectancy, bage fage (if mle==0 ie no data nor Max likelihood).
-agemin=70 agemax=95 bage=65 fage=95 estepm=1 ftolpl=6.000000e-04
-begin-prev-date=1/1/1984 end-prev-date=1/6/1988 mov_average=0
-pop_based=1
-prevforecast=1 starting-proj-date=1/1/1989 final-proj-date=1/1/2000 mobil_average=0
-#backcast=1 starting-back-date=1/1/1990 final-back-date=1/1/1970 mobil_average=1
+#0.99r10\r
+#Number of iterations & function calls = 33 & 6007, -2 Log likelihood = 46617.105944307616\r
+title=1st_example datafile=data1.txt lastobs=8600 firstpass=1 lastpass=4\r
+ftol=1.000000e-08 stepm=1 ncovcol=2 nqv=0 ntv=0 nqtv=0 nlstate=2 ndeath=1 maxwav=4 mle= 1 weight=0\r
+model=1+age+.\r
+# Parameters nlstate*nlstate*ncov a12*1 + b12 * age + ...\r
+12  -12.3175753    0.0931122 \r
+13  -10.1631670    0.0548384 \r
+21   -1.6685685   -0.0339056 \r
+23   -5.6869201    0.0181350 \r
+# Scales (for hessian or gradient estimation)\r
+12 2.00000e-04 2.00000e-06\r
+13 3.00000e-04 4.00000e-06\r
+21 1.00000e-04 1.00000e-06\r
+23 3.00000e-04 3.00000e-06\r
+# Covariance matrix \r
+# 121 Var(a12)\r
+# 122 Cov(b12,a12) Var(b12)\r
+#   ...\r
+# 232 Cov(b23,a12)  Cov(b23,b12) ... Var (b23)\r
+#121 Var(a12)\r
+#122 Cov(b12,a12) Var(b12)\r
+#131 Cov(a13,a12) Cov(a13,b12) Var(a13)\r
+#132 Cov(b13,a12) Cov(b13,b12) Cov(b13,a13) Var(b13)\r
+#211 Cov(a21,a12) Cov(a21,b12) Cov(a21,a13) Cov(a21,b13) Var(a21)\r
+#212 Cov(b21,a12) Cov(b21,b12) Cov(b21,a13) Cov(b21,b13) Cov(b21,a21) Var(b21)\r
+#231 Cov(a23,a12) Cov(a23,b12) Cov(a23,a13) Cov(a23,b13) Cov(a23,a21) Cov(a23,b21) Var(a23)\r
+#232 Cov(b23,a12) Cov(b23,b12) Cov(b23,a13) Cov(b23,b13) Cov(b23,a21) Cov(b23,b21) Cov(b23,a23) Var(b23)\r
+121 1.0846319e-01\r
+122 -1.30062e-03 1.5689741e-05\r
+131 -5.39098e-02 6.59806e-04 3.0197746e-01\r
+132 6.43147e-04 -7.94760e-06 -3.73264e-03 4.6435109e-05\r
+211 7.75092e-02 -9.24613e-04 1.91004e-02 -2.45003e-04 4.7111318e-01\r
+212 -9.24119e-04 1.10769e-05 -2.40929e-04 3.09854e-06 -5.60404e-03 6.7019135e-05\r
+231 4.86258e-02 -5.50028e-04 -9.42536e-02 1.06700e-03 -2.57577e-03 2.94283e-05 2.5010261e-01\r
+232 -5.52529e-04 6.29410e-06 1.11646e-03 -1.27952e-05 3.55428e-05 -4.16204e-07 -2.83674e-03 3.2358065e-05\r
+# agemin agemax for life expectancy, bage fage (if mle==0 ie no data nor Max likelihood).\r
+agemin=70 agemax=95 bage=70 fage=95 estepm=1 ftolpl=6.000000e-04\r
+begin-prev-date=1/1/1984 end-prev-date=1/6/1988 mov_average=0\r
+pop_based=1\r
+prevforecast=1 starting-proj-date=1/1/1989 final-proj-date=1/1/2000 mobil_average=0\r
+#backcast=1 starting-back-date=1/1/1990 final-back-date=1/1/1970 mobil_average=1\r
 # Results model=1+age.\r
-#result: .\r
+result: .\r
index 629627b2f7665f5dd6510427299a140c7a6bc835..2f1f858f1a9d4961c7f3162f3ff33e9538c301c3 100644 (file)
 Log filename:biaspar.log
-
-Imach version 0.98q5, August 2015,INED-EUROREVES-Institut de longevite-Japan Society for the Promotion of Science (Grant-in-Aid for Scientific Research 25293121), Intel Software 2015
-$Revision$ $Date$
+Version 0.99r19 $Revision$ $Date$
 Enter the parameter file name: 
-pathimach=/Users/nbrouard/Documents/imach/cvs/imach/build/osx/
-pathtot=html/doc/biaspar.imach
- path=html/doc/ 
+pathimach=/Users/nbrouard/Documents/imach/cvs/imach/html/doc/
+pathtot=biaspar.imach
+ path=/Users/nbrouard/Documents/imach/cvs/imach/html/doc/ 
  optionfile=biaspar.imach
  optionfilext=imach
  optionfilefiname='biaspar'
-Local time (at start): Tue Aug 18 18:20:44 2015
-# Imach version 0.98q2, April 2015, INED-EUROREVES \r
+Compiled with: Clang/LLVM GNU GCC/G++ for Mac OS  64-bit using GNU C version 40201.
+Running on: Darwin tugault.local 18.2.0 Darwin Kernel Version 18.2.0: Thu Dec 20 20:46:53 PST 2018; root:xnu-4903.241.1~1/RELEASE_X86_64 x86_64
+ Local time (at start): Wed May 22 22:32:36 2019
+#0.99r10\r
+#Number of iterations & function calls = 33 & 6007, -2 Log likelihood = 46617.105944307616\r
 title=1st_example datafile=data1.txt lastobs=8600 firstpass=1 lastpass=4
-ftol=1.000000e-08 stepm=1 ncovcol=2 nlstate=2 ndeath=1 maxwav=4 mle=1 weight=0
-model=1+age+.
-#q Parameters\r
-12 -12.245240 0.092358
-13 -10.671890 0.060969
-21 -2.645345 -0.022325
-23 -4.773317 0.007859
-# Scales\r
-12 0.000000e+00 0.000000e+00
-13 0.000000e+00 0.000000e+00
-21 0.000000e+00 0.000000e+00
-23 0.000000e+00 0.000000e+00
-#covariance matrix#\r
-121 0.00000e+00
-122 0.00000e+00 0.00000e+00
-131 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-132 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-211 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-212 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-231 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
-232 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00 0.00000e+00
+ftol=1.000000e-08 stepm=1 ncovcol=2 nqv=0 ntv=0 nqtv=0 nlstate=2 ndeath=1 maxwav=4 mle=1 weight=0
+model=1+age+
+# Parameters nlstate*nlstate*ncov a12*1 + b12 * age + ...\r
+12 -12.317575 0.093112
+13 -10.163167 0.054838
+21 -1.668568 -0.033906
+23 -5.686920 0.018135
+# Scales (for hessian or gradient estimation)\r
+12 2.000000e-04 2.000000e-06
+13 3.000000e-04 4.000000e-06
+21 1.000000e-04 1.000000e-06
+23 3.000000e-04 3.000000e-06
+# Covariance matrix \r
+# 121 Var(a12)\r
+# 122 Cov(b12,a12) Var(b12)\r
+#   ...\r
+# 232 Cov(b23,a12)  Cov(b23,b12) ... Var (b23)\r
+#121 Var(a12)\r
+#122 Cov(b12,a12) Var(b12)\r
+#131 Cov(a13,a12) Cov(a13,b12) Var(a13)\r
+#132 Cov(b13,a12) Cov(b13,b12) Cov(b13,a13) Var(b13)\r
+#211 Cov(a21,a12) Cov(a21,b12) Cov(a21,a13) Cov(a21,b13) Var(a21)\r
+#212 Cov(b21,a12) Cov(b21,b12) Cov(b21,a13) Cov(b21,b13) Cov(b21,a21) Var(b21)\r
+#231 Cov(a23,a12) Cov(a23,b12) Cov(a23,a13) Cov(a23,b13) Cov(a23,a21) Cov(a23,b21) Var(a23)\r
+#232 Cov(b23,a12) Cov(b23,b12) Cov(b23,a13) Cov(b23,b13) Cov(b23,a21) Cov(b23,b21) Cov(b23,a23) Var(b23)\r
+121 1.08463e-01
+122 -1.30062e-03 1.56897e-05
+131 -5.39098e-02 6.59806e-04 3.01977e-01
+132 6.43147e-04 -7.94760e-06 -3.73264e-03 4.64351e-05
+211 7.75092e-02 -9.24613e-04 1.91004e-02 -2.45003e-04 4.71113e-01
+212 -9.24119e-04 1.10769e-05 -2.40929e-04 3.09854e-06 -5.60404e-03 6.70191e-05
+231 4.86258e-02 -5.50028e-04 -9.42536e-02 1.06700e-03 -2.57577e-03 2.94283e-05 2.50103e-01
+232 -5.52529e-04 6.29410e-06 1.11646e-03 -1.27952e-05 3.55428e-05 -4.16204e-07 -2.83674e-03 3.23581e-05
 
+Covariate type in the data: V1, DummyV(V1)=0, FixedV(V1)=0
+Covariate type in the data: V2, DummyV(V2)=0, FixedV(V2)=0
+Comment line
+# Data. Two fixed dummy covariates (ncovcol=2), zero fixed quantitative covariate (nqv=0), zero time varying covariate (ntv=0), zero quantitative time varying covariate (nqtv=0)
+Comment line
+#id V1 V2 W  DBirth DDeath  D_1st  S_1 D_2nd  S_2  D_3rd  S_3  D_4  S_4
+Model=
+Typevar: 0 for simple covariate (dummy, quantitative, fixed or varying), 1 for age product, 2 for  product 
+Fixed[k] 0=fixed (product or simple), 1 varying, 2 fixed with age product, 3 varying with age product 
+Dummy[k] 0=dummy (0 1), 1 quantitative (single or product without age), 2 dummy with age product, 3 quant with age product
+ncoveff=0, nqfveff=0, ntveff=0, nqtveff=0, cptcovn=0
+ncovf=0, ncovv=0, ncova=0, nsd=0, nsq=0
 Total number of individuals= 8270, Agemin = 70.00, Agemax= 104.17
 
-Delay (in months) between two waves Min=1 (for indiviudal 6017) Max=74 (5168) Mean=24.040080
+Information! Unknown status for individual 1 line=1 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 40 line=40 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(40)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 55 line=55 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(55)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 84 line=84 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(84)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 92 line=92 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(92)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 103 line=103 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(103)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 186 line=186 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(186)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 202 line=202 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(202)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 207 line=207 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(207)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 239 line=239 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(239)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 260 line=260 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(260)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 269 line=269 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(269)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 302 line=302 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(302)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 329 line=329 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(329)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 335 line=335 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(335)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 346 line=346 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(346)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 347 line=347 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(347)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 378 line=378 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(378)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 414 line=414 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(414)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 431 line=431 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(431)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 443 line=443 occurred at last wave 4 at known date 5/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(443)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 482 line=482 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(482)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 503 line=503 occurred at 10/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (503)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
- Age 70 1.=665 loss[1]=5.1% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=631 prev[1]=100.0% 2.=0 prev[2]=0.0% 1-1=34 11=563 12=33 13=35 33=6
-Age 71 1.=663 loss[1]=5.7% 2.=2 loss[2]=0.0% 1.=625 prev[1]=99.7% 2.=2 prev[2]=0.3% 1-1=38 11=530 12=47 13=48 21=1 22=1 3-1=2 33=31
-Age 72 1.=1181 loss[1]=5.6% 2.=35 loss[2]=5.7% 1.=1115 prev[1]=97.1% 2.=33 prev[2]=2.9% 1-1=66 11=969 12=70 13=76 2-1=2 21=9 22=18 23=6 3-1=2 33=87
-Age 73 1.=1119 loss[1]=5.1% 2.=48 loss[2]=8.3% 1.=1062 prev[1]=96.0% 2.=44 prev[2]=4.0% 1-1=57 11=912 12=71 13=79 2-1=4 21=12 22=26 23=6 3-1=12 33=94
-Age 74 1.=1563 loss[1]=4.2% 2.=90 loss[2]=4.4% 1.=1497 prev[1]=94.6% 2.=86 prev[2]=5.4% 1-1=66 11=1277 12=104 13=116 2-1=4 21=30 22=41 23=15 3-1=4 33=125
-Age 75 1.=1463 loss[1]=6.2% 2.=98 loss[2]=7.1% 1.=1372 prev[1]=93.8% 2.=91 prev[2]=6.2% 1-1=91 11=1155 12=98 13=119 2-1=7 21=15 22=55 23=21 3-1=4 33=124
-Age 76 1.=1390 loss[1]=4.5% 2.=112 loss[2]=3.6% 1.=1328 prev[1]=92.5% 2.=108 prev[2]=7.5% 1-1=62 11=1090 12=111 13=127 2-1=4 21=25 22=54 23=29 3-1=4 33=142
-Age 77 1.=1271 loss[1]=5.0% 2.=101 loss[2]=5.9% 1.=1208 prev[1]=92.7% 2.=95 prev[2]=7.3% 1-1=63 11=962 12=131 13=115 2-1=6 21=24 22=52 23=19 3-1=7 33=145
-Age 78 1.=1166 loss[1]=4.9% 2.=122 loss[2]=4.1% 1.=1109 prev[1]=90.5% 2.=117 prev[2]=9.5% 1-1=57 11=894 12=111 13=104 2-1=5 21=21 22=75 23=21 3-1=4 33=146
-Age 79 1.=1045 loss[1]=5.7% 2.=133 loss[2]=5.3% 1.=985 prev[1]=88.7% 2.=126 prev[2]=11.3% 1-1=60 11=773 12=109 13=103 2-1=7 21=31 22=68 23=27 3-1=8 33=136
-Age 80 1.=986 loss[1]=4.1% 2.=128 loss[2]=3.1% 1.=946 prev[1]=88.4% 2.=124 prev[2]=11.6% 1-1=40 11=718 12=140 13=88 2-1=4 21=21 22=71 23=32 3-1=6 33=121
-Age 81 1.=872 loss[1]=4.9% 2.=130 loss[2]=3.8% 1.=829 prev[1]=86.9% 2.=125 prev[2]=13.1% 1-1=43 11=629 12=102 13=98 2-1=5 21=24 22=74 23=27 3-1=5 33=126
-Age 82 1.=803 loss[1]=4.4% 2.=146 loss[2]=4.1% 1.=768 prev[1]=84.6% 2.=140 prev[2]=15.4% 1-1=35 11=546 12=131 13=91 2-1=6 21=15 22=77 23=48 3-1=11 33=100
-Age 83 1.=726 loss[1]=6.5% 2.=116 loss[2]=0.9% 1.=679 prev[1]=85.5% 2.=115 prev[2]=14.5% 1-1=47 11=456 12=124 13=99 2-1=1 21=19 22=71 23=25 3-1=8 33=133
-Age 84 1.=622 loss[1]=5.6% 2.=147 loss[2]=4.1% 1.=587 prev[1]=80.6% 2.=141 prev[2]=19.4% 1-1=35 11=394 12=112 13=81 2-1=6 21=18 22=82 23=41 3-1=5 33=114
-Age 85 1.=526 loss[1]=4.4% 2.=127 loss[2]=6.3% 1.=503 prev[1]=80.9% 2.=119 prev[2]=19.1% 1-1=23 11=315 12=122 13=66 2-1=8 21=13 22=67 23=39 3-1=4 33=137
-Age 86 1.=464 loss[1]=5.2% 2.=130 loss[2]=6.2% 1.=440 prev[1]=78.3% 2.=122 prev[2]=21.7% 1-1=24 11=271 12=103 13=66 2-1=8 21=18 22=70 23=34 3-1=3 33=112
-Age 87 1.=372 loss[1]=4.8% 2.=143 loss[2]=2.8% 1.=354 prev[1]=71.8% 2.=139 prev[2]=28.2% 1-1=18 11=219 12=79 13=56 2-1=4 21=15 22=71 23=53 3-1=1 33=81
-Age 88 1.=283 loss[1]=3.9% 2.=164 loss[2]=6.7% 1.=272 prev[1]=64.0% 2.=153 prev[2]=36.0% 1-1=11 11=172 12=63 13=37 2-1=11 21=25 22=84 23=44 3-1=8 33=102
-Age 89 1.=227 loss[1]=3.5% 2.=152 loss[2]=4.6% 1.=219 prev[1]=60.2% 2.=145 prev[2]=39.8% 1-1=8 11=135 12=45 13=39 2-1=7 21=21 22=73 23=51 3-1=2 33=77
-Age 90 1.=181 loss[1]=3.9% 2.=143 loss[2]=4.9% 1.=174 prev[1]=56.1% 2.=136 prev[2]=43.9% 1-1=7 11=104 12=41 13=29 2-1=7 21=18 22=82 23=36 3-1=1 33=75
-Age 91 1.=146 loss[1]=4.1% 2.=109 loss[2]=8.3% 1.=140 prev[1]=58.3% 2.=100 prev[2]=41.7% 1-1=6 11=78 12=36 13=26 2-1=9 21=11 22=51 23=38 3-1=3 33=77
-Age 92 1.=114 loss[1]=6.1% 2.=101 loss[2]=2.0% 1.=107 prev[1]=51.9% 2.=99 prev[2]=48.1% 1-1=7 11=47 12=43 13=17 2-1=2 21=11 22=52 23=36 3-1=2 33=61
-Age 93 1.=78 loss[1]=3.8% 2.=89 loss[2]=12.4% 1.=75 prev[1]=49.0% 2.=78 prev[2]=51.0% 1-1=3 11=36 12=25 13=14 2-1=11 21=10 22=46 23=22 3-1=2 33=62
-Age 94 1.=51 loss[1]=3.9% 2.=71 loss[2]=1.4% 1.=49 prev[1]=41.2% 2.=70 prev[2]=58.8% 1-1=2 11=24 12=8 13=17 2-1=1 21=4 22=39 23=27 3-1=1 33=37
-Age 95 1.=38 loss[1]=5.3% 2.=57 loss[2]=5.3% 1.=36 prev[1]=40.0% 2.=54 prev[2]=60.0% 1-1=2 11=16 12=13 13=7 2-1=3 21=4 22=31 23=19 3-1=1 33=39
-Age 96 1.=25 loss[1]=4.0% 2.=43 loss[2]=4.7% 1.=24 prev[1]=36.9% 2.=41 prev[2]=63.1% 1-1=1 11=11 12=9 13=4 2-1=2 21=2 22=22 23=17 3-1=2 33=25
-Age 97 1.=11 loss[1]=0.0% 2.=36 loss[2]=8.3% 1.=11 prev[1]=25.0% 2.=33 prev[2]=75.0% 11=4 12=7 2-1=3 21=2 22=22 23=9 33=23
-Age 98 1.=5 loss[1]=0.0% 2.=21 loss[2]=0.0% 1.=5 prev[1]=19.2% 2.=21 prev[2]=80.8% 11=1 12=4 21=1 22=13 23=7 3-1=1 33=17
-Age 99 1.=6 loss[1]=0.0% 2.=14 loss[2]=0.0% 1.=6 prev[1]=30.0% 2.=14 prev[2]=70.0% 11=3 12=1 13=2 21=2 22=2 23=10 33=6
-Age 100 1.=2 loss[1]=0.0% 2.=9 loss[2]=0.0% 1.=2 prev[1]=18.2% 2.=9 prev[2]=81.8% 11=1 12=1 21=2 22=5 23=2 33=2
-Age 101 1.=2 loss[1]=50.0% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=1 prev[1]=100.0% 2.=0 prev[2]=0.0% 1-1=1 12=1 3-1=1 33=3
-Age 102 1.=2 loss[1]=0.0% 2.=1 loss[2]=0.0% 1.=2 prev[1]=66.7% 2.=1 prev[2]=33.3% 12=2 22=1 33=1
-Age 103 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
-Age 104 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
-Age 105 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
-Age 106 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ% -1-1=69 -11=718 -12=195 -13=261
-Total 1.=18068 loss[1]=5.0% 2.=2818 loss[2]=4.9% 1.=17161 prev[1]=86.5% 2.=2681 prev[2]=13.5% -1-1=69 -11=718 -12=195 -13=261 1-1=907 11=13305 12=2097 13=1759 2-1=137 21=424 22=1496 23=761 3-1=114 33=2567
-Powell
+Information! Unknown status for individual 516 line=516 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(516)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 537 line=537 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(537)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 544 line=544 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(544)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 569 line=569 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(569)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 581 line=581 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(581)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 595 line=595 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(595)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 620 line=620 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(620)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 630 line=630 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(630)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 696 line=696 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(696)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 699 line=699 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(699)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 704 line=704 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(704)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 707 line=707 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(707)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 712 line=712 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(712)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 713 line=713 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(713)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 762 line=762 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(762)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 766 line=766 occurred at 1/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (766)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 770 line=770 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(770)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 798 line=798 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(798)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 853 line=853 occurred at last wave 4 at known date 9/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(853)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 855 line=855 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(855)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 918 line=918 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(918)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 942 line=942 occurred at last wave 4 at known date 9/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(942)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 946 line=946 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(946)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 951 line=951 occurred at 4/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (951)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 958 line=958 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(958)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 966 line=966 occurred at 3/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (966)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 970 line=970 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(970)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 982 line=982 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(982)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1004 line=1004 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1004)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1039 line=1039 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1039)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1081 line=1081 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1081)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1091 line=1091 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1091)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1099 line=1099 occurred at last wave 4 at known date 9/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1099)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1157 line=1157 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1157)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1177 line=1177 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1177)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1179 line=1179 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1179)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1197 line=1197 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1197)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1201 line=1201 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1201)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1215 line=1215 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1215)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1242 line=1242 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1242)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1268 line=1268 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1268)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1270 line=1270 occurred at last wave 4 at known date 5/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1270)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1284 line=1284 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1284)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1295 line=1295 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1295)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1297 line=1297 occurred at last wave 4 at known date 5/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1297)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1363 line=1363 occurred at last wave 4 at known date 5/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1363)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1406 line=1406 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1406)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1477 line=1477 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1477)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1543 line=1543 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1543)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 1571 line=1571 occurred at 11/1989 before last wave 4 interviewed at 8/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (1571)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 1580 line=1580 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1580)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1581 line=1581 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1581)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1593 line=1593 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1593)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1620 line=1620 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1620)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1672 line=1672 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1672)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1680 line=1680 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1680)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1737 line=1737 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1737)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1764 line=1764 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1764)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1777 line=1777 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1777)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 1781 line=1781 occurred at 4/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (1781)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 1803 line=1803 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1803)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1849 line=1849 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1849)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1881 line=1881 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1881)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1903 line=1903 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1903)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1937 line=1937 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1937)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 1948 line=1948 occurred at 9/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (1948)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 1949 line=1949 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1949)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1968 line=1968 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1968)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 1984 line=1984 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(1984)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2009 line=2009 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2009)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2019 line=2019 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2019)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2025 line=2025 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2025)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2027 line=2027 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2027)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2032 line=2032 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2032)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2036 line=2036 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2036)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 2062 line=2062 occurred at 1/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (2062)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 2069 line=2069 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2069)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2096 line=2096 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2096)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2189 line=2189 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2189)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2198 line=2198 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2198)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2311 line=2311 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2311)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 2327 line=2327 occurred at 6/1991 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (2327)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=1 -2*LL=46542.394740741831 0 sec. 1 sec. 1 -12.245240000000 2 0.092358000000 3 -10.671890000000 4 0.060969000000 5 -2.645345000000 6 -0.022325000000 7 -4.773317000000 8 0.007859000000
+Information! Unknown status for individual 2354 line=2354 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2354)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2377 line=2377 occurred at last wave 4 at known date 4/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2377)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2388 line=2388 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2388)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2392 line=2392 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2392)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2432 line=2432 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2432)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2446 line=2446 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2446)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2513 line=2513 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2513)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2574 line=2574 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2574)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2583 line=2583 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2583)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2638 line=2638 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2638)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2643 line=2643 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2643)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2655 line=2655 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2655)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 2662 line=2662 occurred at 7/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (2662)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 2681 line=2681 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2681)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 2743 line=2743 occurred at 6/1991 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (2743)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Considering the time needed for this last iteration #1: 0 seconds,
-   - if your program needs 10 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 0 minute(s) 0 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:20:45 2015 (current time is Tue Aug 18 18:20:45 2015);
-   - if your program needs 20 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 0 minute(s) 0 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:20:45 2015 (current time is Tue Aug 18 18:20:45 2015);
-   - if your program needs 30 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 0 minute(s) 0 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:20:45 2015 (current time is Tue Aug 18 18:20:45 2015);
-1.............2.....................3...............4...................5..........6.............7...............8..................
-Powell iter=2 -2*LL=46542.366177077667 23 sec. 24 sec. 1 -12.245474667968 2 0.092360078052 3 -10.671718090206 4 0.060967648859 5 -2.641226372487 6 -0.022378298324 7 -4.773347352998 8 0.007897501084
+Warning! Death for individual 2782 line=2782 occurred at 9/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (2782)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 2841 line=2841 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2841)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2888 line=2888 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2888)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2919 line=2919 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2919)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2970 line=2970 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2970)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 2980 line=2980 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(2980)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3012 line=3012 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3012)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3130 line=3130 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3130)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3140 line=3140 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3140)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3187 line=3187 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3187)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3234 line=3234 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3234)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3274 line=3274 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3274)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3331 line=3331 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3331)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3394 line=3394 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3394)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3396 line=3396 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3396)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 3414 line=3414 occurred at 9/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (3414)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 3417 line=3417 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3417)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3430 line=3430 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3430)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3451 line=3451 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3451)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3453 line=3453 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3453)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3472 line=3472 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3472)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3501 line=3501 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3501)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 3517 line=3517 occurred at 6/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (3517)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 3539 line=3539 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3539)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3557 line=3557 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3557)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3564 line=3564 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3564)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3565 line=3565 occurred at last wave 4 at known date 10/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3565)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3591 line=3591 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3591)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3595 line=3595 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3595)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3652 line=3652 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3652)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3684 line=3684 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3684)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3777 line=3777 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3777)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3787 line=3787 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3787)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3790 line=3790 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3790)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3805 line=3805 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3805)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3841 line=3841 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3841)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3848 line=3848 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3848)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3863 line=3863 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3863)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3949 line=3949 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3949)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3960 line=3960 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3960)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 3981 line=3981 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(3981)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4176 line=4176 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4176)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4186 line=4186 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4186)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4190 line=4190 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4190)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4288 line=4288 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4288)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4295 line=4295 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4295)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4320 line=4320 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4320)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4360 line=4360 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4360)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4381 line=4381 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4381)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4403 line=4403 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4403)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 4417 line=4417 occurred at 8/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (4417)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Considering the time needed for this last iteration #2: 23 seconds,
-   - if your program needs 10 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 3 minute(s) 4 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:24:12 2015 (current time is Tue Aug 18 18:21:08 2015);
-   - if your program needs 20 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 6 minute(s) 54 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:28:02 2015 (current time is Tue Aug 18 18:21:08 2015);
-   - if your program needs 30 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 10 minute(s) 44 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:31:52 2015 (current time is Tue Aug 18 18:21:08 2015);
-1............2.................3............4...................5..........6.............7..........8.........................Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 8 :
+Information! Unknown status for individual 4467 line=4467 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4467)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4476 line=4476 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4476)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4528 line=4528 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4528)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4558 line=4558 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4558)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4611 line=4611 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4611)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4614 line=4614 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4614)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 4747 line=4747 occurred at 3/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (4747)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 4751 line=4751 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4751)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4758 line=4758 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4758)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4816 line=4816 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4816)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 4834 line=4834 occurred at 10/1990 after last wave 4 interviewed at 6/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (4834)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=3 -2*LL=46542.180101184662 22 sec. 46 sec. 1 -12.243554549912 2 0.092379481639 3 -10.687240979880 4 0.060948425212 5 -2.601681584093 6 -0.022889573696 7 -4.797716971796 8 0.008263023171
+Information! Unknown status for individual 4836 line=4836 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4836)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4864 line=4864 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4864)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4906 line=4906 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4906)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 4928 line=4928 occurred at 11/1990 after last wave 4 interviewed at 8/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (4928)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Considering the time needed for this last iteration #3: 22 seconds,
-   - if your program needs 10 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 2 minute(s) 34 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:24:04 2015 (current time is Tue Aug 18 18:21:30 2015);
-   - if your program needs 20 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 6 minute(s) 14 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:27:44 2015 (current time is Tue Aug 18 18:21:30 2015);
-   - if your program needs 30 iterations to converge, convergence will be 
-   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 9 minute(s) 54 second(s) i.e.
-   on Tue Aug 18 18:31:24 2015 (current time is Tue Aug 18 18:21:30 2015);
-1.................2.................3..........4....................5..........6.............7..........8.......
-Powell iter=4 -2*LL=46541.944882756965 20 sec. 66 sec. 1 -12.242484543366 2 0.092391161272 3 -10.684956992257 4 0.060933369989 5 -2.571767476006 6 -0.023216409131 7 -4.817698692685 8 0.008460497128
-1.........2..................3..........4....................5..........6.............7..........8..............Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 3 :
+Information! Unknown status for individual 4946 line=4946 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4946)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4962 line=4962 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4962)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4982 line=4982 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4982)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 4997 line=4997 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(4997)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5009 line=5009 occurred at 6/1990 before last wave 4 interviewed at 6/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5009)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Warning! Death for individual 5011 line=5011 occurred at 2/1989 before last wave 4 interviewed at 8/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5011)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5063 line=5063 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5063)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5089 line=5089 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5089)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5114 line=5114 occurred at 3/1990 before last wave 4 interviewed at 8/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5114)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5122 line=5122 occurred at last wave 4 at known date 9/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5122)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5135 line=5135 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5135)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5142 line=5142 occurred at 8/1989 before last wave 4 interviewed at 8/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5142)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5162 line=5162 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5162)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5189 line=5189 occurred at 12/1989 before last wave 4 interviewed at 6/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5189)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5216 line=5216 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5216)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5223 line=5223 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5223)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5239 line=5239 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5239)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5251 line=5251 occurred at 2/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5251)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5265 line=5265 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5265)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5307 line=5307 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5307)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5355 line=5355 occurred at 3/1990 before last wave 4 interviewed at 6/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5355)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Error! Death for individual 5378 line=5378 occurred at 9/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (5378)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
+
+Information! Unknown status for individual 5388 line=5388 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5388)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5407 line=5407 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5407)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5503 line=5503 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5503)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5508 line=5508 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5508)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5521 line=5521 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5521)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5533 line=5533 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5533)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5541 line=5541 occurred at 3/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5541)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5558 line=5558 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5558)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5623 line=5623 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5623)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5632 line=5632 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5632)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5653 line=5653 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5653)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5659 line=5659 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5659)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5670 line=5670 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5670)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5676 line=5676 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5676)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5704 line=5704 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5704)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5759 line=5759 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5759)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5769 line=5769 occurred at 8/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5769)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5785 line=5785 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5785)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5834 line=5834 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5834)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5887 line=5887 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5887)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5913 line=5913 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5913)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5914 line=5914 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5914)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 5921 line=5921 occurred at 5/1989 before last wave 4 interviewed at 9/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (5921)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 5927 line=5927 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5927)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 5983 line=5983 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(5983)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6050 line=6050 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6050)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6051 line=6051 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6051)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6091 line=6091 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6091)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6111 line=6111 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6111)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6180 line=6180 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6180)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 6294 line=6294 occurred at 11/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (6294)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=5 -2*LL=46538.155159115864 21 sec. 87 sec. 1 -12.277818683456 2 0.092782784461 3 -10.606927524558 4 0.060433498790 5 -1.636618302422 6 -0.034173907116 7 -5.415159199358 8 0.015209892785
-1.........2..............3........4...................5.........6..............7..........8........directest= 3.559482495482, t= -1.587615025675, f1= 46538.155159115864,f2= 46537.965437599931,f3= 46541.605702231980, del= 0.135251826250
-f1-2f2+f3= 3.829986147983, f1-f2-del= 0.054469689683, f1-f3= -3.450543116116
+Information! Unknown status for individual 6299 line=6299 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6299)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6316 line=6316 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6316)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6326 line=6326 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6326)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6335 line=6335 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6335)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6346 line=6346 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6346)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6349 line=6349 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6349)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6361 line=6361 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6361)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 6392 line=6392 occurred at 6/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (6392)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 6398 line=6398 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6398)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6424 line=6424 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6424)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6459 line=6459 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6459)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 6563 line=6563 occurred at 6/1991 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (6563)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=6 -2*LL=46537.965437599931 17 sec. 104 sec. 1 -12.286824634318 2 0.092796946661 3 -10.605118146544 4 0.060392081785 5 -1.601001695625 6 -0.034696856573 7 -5.445686958604 8 0.015541650236
-1............2...............3..........4...........................5.........6.............7.................8........
-Powell iter=7 -2*LL=46537.953896904983 21 sec. 125 sec. 1 -12.288663475348 2 0.092794258423 3 -10.602520523521 4 0.060372798332 5 -1.596765949187 6 -0.034763087057 7 -5.450260084532 8 0.015582787665
-1...........2...............3........4...................5..........6..............7............8.............Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 4 :
+Information! Unknown status for individual 6603 line=6603 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6603)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6634 line=6634 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6634)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6672 line=6672 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6672)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6674 line=6674 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6674)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6730 line=6730 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6730)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6739 line=6739 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6739)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 6744 line=6744 occurred at 12/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (6744)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 6860 line=6860 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6860)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 6925 line=6925 occurred at 10/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (6925)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=8 -2*LL=46537.933555419499 20 sec. 145 sec. 1 -12.288754155703 2 0.092753643773 3 -10.588920461186 4 0.060230465648 5 -1.588742425574 6 -0.034884297842 7 -5.460441275653 8 0.015679980832
-1..........2................3..........4.........5...........6..............7...........8............Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 1 :
+Information! Unknown status for individual 6961 line=6961 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6961)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6967 line=6967 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6967)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 6999 line=6999 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(6999)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7032 line=7032 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7032)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7087 line=7087 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7087)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7097 line=7097 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7097)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7181 line=7181 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7181)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7209 line=7209 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7209)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 7229 line=7229 occurred at 12/1989 before last wave 4 interviewed at 6/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (7229)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 7233 line=7233 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7233)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 7273 line=7273 occurred at 1/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (7273)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 7290 line=7290 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7290)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7294 line=7294 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7294)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7319 line=7319 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7319)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7326 line=7326 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7326)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7422 line=7422 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7422)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7427 line=7427 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7427)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7480 line=7480 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7480)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7493 line=7493 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7493)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7508 line=7508 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7508)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7515 line=7515 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7515)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7552 line=7552 occurred at last wave 4 at known date 6/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7552)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7598 line=7598 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7598)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 7636 line=7636 occurred at 6/1991 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (7636)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=9 -2*LL=46537.891454595432 19 sec. 164 sec. 1 -12.283266439012 2 0.092658255416 3 -10.562891684762 4 0.059948818330 5 -1.581316871784 6 -0.034987633432 7 -5.472744984969 8 0.015801808619
-1.....2..............3........4............5............6..............7...........8...........Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 8 :
+Information! Unknown status for individual 7639 line=7639 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7639)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7724 line=7724 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7724)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7763 line=7763 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7763)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7823 line=7823 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7823)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 7827 line=7827 occurred at 7/1988 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (7827)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Error! Death for individual 7832 line=7832 occurred at 9/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (7832)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=10 -2*LL=46537.765677731819 18 sec. 182 sec. 1 -12.262794789308 2 0.092367916069 3 -10.470813624311 4 0.058882333788 5 -1.562236459514 6 -0.035239826239 7 -5.510520845667 8 0.016209203343
-1......2.......................3.......4........5............6..............7............8............Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 8 :
+Information! Unknown status for individual 7863 line=7863 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7863)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 7873 line=7873 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7873)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 7905 line=7905 occurred at 3/1990 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (7905)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Warning! Death for individual 7976 line=7976 occurred at 9/1989 before last wave 4 interviewed at 7/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (7976)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 7985 line=7985 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(7985)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Warning! Death for individual 8043 line=8043 occurred at 10/1989 before last wave 4 interviewed at 6/1990 and should have been coded as death instead of '-1'. This case (8043)/wave (4) is contributing to likelihood.
+Information! Unknown status for individual 8069 line=8069 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(8069)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 8130 line=8130 occurred at 8/1990 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (8130)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=11 -2*LL=46537.498821119196 19 sec. 201 sec. 1 -12.214937649099 2 0.091832303757 3 -10.310758734665 4 0.056891524738 5 -1.540234661352 6 -0.035490430955 7 -5.566745000929 8 0.016892295483
-1.....2..............3.......4........5.................6...............7..............8.......
-Powell iter=12 -2*LL=46537.411404609535 18 sec. 219 sec. 1 -12.203395121992 2 0.091768319083 3 -10.300995242801 4 0.056661013905 5 -1.545167229526 6 -0.035400936285 7 -5.565324661507 8 0.016938176004
-1............2..................3..........4............5..................6..............7.............8.....................Gaining to use new average direction of P0 P8 instead of biggest increase direction 3 :
+Information! Unknown status for individual 8145 line=8145 occurred at last wave 4 at known date 7/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(8145)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Information! Unknown status for individual 8178 line=8178 occurred at last wave 4 at known date 8/1990. Please, check if your unknown date of death 99/9999 means a live state -1 at wave 4. This case(8178)/wave(4) contributes to the likelihood as 1-p-13 .
+Error! Death for individual 8257 line=8257 occurred at 6/1991 after last wave 4 interviewed at 7/1990. Potential bias if other individuals are still alive at this date but ignored. This case (8257)/wave (4) is skipped, no contribution to likelihood. Please add a new fictive wave at the date of last vital status scan, with a dead status or alive but unknown state status (-1). See documentation
 
-Powell iter=13 -2*LL=46537.410703925241 22 sec. 241 sec. 1 -12.202513270154 2 0.091761198901 3 -10.299418789414 4 0.056628413435 5 -1.545343667372 6 -0.035398382663 7 -5.565921175501 8 0.016950736226
-1.........2................3............4.............5..........6....................7..............8........#Number of iterations & function calls = 13 & 1694, -2 Log likelihood = 46537.410262065809
+Delay (in months) between two waves Min=1 (for indiviudal 6017) Max=74 (5168) Mean=24.058442
+
+ Age 70 1.=665 loss[1]=5.1% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=631 prev[1]=100.0% 2.=0 prev[2]=0.0% 1-1=34 11=563 12=33 13=35
+Age 71 1.=663 loss[1]=5.7% 2.=2 loss[2]=0.0% 1.=625 prev[1]=99.7% 2.=2 prev[2]=0.3% 1-1=38 11=530 12=47 13=48 21=1 22=1
+Age 72 1.=1181 loss[1]=5.6% 2.=35 loss[2]=5.7% 1.=1115 prev[1]=97.1% 2.=33 prev[2]=2.9% 1-1=66 11=969 12=70 13=76 2-1=2 21=9 22=18 23=6
+Age 73 1.=1119 loss[1]=5.1% 2.=47 loss[2]=6.4% 1.=1062 prev[1]=96.0% 2.=44 prev[2]=4.0% 1-1=57 11=912 12=71 13=79 2-1=3 21=12 22=26 23=6
+Age 74 1.=1562 loss[1]=4.2% 2.=90 loss[2]=4.4% 1.=1497 prev[1]=94.6% 2.=86 prev[2]=5.4% 1-1=65 11=1277 12=104 13=116 2-1=4 21=30 22=41 23=15
+Age 75 1.=1461 loss[1]=6.1% 2.=97 loss[2]=6.2% 1.=1372 prev[1]=93.8% 2.=91 prev[2]=6.2% 1-1=89 11=1155 12=98 13=119 2-1=6 21=15 22=55 23=21
+Age 76 1.=1388 loss[1]=4.3% 2.=111 loss[2]=2.7% 1.=1328 prev[1]=92.5% 2.=108 prev[2]=7.5% 1-1=60 11=1090 12=111 13=127 2-1=3 21=25 22=54 23=29
+Age 77 1.=1270 loss[1]=4.9% 2.=100 loss[2]=5.0% 1.=1208 prev[1]=92.7% 2.=95 prev[2]=7.3% 1-1=62 11=962 12=131 13=115 2-1=5 21=24 22=52 23=19
+Age 78 1.=1163 loss[1]=4.6% 2.=122 loss[2]=4.1% 1.=1109 prev[1]=90.5% 2.=117 prev[2]=9.5% 1-1=54 11=894 12=111 13=104 2-1=5 21=21 22=75 23=21
+Age 79 1.=1045 loss[1]=5.7% 2.=131 loss[2]=3.8% 1.=985 prev[1]=88.7% 2.=126 prev[2]=11.3% 1-1=60 11=773 12=109 13=103 2-1=5 21=31 22=68 23=27
+Age 80 1.=986 loss[1]=4.1% 2.=128 loss[2]=3.1% 1.=946 prev[1]=88.4% 2.=124 prev[2]=11.6% 1-1=40 11=718 12=140 13=88 2-1=4 21=21 22=71 23=32
+Age 81 1.=870 loss[1]=4.7% 2.=130 loss[2]=3.8% 1.=829 prev[1]=86.9% 2.=125 prev[2]=13.1% 1-1=41 11=629 12=102 13=98 2-1=5 21=24 22=74 23=27
+Age 82 1.=799 loss[1]=3.9% 2.=145 loss[2]=3.4% 1.=768 prev[1]=84.6% 2.=140 prev[2]=15.4% 1-1=31 11=546 12=131 13=91 2-1=5 21=15 22=77 23=48
+Age 83 1.=722 loss[1]=6.0% 2.=115 loss[2]=0.0% 1.=679 prev[1]=85.5% 2.=115 prev[2]=14.5% 1-1=43 11=456 12=124 13=99 21=19 22=71 23=25
+Age 84 1.=620 loss[1]=5.3% 2.=147 loss[2]=4.1% 1.=587 prev[1]=80.6% 2.=141 prev[2]=19.4% 1-1=33 11=394 12=112 13=81 2-1=6 21=18 22=82 23=41
+Age 85 1.=526 loss[1]=4.4% 2.=126 loss[2]=5.6% 1.=503 prev[1]=80.9% 2.=119 prev[2]=19.1% 1-1=23 11=315 12=122 13=66 2-1=7 21=13 22=67 23=39
+Age 86 1.=464 loss[1]=5.2% 2.=128 loss[2]=4.7% 1.=440 prev[1]=78.3% 2.=122 prev[2]=21.7% 1-1=24 11=271 12=103 13=66 2-1=6 21=18 22=70 23=34
+Age 87 1.=370 loss[1]=4.3% 2.=143 loss[2]=2.8% 1.=354 prev[1]=71.8% 2.=139 prev[2]=28.2% 1-1=16 11=219 12=79 13=56 2-1=4 21=15 22=71 23=53
+Age 88 1.=283 loss[1]=3.9% 2.=163 loss[2]=6.1% 1.=272 prev[1]=64.0% 2.=153 prev[2]=36.0% 1-1=11 11=172 12=63 13=37 2-1=10 21=25 22=84 23=44
+Age 89 1.=226 loss[1]=3.1% 2.=151 loss[2]=4.0% 1.=219 prev[1]=60.2% 2.=145 prev[2]=39.8% 1-1=7 11=135 12=45 13=39 2-1=6 21=21 22=73 23=51
+Age 90 1.=181 loss[1]=3.9% 2.=143 loss[2]=4.9% 1.=174 prev[1]=56.1% 2.=136 prev[2]=43.9% 1-1=7 11=104 12=41 13=29 2-1=7 21=18 22=82 23=36
+Age 91 1.=146 loss[1]=4.1% 2.=107 loss[2]=6.5% 1.=140 prev[1]=58.3% 2.=100 prev[2]=41.7% 1-1=6 11=78 12=36 13=26 2-1=7 21=11 22=51 23=38
+Age 92 1.=114 loss[1]=6.1% 2.=101 loss[2]=2.0% 1.=107 prev[1]=51.9% 2.=99 prev[2]=48.1% 1-1=7 11=47 12=43 13=17 2-1=2 21=11 22=52 23=36
+Age 93 1.=78 loss[1]=3.8% 2.=88 loss[2]=11.4% 1.=75 prev[1]=49.0% 2.=78 prev[2]=51.0% 1-1=3 11=36 12=25 13=14 2-1=10 21=10 22=46 23=22
+Age 94 1.=50 loss[1]=2.0% 2.=70 loss[2]=0.0% 1.=49 prev[1]=41.2% 2.=70 prev[2]=58.8% 1-1=1 11=24 12=8 13=17 21=4 22=39 23=27
+Age 95 1.=38 loss[1]=5.3% 2.=56 loss[2]=3.6% 1.=36 prev[1]=40.0% 2.=54 prev[2]=60.0% 1-1=2 11=16 12=13 13=7 2-1=2 21=4 22=31 23=19
+Age 96 1.=25 loss[1]=4.0% 2.=42 loss[2]=2.4% 1.=24 prev[1]=36.9% 2.=41 prev[2]=63.1% 1-1=1 11=11 12=9 13=4 2-1=1 21=2 22=22 23=17
+Age 97 1.=11 loss[1]=0.0% 2.=36 loss[2]=8.3% 1.=11 prev[1]=25.0% 2.=33 prev[2]=75.0% 11=4 12=7 2-1=3 21=2 22=22 23=9
+Age 98 1.=5 loss[1]=0.0% 2.=21 loss[2]=0.0% 1.=5 prev[1]=19.2% 2.=21 prev[2]=80.8% 11=1 12=4 21=1 22=13 23=7
+Age 99 1.=6 loss[1]=0.0% 2.=14 loss[2]=0.0% 1.=6 prev[1]=30.0% 2.=14 prev[2]=70.0% 11=3 12=1 13=2 21=2 22=2 23=10
+Age 100 1.=2 loss[1]=0.0% 2.=9 loss[2]=0.0% 1.=2 prev[1]=18.2% 2.=9 prev[2]=81.8% 11=1 12=1 21=2 22=5 23=2
+Age 101 1.=1 loss[1]=0.0% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=1 prev[1]=100.0% 2.=0 prev[2]=0.0% 12=1
+Age 102 1.=2 loss[1]=0.0% 2.=1 loss[2]=0.0% 1.=2 prev[1]=66.7% 2.=1 prev[2]=33.3% 12=2 22=1
+Age 103 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
+Age 104 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
+1 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
+0 1.=0 loss[1]=NaNQ% 2.=0 loss[2]=NaNQ% 1.=0 prev[1]=NaNQ% 2.=0 prev[2]=NaNQ%
+Total 1.=18042 loss[1]=4.9% 2.=2799 loss[2]=4.2% 1.=17161 prev[1]=86.5% 2.=2681 prev[2]=13.5% 1-1=881 11=13305 12=2097 13=1759 2-1=118 21=424 22=1496 23=761
+
+
+12  -12.3175753 ln(2097/13305)=   -1.8476322 
+13  -10.1631670 ln(1759/13305)=   -2.0233944 
+21   -1.6685685 ln(424/1496)=   -1.2608167 
+23   -5.6869201 ln(761/1496)=   -0.6759168 
+
+ -1-1=0 -10=0 -11=0 -12=0 -13=0 0-1=0 00=0 01=0 02=0 03=0 1-1=881 10=0 11=13305 12=2097 13=1759 2-1=118 20=0 21=424 22=1496 23=761 3-1=0 30=0 31=0 32=0 33=0
+Powell
+
+Powell iter=1 -2*LL=46617.105944340874 0 sec. 10 sec.
+#model=  1      +     age 
+12  -12.3175753    0.0931122 
+13  -10.1631670    0.0548384 
+21   -1.6685685   -0.0339056 
+23   -5.6869201    0.0181350 
+1................2..................3.................4.......................5.........................6...................7................8......................
+Powell iter=2 -2*LL=46617.105944308234 13 sec. 23 sec.
+#model=  1      +     age 
+12  -12.3175784    0.0931122 
+13  -10.1631705    0.0548384 
+21   -1.6685685   -0.0339056 
+23   -5.6869199    0.0181350 
+
+Considering the time needed for this last iteration #2: 13 seconds,
+   - if your program needs 10 iterations to converge, convergence will be 
+   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 1 minute(s) 44 second(s) i.e.
+   on Wed May 22 22:34:43 2019 (current time is Wed May 22 22:32:59 2019);
+   - if your program needs 20 iterations to converge, convergence will be 
+   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 3 minute(s) 54 second(s) i.e.
+   on Wed May 22 22:36:53 2019 (current time is Wed May 22 22:32:59 2019);
+   - if your program needs 30 iterations to converge, convergence will be 
+   reached in 0 day(s) 0 hour(s) 6 minute(s) 4 second(s) i.e.
+   on Wed May 22 22:39:03 2019 (current time is Wed May 22 22:32:59 2019);
+1.................................2......................3.........................4..............................5...............................6....................7.................................8.......................
+#Number of iterations & function calls = 2 & 424, -2 Log likelihood = 46617.105944307536
 # Parameters nlstate*nlstate*ncov a12*1 + b12 * age + ...
-12  -12.2027105    0.0917637 
-13  -10.2992383    0.0566262 
-21   -1.5456185   -0.0353950 
-23   -5.5659628    0.0169512 
+12  -12.3175784    0.0931122 
+13  -10.1631705    0.0548384 
+21   -1.6685685   -0.0339056 
+23   -5.6869199    0.0181350 
 
 Calculation of the hessian matrix. Wait...
-12345678.12.13.14.15.16.17.18.23.24.25.26.27.28.34.35.36.37.38.45.46.47.48.56.57.58.67.68.78
+1-2-3-4-5-6-7-8-.1-2.1-3.1-4.1-5.1-6.1-7.1-8.2-3.2-4.2-5.2-6.2-7.2-8.3-4.3-5.3-6.3-7.3-8.4-5.4-6.4-7.4-8.5-6.5-7.5-8.6-7.6-8.7-8
 
 Inverting the hessian to get the covariance matrix. Wait...
 
 #Hessian matrix#
-2.301e+03 1.898e+05 3.980e+02 3.280e+04 -3.628e+02 -3.007e+04 -3.111e+02 -2.563e+04 
-1.898e+05 1.574e+07 3.252e+04 2.694e+06 -3.003e+04 -2.503e+06 -2.554e+04 -2.114e+06 
-3.980e+02 3.252e+04 8.499e+02 6.839e+04 -8.040e+01 -6.688e+03 3.773e+02 3.120e+04 
-3.280e+04 2.694e+06 6.839e+04 5.532e+06 -6.734e+03 -5.639e+05 3.117e+04 2.590e+06 
--3.628e+02 -3.003e+04 -8.040e+01 -6.734e+03 4.570e+02 3.818e+04 4.994e+01 4.126e+03 
--3.007e+04 -2.503e+06 -6.688e+03 -5.639e+05 3.818e+04 3.208e+06 4.126e+03 3.421e+05 
--3.111e+02 -2.554e+04 3.773e+02 3.117e+04 4.994e+01 4.126e+03 1.024e+03 8.867e+04 
--2.563e+04 -2.114e+06 3.120e+04 2.590e+06 4.126e+03 3.421e+05 8.867e+04 7.720e+06 
-Parameters, T and confidence intervals
-12  -12.2027105 T= -36.632 CI=[ -12.8689514 ;  -11.5364696]    0.0917637 T=  22.911 CI=[   0.0837533 ;    0.0997740] 
-13  -10.2992383 T= -18.738 CI=[ -11.3985038 ;   -9.1999728]    0.0566262 T=   8.316 CI=[   0.0430080 ;    0.0702444] 
-21   -1.5456185 T=  -2.259 CI=[  -2.9142844 ;   -0.1769526]   -0.0353950 T=  -4.335 CI=[  -0.0517251 ;   -0.0190649] 
-23   -5.5659628 T= -11.196 CI=[  -6.5602821 ;   -4.5716434]    0.0169512 T=   2.998 CI=[   0.0056422 ;    0.0282603] 
+2.296930e+03 1.895497e+05 3.935378e+02 3.244270e+04 -3.627633e+02 -3.009693e+04 -3.043646e+02 -2.506988e+04 
+1.895497e+05 1.572740e+07 3.217180e+04 2.665640e+06 -3.004624e+04 -2.507644e+06 -2.497200e+04 -2.067052e+06 
+3.935378e+02 3.217180e+04 8.583265e+02 6.900254e+04 -7.950011e+01 -6.614852e+03 3.761395e+02 3.110935e+04 
+3.244270e+04 2.665640e+06 6.900254e+04 5.575042e+06 -6.660064e+03 -5.573884e+05 3.108386e+04 2.584342e+06 
+-3.627633e+02 -3.004624e+04 -7.950011e+01 -6.660064e+03 4.568873e+02 3.819631e+04 4.751955e+01 3.915572e+03 
+-3.009693e+04 -2.507644e+06 -6.614852e+03 -5.573884e+05 3.819631e+04 3.210369e+06 3.920001e+03 3.247002e+05 
+-3.043646e+02 -2.497200e+04 3.761395e+02 3.108386e+04 4.751955e+01 3.920001e+03 1.019065e+03 8.831012e+04 
+-2.506988e+04 -2.067052e+06 3.110935e+04 2.584342e+06 3.915572e+03 3.247002e+05 8.831012e+04 7.695216e+06 
+Parameters, Wald tests and Wald-based confidence intervals
+ W is simply the result of the division of the parameter by the square root of covariance of the parameter.
+ And Wald-based confidence intervals plus and minus 1.96 * W 
+  It might be better to visualize the covariance matrix. See the page 'Matrix of variance-covariance of one-step probabilities' and its graphs.
+12  -12.3175784 W= -37.237 CI=[ -12.9659254 ;  -11.6692314]    0.0931122 W=  23.405 CI=[   0.0853146 ;    0.1009098] 
+13  -10.1631705 W= -18.488 CI=[ -11.2406101 ;   -9.0857309]    0.0548384 W=   8.045 CI=[   0.0414779 ;    0.0681989] 
+21   -1.6685685 W=  -2.395 CI=[  -3.0342962 ;   -0.3028408]   -0.0339056 W=  -4.080 CI=[  -0.0501948 ;   -0.0176164] 
+23   -5.6869199 W= -11.373 CI=[  -6.6669549 ;   -4.7068849]    0.0181350 W=   3.189 CI=[   0.0069875 ;    0.0292825] 
 # Scales (for hessian or gradient estimation)
-12 1.00000e-04 1.00000e-06
-13 1.00000e-04 1.00000e-06
+12 2.00000e-04 2.00000e-06
+13 3.00000e-04 4.00000e-06
 21 1.00000e-04 1.00000e-06
-23 3.00000e-04 1.00000e-06
+23 3.00000e-04 3.00000e-06
 # Covariance matrix 
 # 121 Var(a12)
 # 122 Cov(b12,a12) Var(b12)
@@ -189,78 +498,92 @@ Parameters, T and confidence intervals
 #212 Cov(b21,a12) Cov(b21,b12) Cov(b21,a13) Cov(b21,b13) Cov(b21,a21) Var(b21)
 #231 Cov(a23,a12) Cov(a23,b12) Cov(a23,a13) Cov(a23,b13) Cov(a23,a21) Cov(a23,b21) Var(a23)
 #232 Cov(b23,a12) Cov(b23,b12) Cov(b23,a13) Cov(b23,b13) Cov(b23,a21) Cov(b23,b21) Cov(b23,a23) Var(b23)
-121 1.10969e-01
-122 -1.33029e-03 1.60415e-05
-131 -5.53768e-02 6.77306e-04 3.02096e-01
-132 6.58106e-04 -8.12775e-06 -3.73026e-03 4.63642e-05
-211 7.59223e-02 -9.02778e-04 2.53226e-02 -3.27358e-04 4.68312e-01
-212 -9.05016e-04 1.08138e-05 -3.15929e-04 4.09141e-06 -5.57262e-03 6.66682e-05
-231 5.24440e-02 -5.95206e-04 -8.93872e-02 1.00357e-03 6.06408e-03 -7.39139e-05 2.47168e-01
-232 -5.95756e-04 6.80630e-06 1.05928e-03 -1.20524e-05 -6.07266e-05 7.34461e-07 -2.80315e-03 3.19737e-05
+121 1.0942155e-01
+122 -1.31211e-03 1.5827559e-05
+131 -5.42260e-02 6.63610e-04 3.0218559e-01
+132 6.46897e-04 -7.99273e-06 -3.73518e-03 4.6465922e-05
+211 8.05586e-02 -9.61087e-04 1.88983e-02 -2.43008e-04 4.8553004e-01
+212 -9.60482e-04 1.15119e-05 -2.38550e-04 3.07513e-06 -5.77598e-03 6.9069819e-05
+231 4.89528e-02 -5.53986e-04 -9.43826e-02 1.06862e-03 -1.83095e-03 2.05848e-05 2.5001784e-01
+232 -5.56252e-04 6.33917e-06 1.11795e-03 -1.28139e-05 2.71734e-05 -3.16845e-07 -2.83579e-03 3.2347405e-05
+# agemin agemax for life expectancy, bage fage (if mle==0 ie no data nor Max likelihood).\r
 begin-prev-date=1/1/1984 end-prev-date=1/6/1988 mov_average=0
-pop_based=0
-prevforecast=0 starting-proj-date=1/1/2000 final-proj-date=1/1/2000 mobil_average=0
-Computing period (stable) prevalence: result on file 'plrbiaspar.txt' 
+pop_based=1
+prevforecast=1 starting-proj-date=1/1/1989 final-proj-date=1/1/2000 mobil_average=0
+#backcast=1 starting-back-date=1/1/1990 final-back-date=1/1/1970 mobil_average=1\r
+# Results model=1+age.\r
+result:  .\r
 
+Computing forward period (stable) prevalence: result on file 'PL_biaspar.txt' 
 #************
-Computing pij: result on file 'pijrbiaspar.txt' 
-Computing standard deviation of one-step probabilities: result on file 'probrbiaspar.txt' 
-Computing matrix of variance covariance of one-step probabilities: result on file 'probcovrbiaspar.txt' 
-and correlation matrix of one-step probabilities: result on file 'probcorrbiaspar.txt' 
-65 13-12 mu 1.5972e-02 2.3367e-02 Var 3.3236e-06 3.1628e-06 cor -0.338 cov -1.0950e-06 Eig 4.341e-06 2.145e-06 1stv 0.733 -0.681 tan -0.929
-70 13-12 mu 2.1166e-02 3.6913e-02 Var 3.1497e-06 4.5213e-06 cor -0.360 cov -1.3581e-06 Eig 5.357e-06 2.314e-06 1stv 0.524 -0.852 tan -1.625
-75 13-12 mu 2.8027e-02 5.8265e-02 Var 2.6312e-06 5.5954e-06 cor -0.404 cov -1.5492e-06 Eig 6.257e-06 1.969e-06 1stv 0.393 -0.920 tan -2.341
-80 13-12 mu 3.7067e-02 9.1858e-02 Var 2.7234e-06 6.5867e-06 cor -0.456 cov -1.9326e-06 Eig 7.387e-06 1.923e-06 1stv 0.383 -0.924 tan -2.413
-85 13-12 mu 4.8930e-02 1.4455e-01 Var 7.0008e-06 1.4795e-05 cor -0.418 cov -4.2498e-06 Eig 1.666e-05 5.132e-06 1stv 0.403 -0.915 tan -2.274
-90 13-12 mu 6.4406e-02 2.2681e-01 Var 2.5605e-05 7.2563e-05 cor -0.359 cov -1.5484e-05 Eig 7.721e-05 2.096e-05 1stv 0.287 -0.958 tan -3.333
-95 13-12 mu 8.4408e-02 3.5434e-01 Var 8.3580e-05 3.5679e-04 cor -0.341 cov -5.8808e-05 Eig 3.689e-04 7.146e-05 1stv 0.202 -0.979 tan -4.852
-65 21-12 mu 2.4815e-01 2.3367e-02 Var 1.5081e-03 3.1628e-06 cor 0.333 cov 2.3009e-05 Eig 1.509e-03 2.811e-06 1stv 1.000 0.015 tan 0.015
-70 21-12 mu 2.0839e-01 3.6913e-02 Var 6.2123e-04 4.5213e-06 cor 0.332 cov 1.7587e-05 Eig 6.217e-04 4.020e-06 1stv 1.000 0.028 tan 0.028
-75 21-12 mu 1.7490e-01 5.8265e-02 Var 2.2058e-04 5.5954e-06 cor 0.326 cov 1.1456e-05 Eig 2.212e-04 4.987e-06 1stv 0.999 0.053 tan 0.053
-80 21-12 mu 1.4670e-01 9.1858e-02 Var 7.0767e-05 6.5867e-06 cor 0.304 cov 6.5593e-06 Eig 7.143e-05 5.923e-06 1stv 0.995 0.101 tan 0.101
-85 21-12 mu 1.2299e-01 1.4455e-01 Var 3.9227e-05 1.4795e-05 cor 0.276 cov 6.6547e-06 Eig 4.092e-05 1.310e-05 1stv 0.969 0.247 tan 0.255
-90 21-12 mu 1.0307e-01 2.2681e-01 Var 5.4893e-05 7.2563e-05 cor 0.289 cov 1.8261e-05 Eig 8.401e-05 4.344e-05 1stv 0.531 0.847 tan 1.595
-95 21-12 mu 8.6343e-02 3.5434e-01 Var 8.2297e-05 3.5679e-04 cor 0.302 cov 5.1723e-05 Eig 3.662e-04 7.287e-05 1stv 0.179 0.984 tan 5.489
-65 23-12 mu 1.3378e-01 2.3367e-02 Var 3.1221e-04 3.1628e-06 cor 0.364 cov 1.1447e-05 Eig 3.126e-04 2.739e-06 1stv 0.999 0.037 tan 0.037
-70 23-12 mu 1.4596e-01 3.6913e-02 Var 2.3686e-04 4.5213e-06 cor 0.388 cov 1.2697e-05 Eig 2.376e-04 3.829e-06 1stv 0.999 0.054 tan 0.054
-75 23-12 mu 1.5914e-01 5.8265e-02 Var 1.6142e-04 5.5954e-06 cor 0.423 cov 1.2709e-05 Eig 1.625e-04 4.566e-06 1stv 0.997 0.081 tan 0.081
-80 23-12 mu 1.7343e-01 9.1858e-02 Var 9.6292e-05 6.5867e-06 cor 0.449 cov 1.1306e-05 Eig 9.769e-05 5.184e-06 1stv 0.992 0.123 tan 0.124
-85 23-12 mu 1.8890e-01 1.4455e-01 Var 5.6832e-05 1.4795e-05 cor 0.356 cov 1.0309e-05 Eig 5.922e-05 1.240e-05 1stv 0.974 0.226 tan 0.232
-90 23-12 mu 2.0566e-01 2.2681e-01 Var 6.4965e-05 7.2563e-05 cor 0.255 cov 1.7485e-05 Eig 8.666e-05 5.087e-05 1stv 0.628 0.779 tan 1.241
-95 23-12 mu 2.2383e-01 3.5434e-01 Var 1.5120e-04 3.5679e-04 cor 0.238 cov 5.5313e-05 Eig 3.707e-04 1.373e-04 1stv 0.244 0.970 tan 3.969
-65 21-13 mu 2.4815e-01 1.5972e-02 Var 1.5081e-03 3.3236e-06 cor 0.047 cov 3.3259e-06 Eig 1.508e-03 3.316e-06 1stv 1.000 0.002 tan 0.002
-70 21-13 mu 2.0839e-01 2.1166e-02 Var 6.2123e-04 3.1497e-06 cor 0.037 cov 1.6580e-06 Eig 6.212e-04 3.145e-06 1stv 1.000 0.003 tan 0.003
-75 21-13 mu 1.7490e-01 2.8027e-02 Var 2.2058e-04 2.6312e-06 cor 0.024 cov 5.6775e-07 Eig 2.206e-04 2.630e-06 1stv 1.000 0.003 tan 0.003
-80 21-13 mu 1.4670e-01 3.7067e-02 Var 7.0767e-05 2.7234e-06 cor 0.024 cov 3.3537e-07 Eig 7.077e-05 2.722e-06 1stv 1.000 0.005 tan 0.005
-85 21-13 mu 1.2299e-01 4.8930e-02 Var 3.9227e-05 7.0008e-06 cor 0.078 cov 1.2860e-06 Eig 3.928e-05 6.950e-06 1stv 0.999 0.040 tan 0.040
-90 21-13 mu 1.0307e-01 6.4406e-02 Var 5.4893e-05 2.5605e-05 cor 0.100 cov 3.7654e-06 Eig 5.537e-05 2.513e-05 1stv 0.992 0.126 tan 0.127
-95 21-13 mu 8.6343e-02 8.4408e-02 Var 8.2297e-05 8.3580e-05 cor 0.097 cov 8.0750e-06 Eig 9.104e-05 7.484e-05 1stv 0.679 0.735 tan 1.083
-65 23-13 mu 1.3378e-01 1.5972e-02 Var 3.1221e-04 3.3236e-06 cor -0.409 cov -1.3182e-05 Eig 3.128e-04 2.762e-06 1stv 0.999 -0.043 tan -0.043
-70 23-13 mu 1.4596e-01 2.1166e-02 Var 2.3686e-04 3.1497e-06 cor -0.453 cov -1.2362e-05 Eig 2.375e-04 2.498e-06 1stv 0.999 -0.053 tan -0.053
-75 23-13 mu 1.5914e-01 2.8027e-02 Var 1.6142e-04 2.6312e-06 cor -0.528 cov -1.0874e-05 Eig 1.622e-04 1.890e-06 1stv 0.998 -0.068 tan -0.068
-80 23-13 mu 1.7343e-01 3.7067e-02 Var 9.6292e-05 2.7234e-06 cor -0.585 cov -9.4784e-06 Eig 9.724e-05 1.773e-06 1stv 0.995 -0.100 tan -0.100
-85 23-13 mu 1.8890e-01 4.8930e-02 Var 5.6832e-05 7.0008e-06 cor -0.513 cov -1.0241e-05 Eig 5.885e-05 4.978e-06 1stv 0.981 -0.194 tan -0.198
-90 23-13 mu 2.0566e-01 6.4406e-02 Var 6.4965e-05 2.5605e-05 cor -0.434 cov -1.7707e-05 Eig 7.176e-05 1.881e-05 1stv 0.934 -0.358 tan -0.384
-95 23-13 mu 2.2383e-01 8.4408e-02 Var 1.5120e-04 8.3580e-05 cor -0.363 cov -4.0852e-05 Eig 1.704e-04 6.436e-05 1stv 0.905 -0.426 tan -0.470
-65 23-21 mu 1.3378e-01 2.4815e-01 Var 3.1221e-04 1.5081e-03 cor -0.015 cov -1.0342e-05 Eig 1.508e-03 3.121e-04 1stv 0.009 -1.000 tan -115.645
-70 23-21 mu 1.4596e-01 2.0839e-01 Var 2.3686e-04 6.2123e-04 cor -0.013 cov -4.8257e-06 Eig 6.213e-04 2.368e-04 1stv 0.013 -1.000 tan -79.662
-75 23-21 mu 1.5914e-01 1.7490e-01 Var 1.6142e-04 2.2058e-04 cor -0.014 cov -2.7177e-06 Eig 2.207e-04 1.613e-04 1stv 0.046 -0.999 tan -21.813
-80 23-21 mu 1.7343e-01 1.4670e-01 Var 9.6292e-05 7.0767e-05 cor -0.029 cov -2.3931e-06 Eig 9.651e-05 7.054e-05 1stv 0.996 -0.093 tan -0.093
-85 23-21 mu 1.8890e-01 1.2299e-01 Var 5.6832e-05 3.9227e-05 cor -0.061 cov -2.8869e-06 Eig 5.729e-05 3.877e-05 1stv 0.987 -0.158 tan -0.160
-90 23-21 mu 2.0566e-01 1.0307e-01 Var 6.4965e-05 5.4893e-05 cor -0.062 cov -3.6726e-06 Eig 6.616e-05 5.370e-05 1stv 0.951 -0.310 tan -0.326
-95 23-21 mu 2.2383e-01 8.6343e-02 Var 1.5120e-04 8.2297e-05 cor -0.040 cov -4.5038e-06 Eig 1.515e-04 8.200e-05 1stv 0.998 -0.065 tan -0.065
-Computing Health Expectancies: result on file 'erbiaspar.txt' 
-65|66|67|68|69|70|71|72|73|74|75|76|77|78|79|80|81|82|83|84|85|86|87|88|89|90|91|92|93|94|95|
-Computing Total Life expectancies with their standard errors: file 'trbiaspar.txt' 
-Computing Health Expectancies and standard errors: result on file 'stderbiaspar.txt' 
-Computing Covar. of Health Expectancies: result on file 'cverbiaspar.txt' 
-Computing Variance-covariance of DFLEs: file 'vrbiaspar.txt' 
-65|66|67|68|69|70|71|72|73|74|75|76|77|78|79|80|81|82|83|84|85|86|87|88|89|90|91|92|93|94|95|
-Computing total mortality p.j=w1*p1j+w2*p2j+..: result on file 'prmorprev1-stablbased-rbiaspar.txt' 
-End of Imach
-Local time at start Tue Aug 18 18:20:44 2015
+Computing pij: result on file 'PIJ_biaspar.txt' 
+Computing standard deviation of one-step probabilities: result on file 'PROB_rbiaspar.txt' 
+Computing matrix of variance covariance of one-step probabilities: result on file 'PROBCOV_biaspar.txt' 
+and correlation matrix of one-step probabilities: result on file 'PROBCOR_biaspar.txt' 
+70 13-12 mu 2.1400e-02 3.6166e-02 Var 3.1732e-06 4.2735e-06 cor -0.351 cov -1.2918e-06 Eig 5.127e-06 2.319e-06 1stv 0.551 -0.834 tan -1.513
+75 13-12 mu 2.8084e-02 5.7475e-02 Var 2.5817e-06 5.3630e-06 cor -0.393 cov -1.4626e-06 Eig 5.991e-06 1.954e-06 1stv 0.394 -0.919 tan -2.331
+80 13-12 mu 3.6812e-02 9.1225e-02 Var 2.6231e-06 6.4219e-06 cor -0.446 cov -1.8300e-06 Eig 7.160e-06 1.885e-06 1stv 0.374 -0.927 tan -2.479
+85 13-12 mu 4.8162e-02 1.4452e-01 Var 6.7559e-06 1.4710e-05 cor -0.413 cov -4.1154e-06 Eig 1.646e-05 5.010e-06 1stv 0.391 -0.921 tan -2.357
+90 13-12 mu 6.2827e-02 2.2829e-01 Var 2.4481e-05 7.3017e-05 cor -0.358 cov -1.5149e-05 Eig 7.736e-05 2.014e-05 1stv 0.275 -0.961 tan -3.490
+95 13-12 mu 8.1592e-02 3.5900e-01 Var 7.8620e-05 3.6276e-04 cor -0.340 cov -5.7431e-05 Eig 3.739e-04 6.745e-05 1stv 0.191 -0.982 tan -5.142
+70 21-12 mu 2.0469e-01 3.6166e-02 Var 6.2086e-04 4.2735e-06 cor 0.342 cov 1.7621e-05 Eig 6.214e-04 3.770e-06 1stv 1.000 0.029 tan 0.029
+75 21-12 mu 1.7304e-01 5.7475e-02 Var 2.2257e-04 5.3630e-06 cor 0.332 cov 1.1485e-05 Eig 2.232e-04 4.757e-06 1stv 0.999 0.053 tan 0.053
+80 21-12 mu 1.4621e-01 9.1225e-02 Var 7.1363e-05 6.4219e-06 cor 0.305 cov 6.5203e-06 Eig 7.201e-05 5.774e-06 1stv 0.995 0.099 tan 0.099
+85 21-12 mu 1.2348e-01 1.4452e-01 Var 3.9495e-05 1.4710e-05 cor 0.283 cov 6.8331e-06 Eig 4.125e-05 1.295e-05 1stv 0.968 0.249 tan 0.257
+90 21-12 mu 1.0424e-01 2.2829e-01 Var 5.6829e-05 7.3017e-05 cor 0.307 cov 1.9770e-05 Eig 8.629e-05 4.356e-05 1stv 0.557 0.830 tan 1.490
+95 21-12 mu 8.7961e-02 3.5900e-01 Var 8.7335e-05 3.6276e-04 cor 0.322 cov 5.7307e-05 Eig 3.742e-04 7.589e-05 1stv 0.196 0.981 tan 5.006
+70 23-12 mu 1.4061e-01 3.6166e-02 Var 2.2238e-04 4.2735e-06 cor 0.368 cov 1.1339e-05 Eig 2.230e-04 3.686e-06 1stv 0.999 0.052 tan 0.052
+75 23-12 mu 1.5420e-01 5.7475e-02 Var 1.5306e-04 5.3630e-06 cor 0.405 cov 1.1590e-05 Eig 1.540e-04 4.459e-06 1stv 0.997 0.078 tan 0.078
+80 23-12 mu 1.6900e-01 9.1225e-02 Var 9.2084e-05 6.4219e-06 cor 0.436 cov 1.0600e-05 Eig 9.338e-05 5.130e-06 1stv 0.993 0.121 tan 0.122
+85 23-12 mu 1.8515e-01 1.4452e-01 Var 5.4682e-05 1.4710e-05 cor 0.352 cov 9.9793e-06 Eig 5.704e-05 1.236e-05 1stv 0.973 0.229 tan 0.236
+90 23-12 mu 2.0275e-01 2.2829e-01 Var 6.3261e-05 7.3017e-05 cor 0.249 cov 1.6893e-05 Eig 8.572e-05 5.056e-05 1stv 0.601 0.799 tan 1.330
+95 23-12 mu 2.2194e-01 3.5900e-01 Var 1.4978e-04 3.6276e-04 cor 0.226 cov 5.2587e-05 Eig 3.750e-04 1.375e-04 1stv 0.227 0.974 tan 4.283
+70 21-13 mu 2.0469e-01 2.1400e-02 Var 6.2086e-04 3.1732e-06 cor 0.029 cov 1.2856e-06 Eig 6.209e-04 3.170e-06 1stv 1.000 0.002 tan 0.002
+75 21-13 mu 1.7304e-01 2.8084e-02 Var 2.2257e-04 2.5817e-06 cor 0.021 cov 5.0493e-07 Eig 2.226e-04 2.581e-06 1stv 1.000 0.002 tan 0.002
+80 21-13 mu 1.4621e-01 3.6812e-02 Var 7.1363e-05 2.6231e-06 cor 0.028 cov 3.7993e-07 Eig 7.137e-05 2.621e-06 1stv 1.000 0.006 tan 0.006
+85 21-13 mu 1.2348e-01 4.8162e-02 Var 3.9495e-05 6.7559e-06 cor 0.070 cov 1.1505e-06 Eig 3.954e-05 6.715e-06 1stv 0.999 0.035 tan 0.035
+90 21-13 mu 1.0424e-01 6.2827e-02 Var 5.6829e-05 2.4481e-05 cor 0.082 cov 3.0607e-06 Eig 5.712e-05 2.419e-05 1stv 0.996 0.093 tan 0.094
+95 21-13 mu 8.7961e-02 8.1592e-02 Var 8.7335e-05 7.8620e-05 cor 0.076 cov 6.2933e-06 Eig 9.063e-05 7.532e-05 1stv 0.886 0.464 tan 0.524
+70 23-13 mu 1.4061e-01 2.1400e-02 Var 2.2238e-04 3.1732e-06 cor -0.461 cov -1.2236e-05 Eig 2.231e-04 2.492e-06 1stv 0.998 -0.056 tan -0.056
+75 23-13 mu 1.5420e-01 2.8084e-02 Var 1.5306e-04 2.5817e-06 cor -0.531 cov -1.0558e-05 Eig 1.538e-04 1.845e-06 1stv 0.998 -0.070 tan -0.070
+80 23-13 mu 1.6900e-01 3.6812e-02 Var 9.2084e-05 2.6231e-06 cor -0.579 cov -9.0014e-06 Eig 9.298e-05 1.726e-06 1stv 0.995 -0.099 tan -0.100
+85 23-13 mu 1.8515e-01 4.8162e-02 Var 5.4682e-05 6.7559e-06 cor -0.506 cov -9.7162e-06 Eig 5.658e-05 4.861e-06 1stv 0.982 -0.191 tan -0.195
+90 23-13 mu 2.0275e-01 6.2827e-02 Var 6.3261e-05 2.4481e-05 cor -0.442 cov -1.7380e-05 Eig 6.991e-05 1.783e-05 1stv 0.934 -0.357 tan -0.383
+95 23-13 mu 2.2194e-01 8.1592e-02 Var 1.4978e-04 7.8620e-05 cor -0.379 cov -4.1150e-05 Eig 1.686e-04 5.980e-05 1stv 0.909 -0.416 tan -0.457
+70 23-21 mu 1.4061e-01 2.0469e-01 Var 2.2238e-04 6.2086e-04 cor -0.033 cov -1.2366e-05 Eig 6.212e-04 2.220e-04 1stv 0.031 -1.000 tan -32.254
+75 23-21 mu 1.5420e-01 1.7304e-01 Var 1.5306e-04 2.2257e-04 cor -0.032 cov -5.9497e-06 Eig 2.231e-04 1.526e-04 1stv 0.085 -0.996 tan -11.767
+80 23-21 mu 1.6900e-01 1.4621e-01 Var 9.2084e-05 7.1363e-05 cor -0.038 cov -3.0714e-06 Eig 9.253e-05 7.092e-05 1stv 0.990 -0.144 tan -0.145
+85 23-21 mu 1.8515e-01 1.2348e-01 Var 5.4682e-05 3.9495e-05 cor -0.055 cov -2.5387e-06 Eig 5.510e-05 3.908e-05 1stv 0.987 -0.161 tan -0.163
+90 23-21 mu 2.0275e-01 1.0424e-01 Var 6.3261e-05 5.6829e-05 cor -0.060 cov -3.5686e-06 Eig 6.485e-05 5.524e-05 1stv 0.914 -0.407 tan -0.445
+95 23-21 mu 2.2194e-01 8.7961e-02 Var 1.4978e-04 8.7335e-05 cor -0.050 cov -5.6628e-06 Eig 1.503e-04 8.683e-05 1stv 0.996 -0.090 tan -0.090
+Prevalence combination of varying and fixed dummies 1
+
+Computing forecasting: result on file 'F_biaspar.txt', please wait... 
+End of Computing forecasting
+Computing Health Expectancies: result on file 'E_biaspar.txt' ...70|71|72|73|74|75|76|77|78|79|80|81|82|83|84|85|86|87|88|89|90|91|92|93|94|95|
+done evsij
+Computing Total Life expectancies with their standard errors: file 'T_biaspar.txt' ...
+  Computing State-specific Expectancies and standard errors: result on file 'STDE_biaspar.txt' 
+    Computing Covar. of State-specific Expectancies: result on file 'CVE_biaspar.txt' 
+      Computing Variance-covariance of State-specific Expectancies: file 'V_biaspar.txt' ... 
+#****** Result for:******
+ cvevsij 70|71|72|73|74|75|76|77|78|79|80|81|82|83|84|85|86|87|88|89|90|91|92|93|94|95|
+ end cvevsij 
+ varevsij vpopbased=0 
+Computing total mortality p.j=w1*p1j+w2*p2j+..: result on file 'PRMORPREV-1-STABLBASED_biaspar.txt' 
+Computing age specific forward period (stable) prevalences in each health state 
+varevsij vpopbased=1 
+Computing total mortality p.j=w1*p1j+w2*p2j+..: result on file 'PRMORPREV-1-POPULBASED-NOMOBIL_biaspar.txt' 
+Computing age specific forward period (stable) prevalences in each health state 
+done selection
+done State-specific expectancies
+Computing Variance-covariance of forward period (stable) prevalence: file 'VPL_biaspar.txt' ...
+#****** ******
+done variance-covariance of forward period prevalence
+End of Imach with 14 errors and/or warnings 31. Please look at the log file for details.
+Local time at start Wed May 22 22:32:36 2019
 
-Local time at end   Tue Aug 18 18:26:33 2015
+Local time at end   Wed May 22 22:34:09 2019
 
-Total time used 0 day(s) 0 hour(s) 5 minute(s) 49 second(s)
-Total time was 349 Sec.
+Total time used 0 day(s) 0 hour(s) 1 minute(s) 33 second(s)
+Total time was 93 Sec.
index e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391..7173572b952b02f9861e86043e02e7b01a512bb1 100644 (file)
@@ -0,0 +1,47 @@
+#IMaCh 0.99r19
+#0.99r10\r
+#Number of iterations & function calls = 33 & 6007, -2 Log likelihood = 46617.105944307616\r
+title=1st_example datafile=data1.txt lastobs=8600 firstpass=1 lastpass=4
+ftol=1.000000e-08 stepm=1 ncovcol=2 nqv=0 ntv=0 nqtv=0 nlstate=2 ndeath=1 maxwav=4 mle=0 weight=0
+model=1+age+
+#Number of iterations & function calls = 2 & 425, -2 Log likelihood = 46617.105944307536
+# Parameters nlstate*nlstate*ncov a12*1 + b12 * age + ...
+12  -12.3175784    0.0931122 
+13  -10.1631705    0.0548384 
+21   -1.6685685   -0.0339056 
+23   -5.6869199    0.0181350 
+# Scales (for hessian or gradient estimation)
+12 2.00000e-04 2.00000e-06
+13 3.00000e-04 4.00000e-06
+21 1.00000e-04 1.00000e-06
+23 3.00000e-04 3.00000e-06
+# Covariance matrix 
+# 121 Var(a12)
+# 122 Cov(b12,a12) Var(b12)
+#   ...
+# 232 Cov(b23,a12)  Cov(b23,b12) ... Var (b23)
+#121 Var(a12)
+#122 Cov(b12,a12) Var(b12)
+#131 Cov(a13,a12) Cov(a13,b12) Var(a13)
+#132 Cov(b13,a12) Cov(b13,b12) Cov(b13,a13) Var(b13)
+#211 Cov(a21,a12) Cov(a21,b12) Cov(a21,a13) Cov(a21,b13) Var(a21)
+#212 Cov(b21,a12) Cov(b21,b12) Cov(b21,a13) Cov(b21,b13) Cov(b21,a21) Var(b21)
+#231 Cov(a23,a12) Cov(a23,b12) Cov(a23,a13) Cov(a23,b13) Cov(a23,a21) Cov(a23,b21) Var(a23)
+#232 Cov(b23,a12) Cov(b23,b12) Cov(b23,a13) Cov(b23,b13) Cov(b23,a21) Cov(b23,b21) Cov(b23,a23) Var(b23)
+121 1.0942155e-01
+122 -1.31211e-03 1.5827559e-05
+131 -5.42260e-02 6.63610e-04 3.0218559e-01
+132 6.46897e-04 -7.99273e-06 -3.73518e-03 4.6465922e-05
+211 8.05586e-02 -9.61087e-04 1.88983e-02 -2.43008e-04 4.8553004e-01
+212 -9.60482e-04 1.15119e-05 -2.38550e-04 3.07513e-06 -5.77598e-03 6.9069819e-05
+231 4.89528e-02 -5.53986e-04 -9.43826e-02 1.06862e-03 -1.83095e-03 2.05848e-05 2.5001784e-01
+232 -5.56252e-04 6.33917e-06 1.11795e-03 -1.28139e-05 2.71734e-05 -3.16845e-07 -2.83579e-03 3.2347405e-05
+# agemin agemax for life expectancy, bage fage (if mle==0 ie no data nor Max likelihood).\r
+# agemin agemax for life expectancy, bage fage (if mle==0 ie no data nor Max likelihood).
+agemin=70 agemax=95 bage=70 fage=95 estepm=1 ftolpl=6.000000e-04
+begin-prev-date=1/1/1984 end-prev-date=1/6/1988 mov_average=0
+pop_based=1
+prevforecast=1 starting-proj-date=1/1/1989 final-proj-date=1/1/2000 mobil_average=0
+#backcast=1 starting-back-date=1/1/1990 final-back-date=1/1/1970 mobil_average=1\r
+# Results model=1+age.\r
+result:  .\r